Detalles de la búsqueda
1.
HProteome-BSite: predicted binding sites and ligands in human 3D proteome.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D403-D408, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36243970
2.
Ebastine impairs metastatic spread in triple-negative breast cancer by targeting focal adhesion kinase.
Cell Mol Life Sci
; 80(5): 132, 2023 Apr 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37185776
3.
A pGpG-specific phosphodiesterase regulates cyclic di-GMP signaling in Vibrio cholerae.
J Biol Chem
; 298(3): 101626, 2022 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35074425
4.
Atomic-level thermodynamics analysis of the binding free energy of SARS-CoV-2 neutralizing antibodies.
Proteins
; 91(5): 694-704, 2023 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36564921
5.
Benchmarking applicability of medium-resolution cryo-EM protein structures for structure-based drug design.
J Comput Chem
; 44(14): 1360-1368, 2023 05 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36847771
6.
GalaxyDock2-HEME: Protein-ligand docking for heme proteins.
J Comput Chem
; 44(14): 1369-1380, 2023 05 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36809651
7.
GalaxyHeteromer: protein heterodimer structure prediction by template-based and ab initio docking.
Nucleic Acids Res
; 49(W1): W237-W241, 2021 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34048578
8.
GalaxyWater-CNN: Prediction of Water Positions on the Protein Structure by a 3D-Convolutional Neural Network.
J Chem Inf Model
; 62(13): 3157-3168, 2022 07 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35749367
9.
Assessment of protein model structure accuracy estimation in CASP14: Old and new challenges.
Proteins
; 89(12): 1940-1948, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34324227
10.
Protein oligomer structure prediction using GALAXY in CASP14.
Proteins
; 89(12): 1844-1851, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34363243
11.
Modeling SARS-CoV-2 proteins in the CASP-commons experiment.
Proteins
; 89(12): 1987-1996, 2021 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34462960
12.
GalaxyWater-wKGB: Prediction of Water Positions on Protein Structure Using wKGB Statistical Potential.
J Chem Inf Model
; 61(5): 2283-2293, 2021 05 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33938216
13.
GalaxyRefine2: simultaneous refinement of inaccurate local regions and overall protein structure.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W451-W455, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31001635
14.
Biophysical and functional characterization of Norrin signaling through Frizzled4.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 115(35): 8787-8792, 2018 08 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30104375
15.
Structure prediction of biological assemblies using GALAXY in CAPRI rounds 38-45.
Proteins
; 88(8): 1009-1017, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31774573
16.
Prediction of Molecular Electronic Transitions Using Random Forests.
J Chem Inf Model
; 60(12): 5984-5994, 2020 12 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33090804
17.
GalaxySagittarius: Structure- and Similarity-Based Prediction of Protein Targets for Druglike Compounds.
J Chem Inf Model
; 60(6): 3246-3254, 2020 06 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32401021
18.
Assessment of protein model structure accuracy estimation in CASP13: Challenges in the era of deep learning.
Proteins
; 87(12): 1351-1360, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31436360
19.
Prediction of protein oligomer structures using GALAXY in CASP13.
Proteins
; 87(12): 1233-1240, 2019 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31509276
20.
GalaxyDock3: Protein-ligand docking that considers the full ligand conformational flexibility.
J Comput Chem
; 40(31): 2739-2748, 2019 12 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31423613