Detalles de la búsqueda
1.
Many purported pseudogenes in bacterial genomes are bona fide genes.
BMC Genomics
; 25(1): 365, 2024 Apr 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38622536
2.
FindNonCoding: rapid and simple detection of non-coding RNAs in genomes.
Bioinformatics
; 38(3): 841-843, 2022 01 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34636849
3.
Multi-factorial examination of amplicon sequencing workflows from sample preparation to bioinformatic analysis.
BMC Microbiol
; 23(1): 107, 2023 04 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37076812
4.
Evaluating the long-term portrayal of antibiotic resistance in major U.S. newspapers.
BMC Public Health
; 23(1): 1343, 2023 07 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37438767
5.
RNAconTest: comparing tools for noncoding RNA multiple sequence alignment based on structural consistency.
RNA
; 26(5): 531-540, 2020 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32005745
6.
Balancing Trade-Offs Imposed by Growth Media and Mass Spectrometry for Bacterial Exometabolomics.
Appl Environ Microbiol
; 88(20): e0092222, 2022 10 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36197102
7.
AssessORF: combining evolutionary conservation and proteomics to assess prokaryotic gene predictions.
Bioinformatics
; 36(4): 1022-1029, 2020 02 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31532487
8.
Stochastic exits from dormancy give rise to heavy-tailed distributions of descendants in bacterial populations.
Mol Ecol
; 28(17): 3915-3928, 2019 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31355980
9.
Exclusivity offers a sound yet practical species criterion for bacteria despite abundant gene flow.
BMC Genomics
; 19(1): 724, 2018 Oct 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30285620
10.
DesignSignatures: a tool for designing primers that yields amplicons with distinct signatures.
Bioinformatics
; 32(10): 1565-7, 2016 05 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26803162
11.
DECIPHER: harnessing local sequence context to improve protein multiple sequence alignment.
BMC Bioinformatics
; 16: 322, 2015 Oct 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26445311
12.
Exploiting extension bias in polymerase chain reaction to improve primer specificity in ensembles of nearly identical DNA templates.
Environ Microbiol
; 16(5): 1354-65, 2014 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24750536
13.
Automated design of probes for rRNA-targeted fluorescence in situ hybridization reveals the advantages of using dual probes for accurate identification.
Appl Environ Microbiol
; 80(16): 5124-33, 2014 Aug.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-24928876
14.
Mathematical tools to optimize the design of oligonucleotide probes and primers.
Appl Microbiol Biotechnol
; 98(23): 9595-608, 2014 Dec.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25359473
15.
DECIPHER, a search-based approach to chimera identification for 16S rRNA sequences.
Appl Environ Microbiol
; 78(3): 717-25, 2012 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22101057
16.
Multi-stable bacterial communities exhibit extreme sensitivity to initial conditions.
FEMS Microbiol Ecol
; 97(6)2021 06 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34021563
17.
Accurate annotation of protein coding sequences with IDTAXA.
NAR Genom Bioinform
; 3(3): lqab080, 2021 Sep.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34541527
18.
Identification of antibiotic pairs that evade concurrent resistance via a retrospective analysis of antimicrobial susceptibility test results.
Lancet Microbe
; 2(10): e545-e554, 2021 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34632433
19.
SubTap, a Versatile 3D Printed Platform for Eavesdropping on Extracellular Interactions.
mSystems
; 6(4): e0090221, 2021 Aug 31.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34427520
20.
Discordance Among Antibiotic Prescription Guidelines Reflects a Lack of Clear Best Practices.
Open Forum Infect Dis
; 8(1): ofaa571, 2021 Jan.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33447636