Detalles de la búsqueda
1.
Metagenome-mining indicates an association between bacteriocin presence and strain diversity in the infant gut.
BMC Genomics
; 24(1): 295, 2023 May 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37259063
2.
A Globally Distributed Bacteroides caccae Strain Is the Most Prevalent Mother-Child Shared Bacteroidaceae Strain in a Large Scandinavian Cohort.
Appl Environ Microbiol
; 89(7): e0078923, 2023 07 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37338379
3.
Fecal Microbiota Nutrient Utilization Potential Suggests Mucins as Drivers for Initial Gut Colonization of Mother-Child-Shared Bacteria.
Appl Environ Microbiol
; 87(6)2021 02 26.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33452029
4.
Stable Core Gut Microbiota across the Freshwater-to-Saltwater Transition for Farmed Atlantic Salmon.
Appl Environ Microbiol
; 84(2)2018 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29101198
5.
microclass: an R-package for 16S taxonomy classification.
BMC Bioinformatics
; 18(1): 172, 2017 Mar 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28302051
6.
The nucleotide composition of microbial genomes indicates differential patterns of selection on core and accessory genomes.
BMC Genomics
; 18(1): 151, 2017 02 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28187704
7.
Cecal microbiota association with tumor load in a colorectal cancer mouse model.
Microb Ecol Health Dis
; 28(1): 1352433, 2017.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28959179
8.
CNOGpro: detection and quantification of CNVs in prokaryotic whole-genome sequencing data.
Bioinformatics
; 31(11): 1708-15, 2015 Jun 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25644268
9.
micropan: an R-package for microbial pan-genomics.
BMC Bioinformatics
; 16: 79, 2015 Mar 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25888166
10.
Comparing K-mer based methods for improved classification of 16S sequences.
BMC Bioinformatics
; 16: 205, 2015 Jul 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26130333
11.
A genomic virulence reference map of Enterococcus faecalis reveals an important contribution of phage03-like elements in nosocomial genetic lineages to pathogenicity in a Caenorhabditis elegans infection model.
Infect Immun
; 83(5): 2156-67, 2015 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25776747
12.
An evolutionary analysis of genome expansion and pathogenicity in Escherichia coli.
BMC Genomics
; 15: 882, 2014 Oct 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25297974
13.
Rotation gene set testing for longitudinal expression data.
Biom J
; 56(6): 1055-75, 2014 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25243581
14.
Swarm and UNOISE outperform DADA2 and Deblur for denoising high-diversity marine seafloor samples.
ISME Commun
; 4(1): ycae071, 2024 Jan.
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| MEDLINE | ID: mdl-38873028
15.
Prediction of high fecal propionate-to-butyrate ratios using 16S rRNA-based detection of bacterial groups with liquid array diagnostics.
Biotechniques
; 74(1): 9-21, 2023 01.
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| MEDLINE | ID: mdl-36601888
16.
Improving stability and understandability of genotype-phenotype mapping in Saccharomyces using regularized variable selection in L-PLS regression.
BMC Bioinformatics
; 13: 327, 2012 Dec 08.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23216988
17.
Exploration of multivariate analysis in microbial coding sequence modeling.
BMC Bioinformatics
; 13: 97, 2012 May 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22583558
18.
Relative entropy differences in bacterial chromosomes, plasmids, phages and genomic islands.
BMC Genomics
; 13: 66, 2012 Feb 10.
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| MEDLINE | ID: mdl-22325062
19.
Growth rate-dependent control in Enterococcus faecalis: effects on the transcriptome and proteome, and strong regulation of lactate dehydrogenase.
Appl Environ Microbiol
; 78(1): 170-6, 2012 Jan.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22038603
20.
Smoothing gene expression data with network information improves consistency of regulated genes.
Stat Appl Genet Mol Biol
; 10(1)2011 Aug 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23089828