Detalles de la búsqueda
1.
Alignment-free estimation of sequence conservation for identifying functional sites using protein sequence embeddings.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36631405
2.
Tree visualizations of protein sequence embedding space enable improved functional clustering of diverse protein superfamilies.
Brief Bioinform
; 24(1)2023 01 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36642409
3.
Using explainable machine learning to uncover the kinase-substrate interaction landscape.
Bioinformatics
; 40(2)2024 02 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38244571
4.
Phosformer: an explainable transformer model for protein kinase-specific phosphorylation predictions.
Bioinformatics
; 39(2)2023 02 03.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36692152
5.
Modularity of the hydrophobic core and evolution of functional diversity in fold A glycosyltransferases.
J Biol Chem
; 298(8): 102212, 2022 08.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35780833
6.
Evolution of Functional Diversity in the Holozoan Tyrosine Kinome.
Mol Biol Evol
; 38(12): 5625-5639, 2021 12 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34515793
7.
Lipid-targeting pleckstrin homology domain turns its autoinhibitory face toward the TEC kinases.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 116(43): 21539-21544, 2019 10 22.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-31591208
8.
KinOrtho: a method for mapping human kinase orthologs across the tree of life and illuminating understudied kinases.
BMC Bioinformatics
; 22(1): 446, 2021 Sep 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34537014
9.
GTXplorer: A portal to navigate and visualize the evolutionary information encoded in fold A glycosyltransferases.
Glycobiology
; 31(11): 1472-1477, 2021 12 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34351427
10.
Quantitative Structure-Mutation-Activity Relationship Tests (QSMART) model for protein kinase inhibitor response prediction.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 520, 2020 Nov 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33183223
11.
The crystal structure of the protein kinase HIPK2 reveals a unique architecture of its CMGC-insert region.
J Biol Chem
; 294(37): 13545-13559, 2019 09 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31341017
12.
Emerging roles of the αC-ß4 loop in protein kinase structure, function, evolution, and disease.
IUBMB Life
; 72(6): 1189-1202, 2020 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-32101380
13.
In Vitro Selection of Diversely Functionalized Aptamers.
J Am Chem Soc
; 139(40): 13977-13980, 2017 10 11.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28938065
14.
Enzymatic Synthesis of Sequence-Defined Synthetic Nucleic Acid Polymers with Diverse Functional Groups.
Angew Chem Int Ed Engl
; 55(42): 13164-13168, 2016 10 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27633832
15.
Informatic challenges and advances in illuminating the druggable proteome.
Drug Discov Today
; 29(3): 103894, 2024 Mar.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38266979
16.
Redox Regulation of Brain Selective Kinases BRSK1/2: Implications for Dynamic Control of the Eukaryotic AMPK family through Cys-based mechanisms.
bioRxiv
; 2024 Apr 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38586025
17.
A comprehensive in vivo screen of yeast farnesyltransferase activity reveals broad reactivity across a majority of CXXX sequences.
G3 (Bethesda)
; 13(7)2023 07 05.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37119806
18.
Dark kinase annotation, mining, and visualization using the Protein Kinase Ontology.
PeerJ
; 11: e16087, 2023.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-38077442
19.
Mechanistic and evolutionary insights into isoform-specific 'supercharging' in DCLK family kinases.
bioRxiv
; 2023 Jul 18.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37034755
20.
An allosteric switch between the activation loop and a c-terminal palindromic phospho-motif controls c-Src function.
Nat Commun
; 14(1): 6548, 2023 10 17.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37848415