Detalles de la búsqueda
1.
Rheostats, toggles, and neutrals, Oh my! A new framework for understanding how amino acid changes modulate protein function.
J Biol Chem
; 300(3): 105736, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38336297
2.
Fructose-1-kinase has pleiotropic roles in Escherichia coli.
J Biol Chem
; 300(6): 107352, 2024 May 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38723750
3.
The 2.4 Å structure of Zymomonas mobilis pyruvate kinase: Implications for stability and regulation.
Arch Biochem Biophys
; 744: 109679, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37393983
4.
A clinically relevant polymorphism in the Na+/taurocholate cotransporting polypeptide (NTCP) occurs at a rheostat position.
J Biol Chem
; 296: 100047, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33168628
5.
Allosteric regulation within the highly interconnected structural scaffold of AraC/XylS homologs tolerates a wide range of amino acid changes.
Proteins
; 90(1): 186-199, 2022 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34369028
6.
Substitutions at Nonconserved Rheostat Positions Modulate Function by Rewiring Long-Range, Dynamic Interactions.
Mol Biol Evol
; 38(1): 201-214, 2021 01 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32780837
7.
Structural Plasticity Is a Feature of Rheostat Positions in the Human Na+/Taurocholate Cotransporting Polypeptide (NTCP).
Int J Mol Sci
; 23(6)2022 Mar 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35328632
8.
Spectroscopic evidence of tetanus toxin translocation domain bilayer-induced refolding and insertion.
Biophys J
; 120(21): 4763-4776, 2021 11 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34555358
9.
Identification of biochemically neutral positions in liver pyruvate kinase.
Proteins
; 88(10): 1340-1350, 2020 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32449829
10.
Rheostat positions: A new classification of protein positions relevant to pharmacogenomics.
Med Chem Res
; 29(7): 1133-1146, 2020 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32641900
11.
RheoScale: A tool to aggregate and quantify experimentally determined substitution outcomes for multiple variants at individual protein positions.
Hum Mutat
; 39(12): 1814-1826, 2018 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30117637
12.
Using Evolution to Guide Protein Engineering: The Devil IS in the Details.
Biophys J
; 111(1): 10-8, 2016 Jul 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27410729
13.
Flexibility and Disorder in Gene Regulation: LacI/GalR and Hox Proteins.
J Biol Chem
; 290(41): 24669-77, 2015 Oct 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26342073
14.
Amino acid positions subject to multiple coevolutionary constraints can be robustly identified by their eigenvector network centrality scores.
Proteins
; 83(12): 2293-306, 2015 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26503808
15.
Novel insights from hybrid LacI/GalR proteins: family-wide functional attributes and biologically significant variation in transcription repression.
Nucleic Acids Res
; 40(21): 11139-54, 2012 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22965134
16.
Rheostatic contributions to protein stability can obscure a position's functional role.
Protein Sci
; 33(7): e5075, 2024 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38895978
17.
Simulated pressure changes in LacI suggest a link between hydration and functional conformational changes.
Biophys Chem
; 304: 107126, 2024 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37924711
18.
The intrinsically disordered transcriptional activation domain of CIITA is functionally tuneable by single substitutions: An exception or a new paradigm?
Protein Sci
; 33(2): e4863, 2024 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38073129
19.
Enzymatic reaction sequences as coupled multiple traces on a multidimensional landscape.
Trends Biochem Sci
; 33(3): 104-12, 2008 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18261912
20.
Identification of a covert evolutionary pathway between two protein folds.
Nat Commun
; 14(1): 3177, 2023 06 01.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37264049