Detalles de la búsqueda
1.
Novel viruses of the family Partitiviridae discovered in Saccharomyces cerevisiae.
PLoS Pathog
; 19(6): e1011418, 2023 06.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37285383
2.
EfgA is a conserved formaldehyde sensor that leads to bacterial growth arrest in response to elevated formaldehyde.
PLoS Biol
; 19(5): e3001208, 2021 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34038406
3.
Statistical modeling to quantify the uncertainty of FoldX-predicted protein folding and binding stability.
BMC Bioinformatics
; 24(1): 426, 2023 Nov 12.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-37953256
4.
Molecular Modeling Predicts Novel Antibody Escape Mutations in the Respiratory Syncytial Virus Fusion Glycoprotein.
J Virol
; 96(13): e0035322, 2022 07 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35678603
5.
Paired Simulations and Experimental Investigations into the Calcium-Dependent Conformation of Albumin.
J Chem Inf Model
; 62(5): 1282-1293, 2022 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35194993
6.
Predicting peak spectral sensitivities of vertebrate cone visual pigments using atomistic molecular simulations.
PLoS Comput Biol
; 14(1): e1005974, 2018 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29364888
7.
The cis conformation of proline leads to weaker binding of a p53 peptide to MDM2 compared to trans.
Arch Biochem Biophys
; 575: 22-9, 2015 Jun 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25840370
8.
Exploring the ability of the MD+FoldX method to predict SARS-CoV-2 antibody escape mutations using large-scale data.
bioRxiv
; 2024 May 22.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38826284
9.
Impact of the K24N mutation on the transactivation domain of p53 and its binding to murine double-minute clone 2.
Proteins
; 81(10): 1738-47, 2013 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23609977
10.
Effects of the binding of calcium ions on the structure and dynamics of the ΦX174 virus investigated using molecular dynamics.
J Biol Phys
; 38(3): 397-404, 2012 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23729905
11.
The effect of mutations on binding interactions between the SARS-CoV-2 receptor binding domain and neutralizing antibodies B38 and CB6.
Sci Rep
; 12(1): 18819, 2022 11 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36335244
12.
Accurate estimation of solvation free energy using polynomial fitting techniques.
J Comput Chem
; 32(1): 134-41, 2011 Jan 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-20623657
13.
Computational estimation of rainbow trout estrogen receptor binding affinities for environmental estrogens.
Toxicol Appl Pharmacol
; 250(3): 322-6, 2011 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21075131
14.
C5-functionalized DNA, LNA, and α-L-LNA: positional control of polarity-sensitive fluorophores leads to improved SNP-typing.
Chemistry
; 17(11): 3157-65, 2011 Mar 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21328492
15.
A black-box re-weighting analysis can correct flawed simulation data.
Proc Natl Acad Sci U S A
; 105(23): 7982-7, 2008 Jun 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18544653
16.
Implementing and Assessing an Alchemical Method for Calculating Protein-Protein Binding Free Energy.
J Chem Theory Comput
; 17(4): 2457-2464, 2021 Apr 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33709712
17.
Implementation of adaptive integration method for free energy calculations in molecular systems.
PeerJ Comput Sci
; 62020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33457645
18.
Protein Stability in Titan's Subsurface Water Ocean.
Astrobiology
; 20(2): 190-198, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31730377
19.
Assessment of software methods for estimating protein-protein relative binding affinities.
PLoS One
; 15(12): e0240573, 2020.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33347442
20.
Predicting the viability of beta-lactamase: How folding and binding free energies correlate with beta-lactamase fitness.
PLoS One
; 15(5): e0233509, 2020.
Artículo
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| MEDLINE | ID: mdl-32470971