Detalles de la búsqueda
1.
Long-range promoter-enhancer contacts are conserved during evolution and contribute to gene expression robustness.
Genome Res
; 32(2): 280-296, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34930799
2.
Ghost lineages can invalidate or even reverse findings regarding gene flow.
PLoS Biol
; 20(9): e3001776, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36103518
3.
PhylteR: Efficient Identification of Outlier Sequences in Phylogenomic Datasets.
Mol Biol Evol
; 40(11)2023 Nov 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37879113
4.
Thirdkind: displaying phylogenetic encounters beyond 2-level reconciliation.
Bioinformatics
; 38(8): 2350-2352, 2022 04 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35139153
5.
Ghost Lineages Highly Influence the Interpretation of Introgression Tests.
Syst Biol
; 71(5): 1147-1158, 2022 08 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35169846
6.
Response to "On the impact of incomplete taxon sampling on the relative timing of gene transfer events".
PLoS Biol
; 22(3): e3002557, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38502645
7.
A hapless mathematical contribution to biology : Chromosome inversions in Drosophila, 1937-1941.
Hist Philos Life Sci
; 44(3): 34, 2022 Aug 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35918616
8.
Zombi: a phylogenetic simulator of trees, genomes and sequences that accounts for dead linages.
Bioinformatics
; 36(4): 1286-1288, 2020 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31566657
9.
Treerecs: an integrated phylogenetic tool, from sequences to reconciliations.
Bioinformatics
; 36(18): 4822-4824, 2020 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33085745
10.
Evolutionary superscaffolding and chromosome anchoring to improve Anopheles genome assemblies.
BMC Biol
; 18(1): 1, 2020 01 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31898513
11.
RecPhyloXML: a format for reconciled gene trees.
Bioinformatics
; 34(21): 3646-3652, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29762653
12.
Gene tree species tree reconciliation with gene conversion.
J Math Biol
; 78(6): 1981-2014, 2019 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30767052
13.
Phylogenetic signal from rearrangements in 18 Anopheles species by joint scaffolding extant and ancestral genomes.
BMC Genomics
; 19(Suppl 2): 96, 2018 May 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29764366
14.
Resolution and reconciliation of non-binary gene trees with transfers, duplications and losses.
Bioinformatics
; 33(7): 980-987, 2017 04 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28073758
15.
Phylogenetic reconciliation.
PLoS Comput Biol
; 18(11): e1010621, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36327227
16.
Genome rearrangements with indels in intergenes restrict the scenario space.
BMC Bioinformatics
; 17(Suppl 14): 426, 2016 Nov 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28185582
17.
Genome-scale coestimation of species and gene trees.
Genome Res
; 23(2): 323-30, 2013 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23132911
18.
The inference of gene trees with species trees.
Syst Biol
; 64(1): e42-62, 2015 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25070970
19.
Moments of genome evolution by Double Cut-and-Join.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 14: S7, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26451469
20.
Probabilistic modeling of the evolution of gene synteny within reconciled phylogenies.
BMC Bioinformatics
; 16 Suppl 14: S5, 2015.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26452018