Detalles de la búsqueda
1.
Gene Transfer-Based Phylogenetics: Analytical Expressions and Additivity via Birth-Death Theory.
Syst Biol
; 72(6): 1403-1417, 2023 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37862116
2.
Exponential dynamics of DNA methylation with age.
J Theor Biol
; 579: 111697, 2024 02 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38142045
3.
Horizontal Gene Transfer Phylogenetics: A Random Walk Approach.
Mol Biol Evol
; 37(5): 1470-1479, 2020 05 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31845962
4.
The Epigenetic Pacemaker: modeling epigenetic states under an evolutionary framework.
Bioinformatics
; 36(17): 4662-4663, 2020 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32573701
5.
Inference of mutability landscapes of tumors from single cell sequencing data.
PLoS Comput Biol
; 16(11): e1008454, 2020 11.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33253159
6.
Epigenetic pacemaker: closed form algebraic solutions.
BMC Genomics
; 21(Suppl 2): 257, 2020 Apr 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32299339
7.
Detecting horizontal gene transfer: a probabilistic approach.
BMC Genomics
; 21(Suppl 1): 106, 2020 Mar 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32138652
8.
Synteny footprints provide clearer phylogenetic signal than sequence data for prokaryotic classification.
Mol Phylogenet Evol
; 136: 128-137, 2019 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30946898
9.
Reconstruction of real and simulated phylogenies based on quartet plurality inference.
BMC Genomics
; 19(Suppl 6): 570, 2018 Aug 13.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30367577
10.
The Performance of Two Supertree Schemes Compared Using Synthetic and Real Data Quartet Input.
J Mol Evol
; 86(2): 150-165, 2018 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29460038
11.
Applying meta-analysis to genotype-tissue expression data from multiple tissues to identify eQTLs and increase the number of eGenes.
Bioinformatics
; 33(14): i67-i74, 2017 Jul 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28881962
12.
Toxic genes present a unique phylogenetic signature.
Mol Phylogenet Evol
; 116: 141-148, 2017 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28842276
13.
Convex recoloring as an evolutionary marker.
Mol Phylogenet Evol
; 107: 209-220, 2017 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27818264
14.
A Statistical Framework to Identify Deviation from Time Linearity in Epigenetic Aging.
PLoS Comput Biol
; 12(11): e1005183, 2016 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27835646
15.
Weighted quartets phylogenetics.
Syst Biol
; 64(2): 233-42, 2015 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-25414175
16.
Detecting Horizontal Gene Transfer between Closely Related Taxa.
PLoS Comput Biol
; 11(10): e1004408, 2015 Oct.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26439115
17.
Phylo SI: a new genome-wide approach for prokaryotic phylogeny.
Nucleic Acids Res
; 42(4): 2391-404, 2014 Feb.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24243847
18.
Scorpion speciation in the Holy Land: Multilocus phylogeography corroborates diagnostic differences in morphology and burrowing behavior among Scorpio subspecies and justifies recognition as phylogenetic, ecological and biological species.
Mol Phylogenet Evol
; 91: 226-37, 2015 Oct.
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| MEDLINE | ID: mdl-25987530
19.
Implications of human genome structural heterogeneity: functionally related genes tend to reside in organizationally similar genomic regions.
BMC Genomics
; 15: 252, 2014 Mar 31.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24684786
20.
Enforcing Temporal Consistency in Migration History Inference.
J Comput Biol
; 31(5): 396-415, 2024 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38754138