Detalles de la búsqueda
1.
Strelka2: fast and accurate calling of germline and somatic variants.
Nat Methods
; 15(8): 591-594, 2018 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30013048
2.
ExpansionHunter: a sequence-graph-based tool to analyze variation in short tandem repeat regions.
Bioinformatics
; 35(22): 4754-4756, 2019 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31134279
3.
Social and Genetic Networks of HIV-1 Transmission in New York City.
PLoS Pathog
; 13(1): e1006000, 2017 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28068413
4.
A molecular transmission network of recent hepatitis C infection in people with and without HIV: Implications for targeted treatment strategies.
J Viral Hepat
; 24(5): 404-411, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27882678
5.
Using HIV Sequence and Epidemiologic Data to Assess the Effect of Self-referral Testing for Acute HIV Infection on Incident Diagnoses in San Diego, California.
Clin Infect Dis
; 63(1): 101-107, 2016 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27174704
6.
RELAX: detecting relaxed selection in a phylogenetic framework.
Mol Biol Evol
; 32(3): 820-32, 2015 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25540451
7.
Less is more: an adaptive branch-site random effects model for efficient detection of episodic diversifying selection.
Mol Biol Evol
; 32(5): 1342-53, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25697341
8.
Gene-wide identification of episodic selection.
Mol Biol Evol
; 32(5): 1365-71, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25701167
9.
Comprehensive sieve analysis of breakthrough HIV-1 sequences in the RV144 vaccine efficacy trial.
PLoS Comput Biol
; 11(2): e1003973, 2015 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25646817
10.
Evolutionary origins of human herpes simplex viruses 1 and 2.
Mol Biol Evol
; 31(9): 2356-64, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24916030
11.
IDEPI: rapid prediction of HIV-1 antibody epitopes and other phenotypic features from sequence data using a flexible machine learning platform.
PLoS Comput Biol
; 10(9): e1003842, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25254639
12.
Detecting individual sites subject to episodic diversifying selection.
PLoS Genet
; 8(7): e1002764, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22807683
13.
FUBAR: a fast, unconstrained bayesian approximation for inferring selection.
Mol Biol Evol
; 30(5): 1196-205, 2013 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23420840
14.
Solving the MPI reconstruction problem with automatically tuned regularization parameters.
Phys Med Biol
; 69(4)2024 Feb 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38266288
15.
Deep sequencing reveals minor protease resistance mutations in patients failing a protease inhibitor regimen.
J Virol
; 86(11): 6231-7, 2012 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22457522
16.
Modeling HIV-1 drug resistance as episodic directional selection.
PLoS Comput Biol
; 8(5): e1002507, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22589711
17.
Extrapolation of System Matrices in Magnetic Particle Imaging.
IEEE Trans Med Imaging
; 42(4): 1121-1132, 2023 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36417740
18.
Optimization of magnetic nanoparticles for engineering erythrocytes as theranostic agents.
Biomater Sci
; 11(9): 3252-3268, 2023 May 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36939172
19.
A random effects branch-site model for detecting episodic diversifying selection.
Mol Biol Evol
; 28(11): 3033-43, 2011 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21670087
20.
Particle interactions and their effect on magnetic particle spectroscopy and imaging.
Nanoscale
; 14(19): 7163-7173, 2022 May 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35343985