Detalles de la búsqueda
1.
RCSB Protein Data Bank (RCSB.org): delivery of experimentally-determined PDB structures alongside one million computed structure models of proteins from artificial intelligence/machine learning.
Nucleic Acids Res
; 51(D1): D488-D508, 2023 01 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36420884
2.
RCSB Protein Data Bank: powerful new tools for exploring 3D structures of biological macromolecules for basic and applied research and education in fundamental biology, biomedicine, biotechnology, bioengineering and energy sciences.
Nucleic Acids Res
; 49(D1): D437-D451, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33211854
3.
Modernized uniform representation of carbohydrate molecules in the Protein Data Bank.
Glycobiology
; 31(9): 1204-1218, 2021 09 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33978738
4.
RCSB Protein Data Bank: biological macromolecular structures enabling research and education in fundamental biology, biomedicine, biotechnology and energy.
Nucleic Acids Res
; 47(D1): D464-D474, 2019 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30357411
5.
D3R grand challenge 4: blind prediction of protein-ligand poses, affinity rankings, and relative binding free energies.
J Comput Aided Mol Des
; 34(2): 99-119, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31974851
6.
D3R Grand Challenge 3: blind prediction of protein-ligand poses and affinity rankings.
J Comput Aided Mol Des
; 33(1): 1-18, 2019 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30632055
7.
The RCSB protein data bank: integrative view of protein, gene and 3D structural information.
Nucleic Acids Res
; 45(D1): D271-D281, 2017 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27794042
8.
D3R Grand Challenge 2: blind prediction of protein-ligand poses, affinity rankings, and relative binding free energies.
J Comput Aided Mol Des
; 32(1): 1-20, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29204945
9.
Assessing and Maximizing the Quality of 3DEM Structure Data at the Worldwide Protein Data Bank.
Microsc Microanal
; 29(Supplement_1): 948, 2023 Jul 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37613801
10.
The chemical component dictionary: complete descriptions of constituent molecules in experimentally determined 3D macromolecules in the Protein Data Bank.
Bioinformatics
; 31(8): 1274-8, 2015 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25540181
11.
Improving the representation of peptide-like inhibitor and antibiotic molecules in the Protein Data Bank.
Biopolymers
; 101(6): 659-68, 2014 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24173824
12.
Outcomes of the EMDataResource Cryo-EM Ligand Modeling Challenge.
Res Sq
; 2024 Jan 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38343795
13.
Assessing PDB macromolecular crystal structure confidence at the individual amino acid residue level.
Structure
; 30(10): 1385-1394.e3, 2022 10 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36049478
14.
Simplified quality assessment for small-molecule ligands in the Protein Data Bank.
Structure
; 30(2): 252-262.e4, 2022 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35026162
15.
Protein Data Bank: A Comprehensive Review of 3D Structure Holdings and Worldwide Utilization by Researchers, Educators, and Students.
Biomolecules
; 12(10)2022 10 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36291635
16.
PDBx/mmCIF Ecosystem: Foundational Semantic Tools for Structural Biology.
J Mol Biol
; 434(11): 167599, 2022 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35460671
17.
RCSB Protein Data Bank: Celebrating 50 years of the PDB with new tools for understanding and visualizing biological macromolecules in 3D.
Protein Sci
; 31(1): 187-208, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34676613
18.
RCSB Protein Data bank: Tools for visualizing and understanding biological macromolecules in 3D.
Protein Sci
; 31(12): e4482, 2022 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36281733
19.
RCSB Protein Data Bank: Enabling biomedical research and drug discovery.
Protein Sci
; 29(1): 52-65, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31531901
20.
Continuous Evaluation of Ligand Protein Predictions: A Weekly Community Challenge for Drug Docking.
Structure
; 27(8): 1326-1335.e4, 2019 08 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31257108