Detalles de la búsqueda
1.
Widespread Expansion of Protein Interaction Capabilities by Alternative Splicing.
Cell
; 164(4): 805-17, 2016 02 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26871637
2.
AD-Syn-Net: systematic identification of Alzheimer's disease-associated mutation and co-mutation vulnerabilities via deep learning.
Brief Bioinform
; 24(2)2023 03 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36752347
3.
Genetic Regulation of SMC Gene Expression and Splicing Predict Causal CAD Genes.
Circ Res
; 132(3): 323-338, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36597873
4.
Bridging the splicing gap in human genetics with long-read RNA sequencing: finding the protein isoform drivers of disease.
Hum Mol Genet
; 31(R1): R123-R136, 2022 10 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35960994
5.
Characterization of protein isoform diversity in human umbilical vein endothelial cells via long-read proteogenomics.
RNA Biol
; 19(1): 1228-1243, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36457147
6.
Proteome-Scale Human Interactomics.
Trends Biochem Sci
; 42(5): 342-354, 2017 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28284537
7.
Improved Protein Inference from Multiple Protease Bottom-Up Mass Spectrometry Data.
J Proteome Res
; 18(9): 3429-3438, 2019 09 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31378069
8.
The Transcription Factor Nfatc2 Regulates ß-Cell Proliferation and Genes Associated with Type 2 Diabetes in Mouse and Human Islets.
PLoS Genet
; 12(12): e1006466, 2016 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27935966
9.
Human Proteomic Variation Revealed by Combining RNA-Seq Proteogenomics and Global Post-Translational Modification (G-PTM) Search Strategy.
J Proteome Res
; 15(3): 800-8, 2016 Mar 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26704769
10.
Global Identification of Protein Post-translational Modifications in a Single-Pass Database Search.
J Proteome Res
; 14(11): 4714-20, 2015 Nov 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26418581
11.
sapFinder: an R/Bioconductor package for detection of variant peptides in shotgun proteomics experiments.
Bioinformatics
; 30(21): 3136-8, 2014 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25053745
12.
Discovery and mass spectrometric analysis of novel splice-junction peptides using RNA-Seq.
Mol Cell Proteomics
; 12(8): 2341-53, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23629695
13.
Large-scale mass spectrometric detection of variant peptides resulting from nonsynonymous nucleotide differences.
J Proteome Res
; 13(1): 228-40, 2014 Jan 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24175627
14.
Using Galaxy-P to leverage RNA-Seq for the discovery of novel protein variations.
BMC Genomics
; 15: 703, 2014 Aug 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25149441
15.
IS-PRM-based peptide targeting informed by long-read sequencing for alternative proteome detection.
bioRxiv
; 2024 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38617311
16.
Splicing neoantigen discovery with SNAF reveals shared targets for cancer immunotherapy.
Sci Transl Med
; 16(730): eade2886, 2024 Jan 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38232136
17.
Long-read proteogenomics to connect disease-associated sQTLs to the protein isoform effectors of disease.
bioRxiv
; 2023 Mar 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36993769
18.
Gain-of-Function Variomics and Multi-omics Network Biology for Precision Medicine.
Methods Mol Biol
; 2660: 357-372, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37191809
19.
Connexin 37 sequestering of activated-ERK in the cytoplasm promotes p27-mediated endothelial cell cycle arrest.
Life Sci Alliance
; 6(8)2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37197981
20.
Enhanced protein isoform characterization through long-read proteogenomics.
Genome Biol
; 23(1): 69, 2022 03 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35241129