Detalles de la búsqueda
1.
Distinct Classes of Complex Structural Variation Uncovered across Thousands of Cancer Genome Graphs.
Cell
; 183(1): 197-210.e32, 2020 10 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33007263
2.
VSCode-Antimony: a source editor for building, analyzing, and translating antimony models.
Bioinformatics
; 39(12)2023 12 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38096590
3.
BioSimulators: a central registry of simulation engines and services for recommending specific tools.
Nucleic Acids Res
; 50(W1): W108-W114, 2022 07 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35524558
4.
Adapting modeling and simulation credibility standards to computational systems biology.
J Transl Med
; 21(1): 501, 2023 07 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37496031
5.
SBML Level 3: an extensible format for the exchange and reuse of biological models.
Mol Syst Biol
; 16(8): e9110, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32845085
6.
CNValidator: validating somatic copy-number inference.
Bioinformatics
; 35(15): 2660-2662, 2019 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30541069
7.
Apoglobin Stability Is the Major Factor Governing both Cell-free and in Vivo Expression of Holomyoglobin.
J Biol Chem
; 290(39): 23479-95, 2015 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26205820
8.
SBML and CellML translation in antimony and JSim.
Bioinformatics
; 30(7): 903-7, 2014 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24215024
9.
MakeSBML: a tool for converting between Antimony and SBML.
J Integr Bioinform
; 2024 Jun 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38860571
10.
The simulation experiment description markup language (SED-ML): language specification for level 1 version 5.
J Integr Bioinform
; 2024 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38613325
11.
MakeSBML: A tool for converting between Antimony and SBML.
ArXiv
; 2023 Sep 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37731653
12.
Somatic whole genome dynamics of precancer in Barrett's esophagus reveals features associated with disease progression.
Nat Commun
; 13(1): 2300, 2022 04 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35484108
13.
The simulation experiment description markup language (SED-ML): language specification for level 1 version 4.
J Integr Bioinform
; 18(3): 20210021, 2021 Oct 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35330701
14.
Within-patient phylogenetic reconstruction reveals early events in Barrett's Esophagus.
Evol Appl
; 14(2): 399-415, 2021 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33664784
15.
The limits of fine-scale mapping.
Genet Epidemiol
; 33(4): 344-56, 2009 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19048633
16.
Antimony: a modular model definition language.
Bioinformatics
; 25(18): 2452-4, 2009 Sep 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19578039
17.
A reappraisal of how to build modular, reusable models of biological systems.
PLoS Comput Biol
; 10(10): e1003849, 2014 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25275523
18.
Systems Biology Markup Language (SBML) Level 3 Package: Distributions, Version 1, Release 1.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jul 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32750035
19.
Systems biology markup language (SBML) level 3 package: multistate, multicomponent and multicompartment species, version 1, release 2.
J Integr Bioinform
; 17(2-3)2020 Jul 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32628633
20.
The Systems Biology Markup Language (SBML): Language Specification for Level 3 Version 2 Core Release 2.
J Integr Bioinform
; 16(2)2019 Jun 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31219795