Detalles de la búsqueda
1.
SignaLink3: a multi-layered resource to uncover tissue-specific signaling networks.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D701-D709, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34634810
2.
Holistic healthcare in inflammatory bowel disease: time for patient-centric approaches?
Gut
; 72(1): 192-204, 2023 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36171081
3.
The Proteome of Extracellular Vesicles Produced by the Human Gut Bacteria Bacteroides thetaiotaomicron In Vivo Is Influenced by Environmental and Host-Derived Factors.
Appl Environ Microbiol
; 88(16): e0053322, 2022 08 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35916501
4.
ViralLink: An integrated workflow to investigate the effect of SARS-CoV-2 on intracellular signalling and regulatory pathways.
PLoS Comput Biol
; 17(2): e1008685, 2021 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33534793
5.
Big data in IBD: big progress for clinical practice.
Gut
; 69(8): 1520-1532, 2020 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32111636
6.
Construction and verification of the transcriptional regulatory response network of Streptococcus mutans upon treatment with the biofilm inhibitor carolacton.
BMC Genomics
; 15: 362, 2014 May 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24884510
7.
Distinct transcriptional signatures in purified circulating immune cells drive heterogeneity in disease location in IBD.
BMJ Open Gastroenterol
; 10(1)2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36746519
8.
A genome-wide study of two-component signal transduction systems in eight newly sequenced mutans streptococci strains.
BMC Genomics
; 13: 128, 2012 Apr 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22475007
9.
Integrated analysis of microbe-host interactions in Crohn's disease reveals potential mechanisms of microbial proteins on host gene expression.
iScience
; 25(5): 103963, 2022 May 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35479407
10.
Tailoring Multi-omics to Inflammatory Bowel Diseases: All for One and One for All.
J Crohns Colitis
; 16(8): 1306-1320, 2022 Aug 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35150242
11.
Extracellular vesicles produced by the human commensal gut bacterium Bacteroides thetaiotaomicron affect host immune pathways in a cell-type specific manner that are altered in inflammatory bowel disease.
J Extracell Vesicles
; 11(1): e12189, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35064769
12.
Multilayered Networks of SalmoNet2 Enable Strain Comparisons of the Salmonella Genus on a Molecular Level.
mSystems
; 7(4): e0149321, 2022 08 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35913188
13.
Microbiota, not host origin drives ex vivo intestinal epithelial responses.
Gut Microbes
; 14(1): 2089003, 2022.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35758256
14.
A systems genomics approach to uncover patient-specific pathogenic pathways and proteins in ulcerative colitis.
Nat Commun
; 13(1): 2299, 2022 04 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35484353
15.
Computational Biology and Machine Learning Approaches to Understand Mechanistic Microbiome-Host Interactions.
Front Microbiol
; 12: 618856, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34046017
16.
Understanding the Molecular Drivers of Disease Heterogeneity in Crohn's Disease Using Multi-omic Data Integration and Network Analysis.
Inflamm Bowel Dis
; 27(6): 870-886, 2021 05 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33313682
17.
Evolution of regulatory networks associated with traits under selection in cichlids.
Genome Biol
; 22(1): 25, 2021 01 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33419455
18.
MicrobioLink: An Integrated Computational Pipeline to Infer Functional Effects of Microbiome-Host Interactions.
Cells
; 9(5)2020 05 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32455748
19.
ULK1 and ULK2 are less redundant than previously thought: computational analysis uncovers distinct regulation and functions of these autophagy induction proteins.
Sci Rep
; 10(1): 10940, 2020 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32616830
20.
Network Biology Approaches to Identify Molecular and Systems-Level Differences Between Salmonella Pathovars.
Methods Mol Biol
; 1918: 265-273, 2019.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30580415