Detalles de la búsqueda
1.
A combinatorial scoring function for protein-RNA docking.
Proteins
; 85(4): 741-752, 2017 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28120375
2.
Allosteric transitions of ATP-binding cassette transporter MsbA studied by the adaptive anisotropic network model.
Proteins
; 83(9): 1643-53, 2015 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26148303
3.
Allosteric transitions of the maltose transporter studied by an elastic network model.
Biopolymers
; 101(7): 758-68, 2014 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24865820
4.
Detection of persistent organic pollutants binding modes with androgen receptor ligand binding domain by docking and molecular dynamics.
BMC Struct Biol
; 13: 16, 2013 Sep 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24053684
5.
A new residue-nucleotide propensity potential with structural information considered for discriminating protein-RNA docking decoys.
Proteins
; 80(1): 14-24, 2012 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21953889
6.
Identification of key residues for protein conformational transition using elastic network model.
J Chem Phys
; 135(17): 174101, 2011 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22070286
7.
Role of electrostatic interactions for the stability and folding behavior of cold shock protein.
Proteins
; 78(9): 2157-69, 2010 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20455270
8.
Design, synthesis and anti-HIV integrase evaluation of N-(5-chloro-8-hydroxy-2-styrylquinolin-7-yl)benzenesulfonamide derivatives.
Molecules
; 15(3): 1903-17, 2010 Mar 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20336021
9.
Protein unfolding behavior studied by elastic network model.
Biophys J
; 94(12): 4586-96, 2008 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18310247
10.
Amino acid network and its scoring application in protein-protein docking.
Biophys Chem
; 134(3): 111-8, 2008 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18329160
11.
Study on the molecular mechanism of inhibiting HIV-1 integrase by EBR28 peptide via molecular modeling approach.
Biophys Chem
; 132(2-3): 69-80, 2008 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18037557
12.
A novel high-throughput format assay for HIV-1 integrase strand transfer reaction using magnetic beads.
Acta Pharmacol Sin
; 29(3): 397-404, 2008 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18298906
13.
Evolving model of amino acid networks.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys
; 77(6 Pt 1): 061920, 2008 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18643313
14.
Prediction of the binding mode between BMS-378806 and HIV-1 gp120 by docking and molecular dynamics simulation.
Biochim Biophys Acta
; 1764(4): 766-72, 2006 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16455315
15.
A filter enhanced sampling and combinatorial scoring study for protein docking in CAPRI.
Proteins
; 69(4): 859-65, 2007 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17803223
16.
Complex-type-dependent scoring functions in protein-protein docking.
Biophys Chem
; 129(1): 1-10, 2007 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17540496
17.
Construction and application of the weighted amino acid network based on energy.
Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys
; 75(5 Pt 1): 051903, 2007 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17677094
18.
Biologically enhanced sampling geometric docking and backbone flexibility treatment with multiconformational superposition.
Proteins
; 60(2): 319-23, 2005 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15981260
19.
A soft docking algorithm for predicting the structure of antibody-antigen complexes.
Proteins
; 52(1): 47-50, 2003 Jul 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12784367
20.
Protein molecular dynamics with electrostatic force entirely determined by a single Poisson-Boltzmann calculation.
Proteins
; 48(3): 497-504, 2002 Aug 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-12112674