Detalles de la búsqueda
1.
A fast and scalable method for inferring phylogenetic networks from trees by aligning lineage taxon strings.
Genome Res
; 33(7): 1053-1060, 2023 07.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37217252
2.
Hi-GeoMVP: a hierarchical geometry-enhanced deep learning model for drug response prediction.
Bioinformatics
; 40(4)2024 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38614131
3.
How much can deep learning improve prediction of the responses to drugs in cancer cell lines?
Brief Bioinform
; 23(1)2022 01 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34529029
4.
A survey and systematic assessment of computational methods for drug response prediction.
Brief Bioinform
; 22(1): 232-246, 2021 01 18.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31927568
5.
Two results about the Sackin and Colless indices for phylogenetic trees and their shapes.
J Math Biol
; 85(6-7): 69, 2022 11 23.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36418585
6.
Generating normal networks via leaf insertion and nearest neighbor interchange.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 20): 642, 2019 Dec 17.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31842746
7.
ZDOG: zooming in on dominating genes with mutations in cancer pathways.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 740, 2019 Dec 30.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31888434
8.
S-Cluster++: a fast program for solving the cluster containment problem for phylogenetic networks.
Bioinformatics
; 34(17): i680-i686, 2018 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30423060
9.
RecPhyloXML: a format for reconciled gene trees.
Bioinformatics
; 34(21): 3646-3652, 2018 11 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29762653
10.
A program to compute the soft Robinson-Foulds distance between phylogenetic networks.
BMC Genomics
; 18(Suppl 2): 111, 2017 03 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361712
11.
A program for verification of phylogenetic network models.
Bioinformatics
; 32(17): i503-i510, 2016 09 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-27587668
12.
Improved anticancer drug response prediction in cell lines using matrix factorization with similarity regularization.
BMC Cancer
; 17(1): 513, 2017 Aug 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28768489
13.
Profiling the transcription factor regulatory networks of human cell types.
Nucleic Acids Res
; 42(20): 12380-7, 2014 Nov 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-25300490
14.
[Effect of smoking on the microRNAs expression in pneumoconiosis patients].
Zhonghua Lao Dong Wei Sheng Zhi Ye Bing Za Zhi
; 32(9): 686-8, 2014 Sep.
Artículo
en Zh
| MEDLINE | ID: mdl-25511271
15.
Computing the Bounds of the Number of Reticulations in a Tree-Child Network That Displays a Set of Trees.
J Comput Biol
; 31(4): 345-359, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38285528
16.
The k-Robinson-Foulds Dissimilarity Measures for Comparison of Labeled Trees.
J Comput Biol
; 31(4): 328-344, 2024 04.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38271573
17.
Detecting molecular subtypes from multi-omics datasets using SUMO.
Cell Rep Methods
; 2(1)2022 01 24.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35211690
18.
Structural properties of the reconciliation space and their applications in enumerating nearly-optimal reconciliations between a gene tree and a species tree.
BMC Bioinformatics
; 12 Suppl 9: S7, 2011 Oct 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-22151151
19.
Conversion events in gene clusters.
BMC Evol Biol
; 11: 226, 2011 Jul 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-21798034
20.
The Bourque distances for mutation trees of cancers.
Algorithms Mol Biol
; 16(1): 9, 2021 Jun 10.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34112201