Detalles de la búsqueda
1.
MAST: Phylogenetic Inference with Mixtures Across Sites and Trees.
Syst Biol
; 2024 Feb 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38421146
2.
An assembly-free method of phylogeny reconstruction using short-read sequences from pooled samples without barcodes.
PLoS Comput Biol
; 17(9): e1008949, 2021 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34516547
3.
Correction to: Effective machine-learning assembly for next-generation amplicon sequencing with very low coverage.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 24, 2020 01 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31969110
4.
ModelFinder: fast model selection for accurate phylogenetic estimates.
Nat Methods
; 14(6): 587-589, 2017 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28481363
5.
Effective machine-learning assembly for next-generation amplicon sequencing with very low coverage.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 654, 2019 Dec 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31829137
6.
HaploJuice : accurate haplotype assembly from a pool of sequences with known relative concentrations.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 389, 2018 Oct 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30348075
7.
Computational identification of protein binding sites on RNAs using high-throughput RNA structure-probing data.
Bioinformatics
; 30(8): 1049-1055, 2014 04 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24376038
8.
Mixture models of nucleotide sequence evolution that account for heterogeneity in the substitution process across sites and across lineages.
Syst Biol
; 63(5): 726-42, 2014 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24927722
9.
RNASAlign: RNA structural alignment system.
Bioinformatics
; 27(15): 2151-2, 2011 Aug 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21659321
10.
pgHMA: Application of the heteroduplex mobility assay analysis in phylogenetics and population genetics.
Mol Ecol Resour
; 22(2): 653-663, 2022 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34551204
11.
Genetic Variants of CLPP and M1AP Are Associated With Risk of Non-Small Cell Lung Cancer.
Front Oncol
; 11: 709829, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34604049
12.
Refining orthologue groups at the transcript level.
BMC Genomics
; 11 Suppl 4: S11, 2010 Dec 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21143794
13.
A minimum reporting standard for multiple sequence alignments.
NAR Genom Bioinform
; 2(2): lqaa024, 2020 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33575581
14.
Promoter-sharing by different genes in human genome--CPNE1 and RBM12 gene pair as an example.
BMC Genomics
; 9: 456, 2008 Oct 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18831769
15.
Finding alternative splicing patterns with strong support from expressed sequences on individual exons/introns.
J Bioinform Comput Biol
; 6(5): 1021-33, 2008 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18942164
16.
Reassembling haplotypes in a mixture of pooled amplicons when the relative concentrations are known: A proof-of-concept study on the efficient design of next-generation sequencing strategies.
PLoS One
; 13(4): e0195090, 2018.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29621260
17.
Complete mitochondrial genome of the green-lipped mussel, Perna canaliculus (Mollusca: Mytiloidea), from long nanopore sequencing reads.
Mitochondrial DNA B Resour
; 3(1): 175-176, 2018 Feb 09.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-33490494
18.
Mitochondrial DNA and trade data support multiple origins of Helicoverpa armigera (Lepidoptera, Noctuidae) in Brazil.
Sci Rep
; 7: 45302, 2017 03 28.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-28350004
19.
Structural alignment of RNA with triple helix structure.
J Comput Biol
; 19(4): 365-78, 2012 Apr.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-22468707
20.
Memory efficient algorithms for structural alignment of RNAs with pseudoknots.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 9(1): 161-8, 2012.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-21464506