Detalles de la búsqueda
1.
A new paradigm for applying deep learning to protein-ligand interaction prediction.
Brief Bioinform
; 25(3)2024 Mar 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38581420
2.
JCcirc: circRNA full-length sequence assembly through integrated junction contigs.
Brief Bioinform
; 24(6)2023 09 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37833842
3.
A fully differentiable ligand pose optimization framework guided by deep learning and a traditional scoring function.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36502369
4.
Design, in silico evaluation, and in vitro verification of new bivalent Smac mimetics with pro-apoptotic activity.
Methods
; 224: 35-46, 2024 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38373678
5.
Generating and screening de novo compounds against given targets using ultrafast deep learning models as core components.
Brief Bioinform
; 23(4)2022 07 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35724626
6.
Improving protein-ligand docking and screening accuracies by incorporating a scoring function correction term.
Brief Bioinform
; 23(3)2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35289359
7.
RabbitQCPlus 2.0: More efficient and versatile quality control for sequencing data.
Methods
; 216: 39-50, 2023 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37330158
8.
COVID19db: a comprehensive database platform to discover potential drugs and targets of COVID-19 at whole transcriptomic scale.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D747-D757, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34554255
9.
circMine: a comprehensive database to integrate, analyze and visualize human disease-related circRNA transcriptome.
Nucleic Acids Res
; 50(D1): D83-D92, 2022 01 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34530446
10.
zPoseScore model for accurate and robust protein-ligand docking pose scoring in CASP15.
Proteins
; 91(12): 1837-1849, 2023 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37606194
11.
RabbitV: fast detection of viruses and microorganisms in sequencing data on multi-core architectures.
Bioinformatics
; 38(10): 2932-2933, 2022 05 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35561184
12.
Deep Learning-Based Bioactive Therapeutic Peptide Generation and Screening.
J Chem Inf Model
; 63(3): 835-845, 2023 02 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36724090
13.
DeepBindBC: A practical deep learning method for identifying native-like protein-ligand complexes in virtual screening.
Methods
; 205: 247-262, 2022 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35878751
14.
Mechanistic insights into dissolved organic matter-driven protistan and bacterial community dynamics influenced by vegetation restoration.
Environ Res
; 227: 115710, 2023 06 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36933634
15.
A Weakly Supervised Learning Method for Cell Detection and Tracking Using Incomplete Initial Annotations.
Int J Mol Sci
; 24(22)2023 Nov 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38003217
16.
RabbitMash: accelerating hash-based genome analysis on modern multi-core architectures.
Bioinformatics
; 37(6): 873-875, 2021 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32845281
17.
RabbitQC: high-speed scalable quality control for sequencing data.
Bioinformatics
; 37(4): 573-574, 2021 05 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32790850
18.
Evaluation of residue-residue contact prediction methods: From retrospective to prospective.
PLoS Comput Biol
; 17(5): e1009027, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34029314
19.
Reconstruction of Full-Length circRNA Sequences Using Chimeric Alignment Information.
Int J Mol Sci
; 23(12)2022 Jun 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35743218
20.
Bioinformatics Screening of Potential Biomarkers from mRNA Expression Profiles to Discover Drug Targets and Agents for Cervical Cancer.
Int J Mol Sci
; 23(7)2022 Apr 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35409328