Detalles de la búsqueda
1.
Manipulation of photosynthetic energy transfer by vibrational strong coupling.
J Chem Phys
; 160(4)2024 Jan 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38284659
2.
In Silico Search for Drug Candidates Targeting the PAX8-PPARγ Fusion Protein in Thyroid Cancer.
Int J Mol Sci
; 25(10)2024 May 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38791384
3.
Holographic Brain Theory: Super-Radiance, Memory Capacity and Control Theory.
Int J Mol Sci
; 25(4)2024 Feb 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38397075
4.
End-to-end protein-ligand complex structure generation with diffusion-based generative models.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 233, 2023 Jun 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37277701
5.
Thermal conductivity and conductance of protein in aqueous solution: Effects of geometrical shape.
J Comput Chem
; 44(7): 857-868, 2023 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36468822
6.
Remarked suppression of Aß42 protomer-protomer dissociation reaction elucidated by molecular dynamics simulation.
Proteins
; 90(7): 1367-1375, 2022 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35137442
7.
Protein-ligand binding affinity prediction of cyclin-dependent kinase-2 inhibitors by dynamically averaged fragment molecular orbital-based interaction energy.
J Comput Chem
; 43(20): 1362-1371, 2022 07 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35678372
8.
Computational prediction of heteromeric protein complex disassembly order using hybrid Monte Carlo/molecular dynamics simulation.
Phys Chem Chem Phys
; 24(17): 10575-10587, 2022 May 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-35445673
9.
Interspecies Comparison of Interaction Energies between Photosynthetic Protein RuBisCO and 2CABP Ligand.
Int J Mol Sci
; 23(19)2022 Sep 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36232645
10.
FMODB: The World's First Database of Quantum Mechanical Calculations for Biomacromolecules Based on the Fragment Molecular Orbital Method.
J Chem Inf Model
; 61(2): 777-794, 2021 02 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33511845
11.
In silico modeling of PAX8-PPARγ fusion protein in thyroid carcinoma: influence of structural perturbation by fusion on ligand-binding affinity.
J Comput Aided Mol Des
; 35(5): 629-642, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33748935
12.
Elucidating microscopic events driven by GTP hydrolysis reaction in the Ras-GAP system with semi-reactive molecular dynamics simulations: the alternative role of a phosphate binding loop for mechanical energy storage.
Phys Chem Chem Phys
; 23(46): 26151-26164, 2021 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34797363
13.
Improvement of the Force Field for ß-d-Glucose with Machine Learning.
Molecules
; 26(21)2021 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34771103
14.
Effective Static Approximation: A Fast and Reliable Tool for Warm-Dense Matter Theory.
Phys Rev Lett
; 125(23): 235001, 2020 Dec 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33337174
15.
Fragment Molecular Orbital Based Interaction Analyses on COVID-19 Main Protease - Inhibitor N3 Complex (PDB ID: 6LU7).
J Chem Inf Model
; 60(7): 3593-3602, 2020 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32539372
16.
Temperature relaxation in binary hard-sphere mixture system: Molecular dynamics and kinetic theory study.
J Chem Phys
; 153(3): 034114, 2020 Jul 21.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32716157
17.
Pursuing origins of (poly)ethylene glycol-induced G-quadruplex structural modulations.
Nucleic Acids Res
; 46(8): 4301-4315, 2018 05 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29648656
18.
Nanoscale Quantum Thermal Conductance at Water Interface: Green's Function Approach Based on One-Dimensional Phonon Model.
Molecules
; 25(5)2020 Mar 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32151110
19.
New Modified Deoxythymine with Dibranched Tetraethylene Glycol Stabilizes G-Quadruplex Structures.
Molecules
; 25(3)2020 Feb 06.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32041318
20.
Ab initio molecular dynamics study of prebiotic production processes of organic compounds at meteorite impacts on ocean.
J Comput Chem
; 40(2): 349-359, 2019 01 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30306615