Detalles de la búsqueda
1.
Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome.
Cell
; 166(3): 766-778, 2016 Jul 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27453469
2.
Trans-Proteomic Pipeline: Robust Mass Spectrometry-Based Proteomics Data Analysis Suite.
J Proteome Res
; 22(2): 615-624, 2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36648445
3.
Improved Analysis of Cross-Linking Mass Spectrometry Data with Kojak 2.0, Advanced by Integration into the Trans-Proteomic Pipeline.
J Proteome Res
; 22(2): 647-655, 2023 02 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-36629399
4.
Insights from the First Phosphopeptide Challenge of the MS Resource Pillar of the HUPO Human Proteome Project.
J Proteome Res
; 19(12): 4754-4765, 2020 12 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33166149
5.
PTMProphet: Fast and Accurate Mass Modification Localization for the Trans-Proteomic Pipeline.
J Proteome Res
; 18(12): 4262-4272, 2019 12 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31290668
6.
A Tandem Mass Spectrometry Sequence Database Search Method for Identification of O-Fucosylated Proteins by Mass Spectrometry.
J Proteome Res
; 18(2): 652-663, 2019 02 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30523691
7.
Flexible and Fast Mapping of Peptides to a Proteome with ProteoMapper.
J Proteome Res
; 17(12): 4337-4344, 2018 12 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30230343
8.
Opening a SWATH Window on Posttranslational Modifications: Automated Pursuit of Modified Peptides.
Mol Cell Proteomics
; 15(3): 1151-63, 2016 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26704149
9.
Processing shotgun proteomics data on the Amazon cloud with the trans-proteomic pipeline.
Mol Cell Proteomics
; 14(2): 399-404, 2015 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25418363
10.
Automated Validation of Results and Removal of Fragment Ion Interferences in Targeted Analysis of Data-independent Acquisition Mass Spectrometry (MS) using SWATHProphet.
Mol Cell Proteomics
; 14(5): 1411-8, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25713123
11.
Tiered Human Integrated Sequence Search Databases for Shotgun Proteomics.
J Proteome Res
; 15(11): 4091-4100, 2016 11 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27577934
12.
State of the Human Proteome in 2014/2015 As Viewed through PeptideAtlas: Enhancing Accuracy and Coverage through the AtlasProphet.
J Proteome Res
; 14(9): 3461-73, 2015 Sep 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26139527
13.
The microvesicle component of HIV-1 inocula modulates dendritic cell infection and maturation and enhances adhesion to and activation of T lymphocytes.
PLoS Pathog
; 9(10): e1003700, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24204260
14.
Combining results of multiple search engines in proteomics.
Mol Cell Proteomics
; 12(9): 2383-93, 2013 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23720762
15.
Oncogenic H-ras reprograms Madin-Darby canine kidney (MDCK) cell-derived exosomal proteins following epithelial-mesenchymal transition.
Mol Cell Proteomics
; 12(8): 2148-59, 2013 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23645497
16.
State of the human proteome in 2013 as viewed through PeptideAtlas: comparing the kidney, urine, and plasma proteomes for the biology- and disease-driven Human Proteome Project.
J Proteome Res
; 13(1): 60-75, 2014 Jan 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24261998
17.
iProphet: multi-level integrative analysis of shotgun proteomic data improves peptide and protein identification rates and error estimates.
Mol Cell Proteomics
; 10(12): M111.007690, 2011 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21876204
18.
Borrelia PeptideAtlas: A proteome resource of common Borrelia burgdorferi isolates for Lyme research.
bioRxiv
; 2023 Jun 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37398146
19.
A comprehensive spectral assay library to quantify the Halobacterium salinarum NRC-1 proteome by DIA/SWATH-MS.
Sci Data
; 10(1): 697, 2023 10 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37833331
20.
Integrated phosphoproteomics analysis of a signaling network governing nutrient response and peroxisome induction.
Mol Cell Proteomics
; 9(9): 2076-88, 2010 Sep.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20395639