Detalles de la búsqueda
1.
Reactive Docking: A Computational Method for High-Throughput Virtual Screenings of Reactive Species.
J Chem Inf Model
; 63(17): 5631-5640, 2023 09 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37639635
2.
Ringtail: A Python Tool for Efficient Management and Storage of Virtual Screening Results.
J Chem Inf Model
; 63(7): 1858-1864, 2023 04 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36976961
3.
SuFEx-enabled, agnostic discovery of covalent inhibitors of human neutrophil elastase.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(38): 18808-18814, 2019 09 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31484779
4.
Benchmarking the Performance of Irregular Computations in AutoDock-GPU Molecular Docking.
Parallel Comput
; 1092022 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34898769
5.
AutoDock Vina 1.2.0: New Docking Methods, Expanded Force Field, and Python Bindings.
J Chem Inf Model
; 61(8): 3891-3898, 2021 08 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34278794
6.
Structural basis for the stabilization of amyloidogenic immunoglobulin light chains by hydantoins.
Bioorg Med Chem Lett
; 30(16): 127356, 2020 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32631553
7.
Initial Analysis of the Arylomycin D Antibiotics.
J Nat Prod
; 83(7): 2112-2121, 2020 07 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32614583
8.
D3R Grand Challenge 4: prospective pose prediction of BACE1 ligands with AutoDock-GPU.
J Comput Aided Mol Des
; 33(12): 1071-1081, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31691920
9.
Comparison of affinity ranking using AutoDock-GPU and MM-GBSA scores for BACE-1 inhibitors in the D3R Grand Challenge 4.
J Comput Aided Mol Des
; 33(12): 1011-1020, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31691919
10.
Cholesterol Biosynthesis: A Mechanistic Overview.
Biochemistry
; 55(39): 5483-5506, 2016 Oct 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27604037
11.
Interaction with specific HSP90 residues as a scoring function: validation in the D3R Grand Challenge 2015.
J Comput Aided Mol Des
; 30(9): 731-742, 2016 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27549813
12.
Calculation of distribution coefficients in the SAMPL5 challenge from atomic solvation parameters and surface areas.
J Comput Aided Mol Des
; 30(11): 1079-1086, 2016 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27585473
13.
Receptor-based virtual screening protocol for drug discovery.
Arch Biochem Biophys
; 582: 56-67, 2015 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26045247
14.
AutoDock4(Zn): an improved AutoDock force field for small-molecule docking to zinc metalloproteins.
J Chem Inf Model
; 54(8): 2371-9, 2014 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24931227
15.
IP6 and PF74 affect HIV-1 Capsid Stability through Modulation of Hexamer-Hexamer Tilt Angle Preference.
bioRxiv
; 2024 Mar 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38559213
16.
Performance evaluation of flexible macrocycle docking in AutoDock.
QRB Discov
; 3: e18, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37529284
17.
Accelerating AutoDock4 with GPUs and Gradient-Based Local Search.
J Chem Theory Comput
; 17(2): 1060-1073, 2021 Feb 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33403848
18.
Discovery of Potent Coumarin-Based Kinetic Stabilizers of Amyloidogenic Immunoglobulin Light Chains Using Structure-Based Design.
J Med Chem
; 64(9): 6273-6299, 2021 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33939422
19.
COVID 19 repercussions in ophthalmology: a narrative review.
Sao Paulo Med J
; 139(5): 535-542, 2021.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34378743
20.
Charting Hydrogen Bond Anisotropy.
J Chem Theory Comput
; 16(4): 2846-2856, 2020 Apr 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32105473