Detalles de la búsqueda
1.
4D Genome Rewiring during Oncogene-Induced and Replicative Senescence.
Mol Cell
; 78(3): 522-538.e9, 2020 05 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32220303
2.
STAG2 loss-of-function affects short-range genomic contacts and modulates the basal-luminal transcriptional program of bladder cancer cells.
Nucleic Acids Res
; 49(19): 11005-11021, 2021 11 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34648034
3.
Distinct structural transitions of chromatin topological domains correlate with coordinated hormone-induced gene regulation.
Genes Dev
; 28(19): 2151-62, 2014 Oct 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25274727
4.
Automatic analysis and 3D-modelling of Hi-C data using TADbit reveals structural features of the fly chromatin colors.
PLoS Comput Biol
; 13(7): e1005665, 2017 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28723903
5.
ETE 3: Reconstruction, Analysis, and Visualization of Phylogenomic Data.
Mol Biol Evol
; 33(6): 1635-8, 2016 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26921390
6.
Assessing the limits of restraint-based 3D modeling of genomes and genomic domains.
Nucleic Acids Res
; 43(7): 3465-77, 2015 Apr 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25800747
7.
Selective constraints on protamine 2 in primates and rodents.
BMC Evol Biol
; 16: 21, 2016 Jan 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26801756
8.
p53 rapidly restructures 3D chromatin organization to trigger a transcriptional response.
Nat Commun
; 15(1): 2821, 2024 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38561401
9.
Phylemon 2.0: a suite of web-tools for molecular evolution, phylogenetics, phylogenomics and hypotheses testing.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W470-4, 2011 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21646336
10.
Low input capture Hi-C (liCHi-C) identifies promoter-enhancer interactions at high-resolution.
Nat Commun
; 14(1): 268, 2023 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36650138
11.
The PENGUIN approach to reconstruct protein interactions at enhancer-promoter regions and its application to prostate cancer.
Nat Commun
; 14(1): 8084, 2023 Dec 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38057321
12.
Role of tomato BRANCHED1-like genes in the control of shoot branching.
Plant J
; 67(4): 701-14, 2011 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21554455
13.
Evolution of the biosynthesis of di-myo-inositol phosphate, a marker of adaptation to hot marine environments.
Environ Microbiol
; 14(3): 691-701, 2012 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22026421
14.
Natural selection on functional modules, a genome-wide analysis.
PLoS Comput Biol
; 7(3): e1001093, 2011 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21390268
15.
Identification of chromatin loops from Hi-C interaction matrices by CTCF-CTCF topology classification.
NAR Genom Bioinform
; 4(1): lqac021, 2022 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35274099
16.
Recent human evolution has shaped geographical differences in susceptibility to disease.
BMC Genomics
; 12: 55, 2011 Jan 24.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21261943
17.
Analysis, Modeling, and Visualization of Chromosome Conformation Capture Experiments.
Methods Mol Biol
; 2157: 35-63, 2021.
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| MEDLINE | ID: mdl-32820398
18.
Transcriptional activation during cell reprogramming correlates with the formation of 3D open chromatin hubs.
Nat Commun
; 11(1): 2564, 2020 05 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32444798
19.
Transcription factors orchestrate dynamic interplay between genome topology and gene regulation during cell reprogramming.
Nat Genet
; 50(2): 238-249, 2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29335546
20.
The reference epigenome and regulatory chromatin landscape of chronic lymphocytic leukemia.
Nat Med
; 24(6): 868-880, 2018 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29785028