Detalles de la búsqueda
1.
Interpretable deep learning for chromatin-informed inference of transcriptional programs driven by somatic alterations across cancers.
Nucleic Acids Res
; 50(19): 10869-10881, 2022 10 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36243974
2.
Reconstructing tumor clonal lineage trees incorporating single-nucleotide variants, copy number alterations and structural variations.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i125-i133, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758777
3.
Semi-deconvolution of bulk and single-cell RNA-seq data with application to metastatic progression in breast cancer.
Bioinformatics
; 38(Suppl 1): i386-i394, 2022 06 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758822
4.
The evolution of tumour phylogenetics: principles and practice.
Nat Rev Genet
; 18(4): 213-229, 2017 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28190876
5.
Tumor heterogeneity assessed by sequencing and fluorescence in situ hybridization (FISH) data.
Bioinformatics
; 37(24): 4704-4711, 2021 12 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34289030
6.
Assessing the contribution of tumor mutational phenotypes to cancer progression risk.
PLoS Comput Biol
; 17(3): e1008777, 2021 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33711014
7.
Robust and accurate deconvolution of tumor populations uncovers evolutionary mechanisms of breast cancer metastasis.
Bioinformatics
; 36(Suppl_1): i407-i416, 2020 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32657393
8.
Reasons to go for Rezum steam therapy: an effective and durable outpatient minimally invasive procedure.
World J Urol
; 39(7): 2307-2313, 2021 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32968851
9.
Reasons to overthrow TURP: bring on Aquablation.
World J Urol
; 39(7): 2291-2299, 2021 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32740805
10.
Detectable Prostate-specific antigen value between 0.01 and 0.1 ng/ml following robotic-assisted radical prostatectomy (RARP): does it correlate with future biochemical recurrence?
World J Urol
; 39(6): 1853-1860, 2021 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32696130
11.
Reasons to believe in vaporization: a review of the benefits of photo-selective and transurethral vaporization.
World J Urol
; 39(7): 2263-2268, 2021 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32930847
12.
Deconvolution and phylogeny inference of structural variations in tumor genomic samples.
Bioinformatics
; 34(13): i357-i365, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29950001
13.
Ten simple rules for writing a PLOS Computational Biology quick tips article.
PLoS Comput Biol
; 19(12): e1011689, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38127824
14.
The development and application of bioinformatics core competencies to improve bioinformatics training and education.
PLoS Comput Biol
; 14(2): e1005772, 2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29390004
15.
Aneuploidy, TP53 mutation, and amplification of MYC correlate with increased intratumor heterogeneity and poor prognosis of breast cancer patients.
Genes Chromosomes Cancer
; 57(4): 165-175, 2018 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29181861
16.
The evolution of single cell-derived colorectal cancer cell lines is dominated by the continued selection of tumor-specific genomic imbalances, despite random chromosomal instability.
Carcinogenesis
; 39(8): 993-1005, 2018 07 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29800151
17.
Automated deconvolution of structured mixtures from heterogeneous tumor genomic data.
PLoS Comput Biol
; 13(10): e1005815, 2017 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29059177
18.
Quantitative computational models of molecular self-assembly in systems biology.
Phys Biol
; 14(3): 035003, 2017 05 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28535149
19.
Medoidshift clustering applied to genomic bulk tumor data.
BMC Genomics
; 17 Suppl 1: 6, 2016 Jan 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26817708
20.
Phylogenetic analysis of multiple FISH markers in oral tongue squamous cell carcinoma suggests that a diverse distribution of copy number changes is associated with poor prognosis.
Int J Cancer
; 138(1): 98-109, 2016 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26175310