Detalles de la búsqueda
1.
Genome-wide probing of RNA structure reveals active unfolding of mRNA structures in vivo.
Nature
; 505(7485): 701-5, 2014 Jan 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24336214
2.
Evolutionary dynamics and tissue specificity of human long noncoding RNAs in six mammals.
Genome Res
; 24(4): 616-28, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24429298
3.
A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals.
Nature
; 478(7370): 476-82, 2011 Oct 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21993624
4.
Locating protein-coding sequences under selection for additional, overlapping functions in 29 mammalian genomes.
Genome Res
; 21(11): 1916-28, 2011 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21994248
5.
New families of human regulatory RNA structures identified by comparative analysis of vertebrate genomes.
Genome Res
; 21(11): 1929-43, 2011 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21994249
6.
RNA folding with soft constraints: reconciliation of probing data and thermodynamic secondary structure prediction.
Nucleic Acids Res
; 40(10): 4261-72, 2012 May.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22287623
7.
RNAcode: robust discrimination of coding and noncoding regions in comparative sequence data.
RNA
; 17(4): 578-94, 2011 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21357752
8.
Evolutionary footprints of nucleosome positions in yeast.
Trends Genet
; 24(12): 583-7, 2008 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18951646
9.
Optimization of parameters for coverage of low molecular weight proteins.
Anal Bioanal Chem
; 398(7-8): 2867-81, 2010 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20803007
10.
The RNAz web server: prediction of thermodynamically stable and evolutionarily conserved RNA structures.
Nucleic Acids Res
; 35(Web Server issue): W335-8, 2007 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-17452347
11.
Dinucleotide controlled null models for comparative RNA gene prediction.
BMC Bioinformatics
; 9: 248, 2008 May 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18505553
12.
Strategies for measuring evolutionary conservation of RNA secondary structures.
BMC Bioinformatics
; 9: 122, 2008 Feb 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18302738
13.
Mapping of conserved RNA secondary structures predicts thousands of functional noncoding RNAs in the human genome.
Nat Biotechnol
; 23(11): 1383-90, 2005 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16273071
14.
miRNAMap: genomic maps of microRNA genes and their target genes in mammalian genomes.
Nucleic Acids Res
; 34(Database issue): D135-9, 2006 Jan 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16381831
15.
Computational RNomics of drosophilids.
BMC Genomics
; 8: 406, 2007 Nov 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17996037
16.
Prediction of structural noncoding RNAs with RNAz.
Methods Mol Biol
; 395: 503-26, 2007.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17993695
17.
A benchmark of multiple sequence alignment programs upon structural RNAs.
Nucleic Acids Res
; 33(8): 2433-9, 2005.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-15860779
18.
Consensus folding of aligned sequences as a new measure for the detection of functional RNAs by comparative genomics.
J Mol Biol
; 342(1): 19-30, 2004 Sep 03.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-15313604
19.
Evolutionary patterns of non-coding RNAs.
Theory Biosci
; 123(4): 301-69, 2005 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-18202870
20.
Reannotation of the CELO genome characterizes a set of previously unassigned open reading frames and points to novel modes of host interaction in avian adenoviruses.
BMC Bioinformatics
; 4: 55, 2003 Nov 07.
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| MEDLINE | ID: mdl-14604445