Detalles de la búsqueda
1.
ScanNet: an interpretable geometric deep learning model for structure-based protein binding site prediction.
Nat Methods
; 19(6): 730-739, 2022 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35637310
2.
Funneling modulatory peptide design with generative models: Discovery and characterization of disruptors of calcineurin protein-protein interactions.
PLoS Comput Biol
; 19(2): e1010874, 2023 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36730443
3.
Discriminating physiological from non-physiological interfaces in structures of protein complexes: A community-wide study.
Proteomics
; 23(17): e2200323, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37365936
4.
Pep-Whisperer: Inhibitory peptide design.
Proteins
; 90(11): 1886-1895, 2022 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35598299
5.
Design of Disruptors of the Hsp90-Cdc37 Interface.
Molecules
; 25(2)2020 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31952296
6.
SnapDock-template-based docking by Geometric Hashing.
Bioinformatics
; 33(14): i30-i36, 2017 Jul 15.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28881968
7.
Structure-based in silico identification of ubiquitin-binding domains provides insights into the ALIX-V:ubiquitin complex and retrovirus budding.
EMBO J
; 32(4): 538-51, 2013 Feb 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23361315
8.
PinaColada: peptide-inhibitor ant colony ad-hoc design algorithm.
Bioinformatics
; 32(15): 2289-96, 2016 08 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153578
9.
Memdock: an α-helical membrane protein docking algorithm.
Bioinformatics
; 32(16): 2444-50, 2016 08 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27153621
10.
DockStar: a novel ILP-based integrative method for structural modeling of multimolecular protein complexes.
Bioinformatics
; 31(17): 2801-7, 2015 Sep 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25913207
11.
Conformational transitions in human translin enable nucleic acid binding.
Nucleic Acids Res
; 41(21): 9956-66, 2013 Nov.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23980029
12.
Blind prediction of interfacial water positions in CAPRI.
Proteins
; 82(4): 620-32, 2014 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24155158
13.
ParaDock: a flexible non-specific DNA--rigid protein docking algorithm.
Nucleic Acids Res
; 39(20): e135, 2011 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21835777
14.
MultiFit: a web server for fitting multiple protein structures into their electron microscopy density map.
Nucleic Acids Res
; 39(Web Server issue): W167-70, 2011 Jul.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21715383
15.
EvoRator2: Predicting Site-specific Amino Acid Substitutions Based on Protein Structural Information Using Deep Learning.
J Mol Biol
; 435(14): 168155, 2023 07 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37356902
16.
PepCrawler: a fast RRT-based algorithm for high-resolution refinement and binding affinity estimation of peptide inhibitors.
Bioinformatics
; 27(20): 2836-42, 2011 Oct 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21880702
17.
FiberDock: a web server for flexible induced-fit backbone refinement in molecular docking.
Nucleic Acids Res
; 38(Web Server issue): W457-61, 2010 Jul.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-20460459
18.
ScanNet: A Web Server for Structure-based Prediction of Protein Binding Sites with Geometric Deep Learning.
J Mol Biol
; 434(19): 167758, 2022 10 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36116806
19.
Reduced antigenicity of Omicron lowers host serologic response.
bioRxiv
; 2022 Feb 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35194608
20.
Reduced B cell antigenicity of Omicron lowers host serologic response.
Cell Rep
; 41(3): 111512, 2022 10 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36223774