Detalles de la búsqueda
1.
HydRA: Deep-learning models for predicting RNA-binding capacity from protein interaction association context and protein sequence.
Mol Cell
; 83(14): 2595-2611.e11, 2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37421941
2.
ProJect: a powerful mixed-model missing value imputation method.
Brief Bioinform
; 24(4)2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37419612
3.
ProInfer: An interpretable protein inference tool leveraging on biological networks.
PLoS Comput Biol
; 19(3): e1010961, 2023 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36930671
4.
A machine-learning exploration of the exposome from preconception in early childhood atopic eczema, rhinitis and wheeze development.
Environ Res
; 250: 118523, 2024 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38382664
5.
Density-based detection of cell transition states to construct disparate and bifurcating trajectories.
Nucleic Acids Res
; 50(21): e122, 2022 11 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36124665
6.
EnsembleFam: towards more accurate protein family prediction in the twilight zone.
BMC Bioinformatics
; 23(1): 90, 2022 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35287576
7.
PDR: a new genome assembly evaluation metric based on genetics concerns.
Bioinformatics
; 37(3): 289-295, 2021 04 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32761066
8.
Genetic source completeness of HIV-1 circulating recombinant forms (CRFs) predicted by multi-label learning.
Bioinformatics
; 37(6): 750-758, 2021 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33063094
9.
Identifying collateral and synthetic lethal vulnerabilities within the DNA-damage response.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 250, 2021 May 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33992077
10.
Advanced bioinformatics methods for practical applications in proteomics.
Brief Bioinform
; 20(1): 347-355, 2019 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30657890
11.
Allowing mutations in maximal matches boosts genome compression performance.
Bioinformatics
; 36(18): 4675-4681, 2020 09 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33118018
12.
kmcEx: memory-frugal and retrieval-efficient encoding of counted k-mers.
Bioinformatics
; 35(23): 4871-4878, 2019 12 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31038666
13.
Effective Response Metric: a novel tool to predict relapse in childhood acute lymphoblastic leukaemia using time-series gene expression profiling.
Br J Haematol
; 181(5): 653-663, 2018 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29808917
14.
High-speed and high-ratio referential genome compression.
Bioinformatics
; 33(21): 3364-3372, 2017 Nov 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28651329
15.
MapReduce for accurate error correction of next-generation sequencing data.
Bioinformatics
; 33(23): 3844-3851, 2017 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28205674
16.
Class-paired Fuzzy SubNETs: A paired variant of the rank-based network analysis family for feature selection based on protein complexes.
Proteomics
; 17(10): e1700093, 2017 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28390171
17.
NetProt: Complex-based Feature Selection.
J Proteome Res
; 16(8): 3102-3112, 2017 08 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28664733
18.
Protein complex-based analysis is resistant to the obfuscating consequences of batch effects --- a case study in clinical proteomics.
BMC Genomics
; 18(Suppl 2): 142, 2017 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361693
19.
GFS: fuzzy preprocessing for effective gene expression analysis.
BMC Bioinformatics
; 17(Suppl 17): 540, 2016 Dec 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28155629
20.
Advancing Clinical Proteomics via Analysis Based on Biological Complexes: A Tale of Five Paradigms.
J Proteome Res
; 15(9): 3167-79, 2016 09 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27454466