Detalles de la búsqueda
1.
ParaMol: A Package for Automatic Parameterization of Molecular Mechanics Force Fields.
J Chem Inf Model
; 61(4): 2026-2047, 2021 04 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33750120
2.
Detection of secondary binding sites in proteins using fragment screening.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(52): 15910-5, 2015 Dec 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26655740
3.
Potential and limitations of ensemble docking.
J Chem Inf Model
; 52(5): 1262-74, 2012 May 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22482774
4.
Generation of Quantum Configurational Ensembles Using Approximate Potentials.
J Chem Theory Comput
; 17(11): 7021-7042, 2021 Nov 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34644088
5.
Fragment-Guided Discovery of Pyrazole Carboxylic Acid Inhibitors of the Kelch-like ECH-Associated Protein 1: Nuclear Factor Erythroid 2 Related Factor 2 (KEAP1:NRF2) Protein-Protein Interaction.
J Med Chem
; 64(21): 15949-15972, 2021 11 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34705450
6.
Practical High-Quality Electrostatic Potential Surfaces for Drug Discovery Using a Graph-Convolutional Deep Neural Network.
J Med Chem
; 63(16): 8778-8790, 2020 08 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31553186
7.
Fragment-based screening using X-ray crystallography and NMR spectroscopy.
Curr Opin Chem Biol
; 11(5): 485-93, 2007 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17851109
8.
A structural comparison of inhibitor binding to PKB, PKA and PKA-PKB chimera.
J Mol Biol
; 367(3): 882-94, 2007 Mar 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17275837
9.
Identification of 4-(4-aminopiperidin-1-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidines as selective inhibitors of protein kinase B through fragment elaboration.
J Med Chem
; 51(7): 2147-57, 2008 Apr 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18345609
10.
Diverse, high-quality test set for the validation of protein-ligand docking performance.
J Med Chem
; 50(4): 726-41, 2007 Feb 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17300160
11.
Identification of inhibitors of protein kinase B using fragment-based lead discovery.
J Med Chem
; 50(10): 2293-6, 2007 May 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17451234
12.
The Fragment Network: A Chemistry Recommendation Engine Built Using a Graph Database.
J Med Chem
; 60(14): 6440-6450, 2017 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28712298
13.
Predicting "Hot" and "Warm" Spots for Fragment Binding.
J Med Chem
; 60(9): 4036-4046, 2017 05 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28376303
14.
Protein-ligand binding affinity predictions by implicit solvent simulations: a tool for lead optimization?
J Med Chem
; 49(25): 7427-39, 2006 Dec 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17149872
15.
Protein-Ligand Informatics Force Field (PLIff): Toward a Fully Knowledge Driven "Force Field" for Biomolecular Interactions.
J Med Chem
; 59(14): 6891-902, 2016 07 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27353137
16.
General and targeted statistical potentials for protein-ligand interactions.
Proteins
; 61(2): 272-87, 2005 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16106379
17.
Prediction of binding modes for ligands in the cytochromes P450 and other heme-containing proteins.
Proteins
; 58(4): 836-44, 2005 Mar 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15651036
18.
Modeling water molecules in protein-ligand docking using GOLD.
J Med Chem
; 48(20): 6504-15, 2005 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16190776
19.
Improved protein-ligand docking using GOLD.
Proteins
; 52(4): 609-23, 2003 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12910460
20.
A new test set for validating predictions of protein-ligand interaction.
Proteins
; 49(4): 457-71, 2002 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12402356