Detalles de la búsqueda
1.
A riboswitch separated from its ribosome-binding site still regulates translation.
Nucleic Acids Res
; 51(5): 2464-2484, 2023 03 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36762498
2.
Structure and function analysis of a type III preQ1-I riboswitch from Escherichia coli reveals direct metabolite sensing by the Shine-Dalgarno sequence.
J Biol Chem
; 299(10): 105208, 2023 10.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37660906
3.
Full-Length NAD+-I Riboswitches Bind a Single Cofactor but Cannot Discriminate against Adenosine Triphosphate.
Biochemistry
; 62(23): 3396-3410, 2023 12 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37947391
4.
RNA target highlights in CASP15: Evaluation of predicted models by structure providers.
Proteins
; 91(12): 1600-1615, 2023 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37466021
5.
Cyclic peptides with a distinct arginine-fork motif recognize the HIV trans-activation response RNA in vitro and in cells.
J Biol Chem
; 297(6): 101390, 2021 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-34767799
6.
Analysis of a preQ1-I riboswitch in effector-free and bound states reveals a metabolite-programmed nucleobase-stacking spine that controls gene regulation.
Nucleic Acids Res
; 48(14): 8146-8164, 2020 08 20.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32597951
7.
Nucleobase mutants of a bacterial preQ1-II riboswitch that uncouple metabolite sensing from gene regulation.
J Biol Chem
; 295(9): 2555-2567, 2020 02 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31659117
8.
Co-crystal structures of HIV TAR RNA bound to lab-evolved proteins show key roles for arginine relevant to the design of cyclic peptide TAR inhibitors.
J Biol Chem
; 295(49): 16470-16486, 2020 12 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33051202
9.
Face-time with TAR: Portraits of an HIV-1 RNA with diverse modes of effector recognition relevant for drug discovery.
J Biol Chem
; 294(24): 9326-9341, 2019 06 14.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31080171
10.
Arginine Forks Are a Widespread Motif to Recognize Phosphate Backbones and Guanine Nucleobases in the RNA Major Groove.
J Am Chem Soc
; 142(47): 19835-19839, 2020 11 25.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33170672
11.
Structure of HIV TAR in complex with a Lab-Evolved RRM provides insight into duplex RNA recognition and synthesis of a constrained peptide that impairs transcription.
Nucleic Acids Res
; 46(13): 6401-6415, 2018 07 27.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29961805
12.
Observation of preQ1-II riboswitch dynamics using single-molecule FRET.
RNA Biol
; 16(9): 1086-1092, 2019 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-30328747
13.
Coupling Green Fluorescent Protein Expression with Chemical Modification to Probe Functionally Relevant Riboswitch Conformations in Live Bacteria.
Biochemistry
; 57(31): 4620-4628, 2018 08 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-29897738
14.
Metalloriboswitches: RNA-based inorganic ion sensors that regulate genes.
J Biol Chem
; 292(23): 9441-9450, 2017 06 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28455443
15.
Structural analysis of a class III preQ1 riboswitch reveals an aptamer distant from a ribosome-binding site regulated by fast dynamics.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 112(27): E3485-94, 2015 Jul 07.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26106162
16.
Molecular mechanism for preQ1-II riboswitch function revealed by molecular dynamics.
RNA
; 21(11): 1898-907, 2015 Nov.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-26370581
17.
Structure of a class II preQ1 riboswitch reveals ligand recognition by a new fold.
Nat Chem Biol
; 9(6): 353-5, 2013 Jun.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23584677
18.
Single transcriptional and translational preQ1 riboswitches adopt similar pre-folded ensembles that follow distinct folding pathways into the same ligand-bound structure.
Nucleic Acids Res
; 41(22): 10462-75, 2013 Dec.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24003028
19.
Evidence for the role of active site residues in the hairpin ribozyme from molecular simulations along the reaction path.
J Am Chem Soc
; 136(22): 7789-92, 2014 Jun 04.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-24842535
20.
Structural characterization of nitrosomonas europaea cytochrome c-552 variants with marked differences in electronic structure.
Chembiochem
; 14(14): 1828-38, 2013 Sep 23.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-23908017