Detalles de la búsqueda
1.
Detection of transcriptional triggers in the dynamics of microbial growth: application to the respiratorily versatile bacterium Shewanella oneidensis.
Nucleic Acids Res
; 40(15): 7132-49, 2012 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22638572
2.
Draft genome sequence of Methanocalculus natronophilus sp. strain Z-7105T, an alkaliphilic, methanogenic archaeon isolated from a soda lake.
Microbiol Resour Announc
; : e0035024, 2024 Jun 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38832796
3.
Microbial eukaryotic predation pressure and biomass at deep-sea hydrothermal vents.
ISME J
; 18(1)2024 Jan 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38366040
4.
Comparative systems biology across an evolutionary gradient within the Shewanella genus.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 106(37): 15909-14, 2009 Sep 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19805231
5.
Large-scale comparative phenotypic and genomic analyses reveal ecological preferences of shewanella species and identify metabolic pathways conserved at the genus level.
Appl Environ Microbiol
; 77(15): 5352-60, 2011 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21642407
6.
Draft Genome Sequence of Desulfurobacterium sp. Strain AV08, a Thermophilic Chemolithoautotroph Isolated from a Deep-Sea Hydrothermal Vent.
Microbiol Resour Announc
; 10(34): e0061521, 2021 Aug 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34435861
7.
Conserved synteny at the protein family level reveals genes underlying Shewanella species' cold tolerance and predicts their novel phenotypes.
Funct Integr Genomics
; 10(1): 97-110, 2010 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19802638
8.
Protein families reflect the metabolic diversity of organisms and provide support for functional prediction.
Physiol Genomics
; 38(3): 250-60, 2009 Aug 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19491149
9.
Escherichia coli K-12: a cooperatively developed annotation snapshot--2005.
Nucleic Acids Res
; 34(1): 1-9, 2006.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16397293
10.
Identification of diverse carbon utilization pathways in Shewanella oneidensis MR-1 via expression profiling.
Genome Inform
; 18: 287-98, 2007.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18546496
11.
GenProtEC: an updated and improved analysis of functions of Escherichia coli K-12 proteins.
Nucleic Acids Res
; 32(Database issue): D300-2, 2004 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-14681418
12.
Gene fusions and gene duplications: relevance to genomic annotation and functional analysis.
BMC Genomics
; 6: 33, 2005 Mar 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15757509
13.
Structural domains, protein modules, and sequence similarities enrich our understanding of the Shewanella oneidensis MR-1 proteome.
OMICS
; 8(4): 306-21, 2004.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15703478
14.
Comparisons of Shewanella strains based on genome annotations, modeling, and experiments.
BMC Syst Biol
; 8: 31, 2014 Mar 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24621294
15.
Live cell chemical profiling of temporal redox dynamics in a photoautotrophic cyanobacterium.
ACS Chem Biol
; 9(1): 291-300, 2014 Jan 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24168666
16.
Changes in translational efficiency is a dominant regulatory mechanism in the environmental response of bacteria.
Integr Biol (Camb)
; 5(11): 1393-406, 2013 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24081429
17.
Shewanella knowledgebase: integration of the experimental data and computational predictions suggests a biological role for transcription of intergenic regions.
Database (Oxford)
; 2010: baq012, 2010 Jul 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20627862
18.
Evolution by leaps: gene duplication in bacteria.
Biol Direct
; 4: 46, 2009 Nov 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19930658
19.
Towards environmental systems biology of Shewanella.
Nat Rev Microbiol
; 6(8): 592-603, 2008 Aug.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18604222
20.
Genomic analysis of carbon source metabolism of Shewanella oneidensis MR-1: Predictions versus experiments.
J Bacteriol
; 188(13): 4601-9, 2006 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-16788168