Detalles de la búsqueda
1.
Standardized benchmarking in the quest for orthologs.
Nat Methods
; 13(5): 425-30, 2016 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27043882
2.
The PhyloFacts FAT-CAT web server: ortholog identification and function prediction using fast approximate tree classification.
Nucleic Acids Res
; 41(Web Server issue): W242-8, 2013 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23685612
3.
Ortholog identification in the presence of domain architecture rearrangement.
Brief Bioinform
; 12(5): 413-22, 2011 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21712343
4.
ModBase, a database of annotated comparative protein structure models, and associated resources.
Nucleic Acids Res
; 39(Database issue): D465-74, 2011 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21097780
5.
Distribution and properties of the genes encoding the biosynthesis of the bacterial cofactor, pyrroloquinoline quinone.
Biochemistry
; 51(11): 2265-75, 2012 Mar 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22324760
6.
SATCHMO-JS: a webserver for simultaneous protein multiple sequence alignment and phylogenetic tree construction.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W29-34, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20430824
7.
Active site prediction using evolutionary and structural information.
Bioinformatics
; 26(5): 617-24, 2010 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20080507
8.
INTREPID: a web server for prediction of functionally important residues by evolutionary analysis.
Nucleic Acids Res
; 37(Web Server issue): W390-5, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19443452
9.
Berkeley PHOG: PhyloFacts orthology group prediction web server.
Nucleic Acids Res
; 37(Web Server issue): W84-9, 2009 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19435885
10.
The Generation Challenge Programme comparative plant stress-responsive gene catalogue.
Nucleic Acids Res
; 36(Database issue): D943-6, 2008 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17933772
11.
ResBoost: characterizing and predicting catalytic residues in enzymes.
BMC Bioinformatics
; 10: 197, 2009 Jun 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19558703
12.
INTREPID--INformation-theoretic TREe traversal for Protein functional site IDentification.
Bioinformatics
; 24(21): 2445-52, 2008 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18776193
13.
Berkeley Phylogenomics Group web servers: resources for structural phylogenomic analysis.
Nucleic Acids Res
; 35(Web Server issue): W27-32, 2007 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17488835
14.
Automated protein subfamily identification and classification.
PLoS Comput Biol
; 3(8): e160, 2007 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17708678
15.
FlowerPower: clustering proteins into domain architecture classes for phylogenomic inference of protein function.
BMC Evol Biol
; 7 Suppl 1: S12, 2007 Feb 08.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17288570
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The Arabidopsis thaliana chloroplast proteome reveals pathway abundance and novel protein functions.
Curr Biol
; 14(5): 354-62, 2004 Mar 09.
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| MEDLINE | ID: mdl-15028209
17.
Taking the first steps towards a standard for reporting on phylogenies: Minimum Information About a Phylogenetic Analysis (MIAPA).
OMICS
; 10(2): 231-7, 2006.
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| MEDLINE | ID: mdl-16901231
18.
Getting started in structural phylogenomics.
PLoS Comput Biol
; 6(1): e1000621, 2010 Jan 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20126522
19.
Functional classification using phylogenomic inference.
PLoS Comput Biol
; 2(6): e77, 2006 Jun 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16846248
20.
The interface of protein structure, protein biophysics, and molecular evolution.
Protein Sci
; 21(6): 769-85, 2012 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22528593