Detalles de la búsqueda
1.
scGHOST: identifying single-cell 3D genome subcompartments.
Nat Methods
; 21(5): 814-822, 2024 May.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38589516
2.
Orchestrating information across tissues via a novel multitask GAT framework to improve quantitative gene regulation relation modeling for survival analysis.
Brief Bioinform
; 24(4)2023 07 20.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37427963
3.
MolFeSCue: enhancing molecular property prediction in data-limited and imbalanced contexts using few-shot and contrastive learning.
Bioinformatics
; 40(4)2024 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38426310
4.
HELM-GPT: de novo macrocyclic peptide design using generative pre-trained transformer.
Bioinformatics
; 2024 Jun 12.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38867692
5.
MOCHI enables discovery of heterogeneous interactome modules in 3D nucleome.
Genome Res
; 30(2): 227-238, 2020 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31907193
6.
XGraphBoost: Extracting Graph Neural Network-Based Features for a Better Prediction of Molecular Properties.
J Chem Inf Model
; 61(6): 2697-2705, 2021 06 28.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34009965
7.
Predicting CTCF-mediated chromatin loops using CTCF-MP.
Bioinformatics
; 34(13): i133-i141, 2018 07 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-29949986
8.
pyHIVE, a health-related image visualization and engineering system using Python.
BMC Bioinformatics
; 19(1): 452, 2018 Nov 26.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30477418
9.
Exploiting sequence-based features for predicting enhancer-promoter interactions.
Bioinformatics
; 33(14): i252-i260, 2017 Jul 15.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28881991
10.
Correction to "XGraphBoost: Extracting Graph Neural Network-Based Features for a Better Prediction of Molecular Properties".
J Chem Inf Model
; 61(9): 4820-4822, 2021 Sep 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34477362
11.
GAGE-seq concurrently profiles multiscale 3D genome organization and gene expression in single cells.
Nat Genet
; 2024 May 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38744973
12.
Fiber-based free-space optical coherent receiver with vibration compensation mechanism.
Opt Express
; 21(15): 18434-41, 2013 Jul 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-23938715
13.
scGHOST: Identifying single-cell 3D genome subcompartments.
bioRxiv
; 2023 May 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37292994
14.
PhyGCN: Pre-trained Hypergraph Convolutional Neural Networks with Self-supervised Learning.
bioRxiv
; 2023 Oct 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37873233
15.
AB-Gen: Antibody Library Design with Generative Pre-trained Transformer and Deep Reinforcement Learning.
Genomics Proteomics Bioinformatics
; 21(5): 1043-1053, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37364719
16.
A comprehensive benchmarking with practical guidelines for cellular deconvolution of spatial transcriptomics.
Nat Commun
; 14(1): 1548, 2023 03 21.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36941264
17.
Concurrent profiling of multiscale 3D genome organization and gene expression in single mammalian cells.
bioRxiv
; 2023 Jul 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37546900
18.
Optimization of binding affinities in chemical space with generative pre-trained transformer and deep reinforcement learning.
F1000Res
; 12: 757, 2023.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-38434657
19.
OCMR: A comprehensive framework for optical chemical molecular recognition.
Comput Biol Med
; 163: 107187, 2023 09.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37393787
20.
Predicting the antigenic evolution of SARS-COV-2 with deep learning.
Nat Commun
; 14(1): 3478, 2023 06 13.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37311849