Detalles de la búsqueda
1.
Redefining fundamental concepts of transcription initiation in bacteria.
Nat Rev Genet
; 21(11): 699-714, 2020 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32665585
2.
On the dependent recognition of some long zinc finger proteins.
Nucleic Acids Res
; 51(11): 5364-5376, 2023 06 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36951113
3.
Finding motifs using DNA images derived from sparse representations.
Bioinformatics
; 39(6)2023 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37294804
4.
Innate host defense requires TFEB-mediated transcription of cytoprotective and antimicrobial genes.
Immunity
; 40(6): 896-909, 2014 Jun 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24882217
5.
Analysis of homeodomain specificities allows the family-wide prediction of preferred recognition sites.
Cell
; 133(7): 1277-89, 2008 Jun 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18585360
6.
Directed Evolution of an Enhanced POU Reprogramming Factor for Cell Fate Engineering.
Mol Biol Evol
; 38(7): 2854-2868, 2021 06 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33720298
7.
Quantitative specificity of STAT1 and several variants.
Nucleic Acids Res
; 45(14): 8199-8207, 2017 Aug 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28510715
8.
Quantitative profiling of selective Sox/POU pairing on hundreds of sequences in parallel by Coop-seq.
Nucleic Acids Res
; 45(2): 832-845, 2017 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27915232
9.
Comparison of discriminative motif optimization using matrix and DNA shape-based models.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 86, 2018 03 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29510689
10.
Quantitative profiling of BATF family proteins/JUNB/IRF hetero-trimers using Spec-seq.
BMC Mol Biol
; 19(1): 5, 2018 03 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29587652
11.
BEESEM: estimation of binding energy models using HT-SELEX data.
Bioinformatics
; 33(15): 2288-2295, 2017 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28379348
12.
Inherent limitations of probabilistic models for protein-DNA binding specificity.
PLoS Comput Biol
; 13(7): e1005638, 2017 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28686588
13.
Response Element Composition Governs Correlations between Binding Site Affinity and Transcription in Glucocorticoid Receptor Feed-forward Loops.
J Biol Chem
; 290(32): 19756-69, 2015 Aug 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26088140
14.
Global analysis of Drosophila Cys2-His2 zinc finger proteins reveals a multitude of novel recognition motifs and binding determinants.
Genome Res
; 23(6): 928-40, 2013 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23471540
15.
Determining the specificity of protein-DNA interactions.
Nat Rev Genet
; 11(11): 751-60, 2010 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20877328
16.
An improved predictive recognition model for Cys(2)-His(2) zinc finger proteins.
Nucleic Acids Res
; 42(8): 4800-12, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24523353
17.
Exploring the DNA-recognition potential of homeodomains.
Genome Res
; 22(10): 1889-98, 2012 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22539651
18.
An optimized two-finger archive for ZFN-mediated gene targeting.
Nat Methods
; 9(6): 588-90, 2012 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22543349
19.
Discriminative motif optimization based on perceptron training.
Bioinformatics
; 30(7): 941-8, 2014 Apr 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24369152
20.
The AP-1 transcription factor Batf controls T(H)17 differentiation.
Nature
; 460(7253): 405-9, 2009 Jul 16.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-19578362