Detalles de la búsqueda
1.
Evaluating impacts of syntenic block detection strategies on rearrangement phylogeny using Mycobacterium tuberculosis isolates.
Bioinformatics
; 39(1)2023 01 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36637196
2.
Large-scale mammalian genome rearrangements coincide with chromatin interactions.
Bioinformatics
; 35(14): i117-i126, 2019 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31510664
3.
Rapid alignment-free phylogenetic identification of metagenomic sequences.
Bioinformatics
; 35(18): 3303-3312, 2019 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30698645
4.
Aligning the unalignable: bacteriophage whole genome alignments.
BMC Bioinformatics
; 17: 30, 2016 Jan 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26757899
5.
Assisted transcriptome reconstruction and splicing orthology.
BMC Genomics
; 17(Suppl 10): 786, 2016 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185551
6.
Reconstructing the modular recombination history of Staphylococcus aureus phages.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S17, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24564731
7.
Gene tree correction guided by orthology.
BMC Bioinformatics
; 14 Suppl 15: S5, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24564227
8.
Gene trees and species trees: irreconcilable differences.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 19: S15, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23281654
9.
A graph-theoretic approach for inparalog detection.
BMC Bioinformatics
; 13 Suppl 19: S16, 2012.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23281701
10.
A Faster Algorithm for Computing the Kernel of Maximum Agreement Subtrees.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 18(2): 416-430, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31217125
11.
Estimating true evolutionary distances under rearrangements, duplications, and losses.
BMC Bioinformatics
; 11 Suppl 1: S54, 2010 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20122229
12.
Heuristics for the inversion median problem.
BMC Bioinformatics
; 11 Suppl 1: S30, 2010 Jan 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20122203
13.
Diversity of bacteriophages encoding Panton-Valentine leukocidin in temporally and geographically related Staphylococcus aureus.
PLoS One
; 15(2): e0228676, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32040487
14.
Inversion-based genomic signatures.
BMC Bioinformatics
; 10 Suppl 1: S7, 2009 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19208174
15.
Maximum independent sets of commuting and noninterfering inversions.
BMC Bioinformatics
; 10 Suppl 1: S6, 2009 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19208163
16.
A general framework for genome rearrangement with biological constraints.
Algorithms Mol Biol
; 14: 15, 2019.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31360217
17.
Finding local genome rearrangements.
Algorithms Mol Biol
; 13: 9, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29755580
18.
Models and algorithms for genome rearrangement with positional constraints.
Algorithms Mol Biol
; 11: 13, 2016.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27190550
19.
Ancestral genome organization: an alignment approach.
J Comput Biol
; 20(4): 280-95, 2013 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23560866
20.
Gene tree correction for reconciliation and species tree inference.
Algorithms Mol Biol
; 7(1): 31, 2012 Nov 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23167951