Detalles de la búsqueda
1.
PhaGAA: an integrated web server platform for phage genome annotation and analysis.
Bioinformatics
; 39(3)2023 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36882183
2.
Vertical and horizontal gene transfer tradeoffs direct plasmid fitness.
Mol Syst Biol
; 19(2): e11300, 2023 02 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36573357
3.
Temporal encoding of bacterial identity and traits in growth dynamics.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 117(33): 20202-20210, 2020 08 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32747578
4.
Data-driven quantitative modeling of bacterial active nematics.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(3): 777-785, 2019 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30593562
5.
Prophage Hunter: an integrative hunting tool for active prophages.
Nucleic Acids Res
; 47(W1): W74-W80, 2019 07 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31114893
6.
Substantial viral diversity in bats and rodents from East Africa: insights into evolution, recombination, and cocirculation.
Microbiome
; 12(1): 72, 2024 Apr 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38600530
7.
Identifying Phage Sequences From Metagenomic Data Using Deep Neural Network With Word Embedding and Attention Mechanism.
IEEE/ACM Trans Comput Biol Bioinform
; 20(6): 3772-3785, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37812548
8.
Characterization of a novel genus of jumbo phages and their application in wastewater treatment.
iScience
; 26(6): 106947, 2023 Jun 16.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37324530
9.
The multidrug efflux pump MdtEF protects against nitrosative damage during the anaerobic respiration in Escherichia coli.
J Biol Chem
; 286(30): 26576-84, 2011 Jul 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21642439
10.
Advances and challenges in cataloging the human gut virome.
Cell Host Microbe
; 30(7): 908-916, 2022 07 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35834962
11.
DPProm: A Two-Layer Predictor for Identifying Promoters and Their Types on Phage Genome Using Deep Learning.
IEEE J Biomed Health Inform
; 26(10): 5258-5266, 2022 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35867364
12.
Harnessing stepping-stone hosts to engineer, select, and reboot synthetic bacteriophages in one pot.
Cell Rep Methods
; 2(5): 100217, 2022 05 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35637913
13.
Genomic characterization of four novel bacteriophages infecting the clinical pathogen Klebsiella pneumoniae.
DNA Res
; 28(4)2021 Aug 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34390569
14.
Genetic signatures for lineage/sublineage classification of HPV16, 18, 52 and 58 variants.
Virology
; 553: 62-69, 2021 01 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33238224
15.
Intra-host variation and evolutionary dynamics of SARS-CoV-2 populations in COVID-19 patients.
Genome Med
; 13(1): 30, 2021 02 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33618765
16.
Population Bottlenecks and Intra-host Evolution During Human-to-Human Transmission of SARS-CoV-2.
Front Med (Lausanne)
; 8: 585358, 2021.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33659260
17.
Environmental and genetic determinants of plasmid mobility in pathogenic Escherichia coli.
Sci Adv
; 6(4): eaax3173, 2020 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32042895
18.
Multiple approaches for massively parallel sequencing of SARS-CoV-2 genomes directly from clinical samples.
Genome Med
; 12(1): 57, 2020 06 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32605661
19.
MetaPGN: a pipeline for construction and graphical visualization of annotated pangenome networks.
Gigascience
; 7(11)2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30277499
20.
Revised inverse problem algorithm-based prediction of coronary artery stenosis readings from the clinical data of patients with coronary heart diseases.
Comput Assist Surg (Abingdon)
; 22(sup1): 70-78, 2017 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28922944