Detalles de la búsqueda
1.
Ratchet, swivel, tilt and roll: a complete description of subunit rotation in the ribosome.
Nucleic Acids Res
; 51(2): 919-934, 2023 01 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36583339
2.
The energy landscape of the ribosome.
Biopolymers
; 115(2): e23570, 2024 Mar.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38051695
3.
Design and proof of concept for targeted phage-based COVID-19 vaccination strategies with a streamlined cold-free supply chain.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 118(30)2021 07 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34234013
4.
Genetic and Structural Analysis of SARS-CoV-2 Spike Protein for Universal Epitope Selection.
Mol Biol Evol
; 39(5)2022 05 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35511693
5.
pH and the Breast Cancer Recurrent Mutation D538G Affect the Process of Activation of Estrogen Receptor α.
Biochemistry
; 61(6): 455-463, 2022 03 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35238537
6.
Diffuse Ions Coordinate Dynamics in a Ribonucleoprotein Assembly.
J Am Chem Soc
; 144(21): 9510-9522, 2022 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35593477
7.
How Nanopore Translocation Experiments Can Measure RNA Unfolding.
Biophys J
; 118(7): 1612-1620, 2020 04 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32075749
8.
Studying ribosome dynamics with simplified models.
Methods
; 162-163: 128-140, 2019 06 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30935976
9.
Diffusion of tRNA inside the ribosome is position-dependent.
J Chem Phys
; 151(8): 085102, 2019 Aug 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31470725
10.
Drift-diffusion (DrDiff) framework determines kinetics and thermodynamics of two-state folding trajectory and tunes diffusion models.
J Chem Phys
; 151(11): 114106, 2019 Sep 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31542001
11.
Disorder guides domain rearrangement in elongation factor Tu.
Proteins
; 86(10): 1037-1046, 2018 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30035820
12.
SMOG 2: A Versatile Software Package for Generating Structure-Based Models.
PLoS Comput Biol
; 12(3): e1004794, 2016 Mar.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26963394
13.
Order and disorder control the functional rearrangement of influenza hemagglutinin.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 111(33): 12049-54, 2014 Aug 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25082896
14.
Head swivel on the ribosome facilitates translocation by means of intra-subunit tRNA hybrid sites.
Nature
; 468(7324): 713-6, 2010 Dec 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21124459
15.
Generalized Manning Condensation Model Captures the RNA Ion Atmosphere.
Phys Rev Lett
; 114(25): 258105, 2015 Jun 26.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26197147
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Experimental and computational techniques for studying structural dynamics and function of RNA.
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en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31229650
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Topography of funneled landscapes determines the thermodynamics and kinetics of protein folding.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 109(39): 15763-8, 2012 Sep 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23019359
18.
Reduced model captures Mg(2+)-RNA interaction free energy of riboswitches.
Biophys J
; 106(7): 1508-19, 2014 Apr 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24703312
19.
Connecting the kinetics and energy landscape of tRNA translocation on the ribosome.
PLoS Comput Biol
; 9(3): e1003003, 2013.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23555233
20.
Excited states of ribosome translocation revealed through integrative molecular modeling.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 108(47): 18943-8, 2011 Nov 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22080606