Detalles de la búsqueda
1.
Accurate and efficient protein sequence design through learning concise local environment of residues.
Bioinformatics
; 39(3)2023 03 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-36916746
2.
Seq-SetNet: directly exploiting multiple sequence alignment for protein secondary structure prediction.
Bioinformatics
; 38(4): 990-996, 2022 01 27.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-34849579
3.
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection.
BMC Bioinformatics
; 21(1): 503, 2020 Nov 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33153432
4.
Constructing effective energy functions for protein structure prediction through broadening attraction-basin and reverse Monte Carlo sampling.
BMC Bioinformatics
; 20(Suppl 3): 135, 2019 Mar 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-30925867
5.
Correction to: Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 616, 2019 Nov 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31783729
6.
Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning.
BMC Bioinformatics
; 20(1): 537, 2019 Oct 29.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-31664895
7.
Improving protein fold recognition by extracting fold-specific features from predicted residue-residue contacts.
Bioinformatics
; 33(23): 3749-3757, 2017 Dec 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28961795
8.
Improving prediction of burial state of residues by exploiting correlation among residues.
BMC Bioinformatics
; 18(Suppl 3): 70, 2017 Mar 14.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-28361691
9.
FALCON@home: a high-throughput protein structure prediction server based on remote homologue recognition.
Bioinformatics
; 32(3): 462-4, 2016 Feb 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26454278
10.
Improving residue-residue contact prediction via low-rank and sparse decomposition of residue correlation matrix.
Biochem Biophys Res Commun
; 472(1): 217-22, 2016 Mar 25.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-26920058
11.
Protein Structure Prediction: Challenges, Advances, and the Shift of Research Paradigms.
Genomics Proteomics Bioinformatics
; 21(5): 913-925, 2023 Oct.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-37001856
12.
ProALIGN: Directly Learning Alignments for Protein Structure Prediction via Exploiting Context-Specific Alignment Motifs.
J Comput Biol
; 29(2): 92-105, 2022 02.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-35073170
13.
CopulaNet: Learning residue co-evolution directly from multiple sequence alignment for protein structure prediction.
Nat Commun
; 12(1): 2535, 2021 05 05.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-33953201
14.
Counting of oligomers in sequences generated by markov chains for DNA motif discovery.
J Bioinform Comput Biol
; 7(1): 39-54, 2009 Feb.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-19226659
15.
CLEMAPS: multiple alignment of protein structures based on conformational letters.
Proteins
; 71(2): 728-36, 2008 May 01.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17979193
16.
CLePAPS: fast pair alignment of protein structures based on conformational letters.
J Bioinform Comput Biol
; 6(2): 347-66, 2008 Apr.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-18464327
17.
A cross-species alignment tool (CAT).
BMC Bioinformatics
; 8: 349, 2007 Sep 19.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-17880681
18.
An amino acid substitution matrix for protein conformation identification.
J Bioinform Comput Biol
; 4(3): 769-82, 2006 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-16960974
19.
Clustering of amino acids for protein secondary structure prediction.
J Bioinform Comput Biol
; 2(2): 333-42, 2004 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15297985
20.
Prediction of protein secondary structure based on residue pairs.
J Bioinform Comput Biol
; 2(2): 343-52, 2004 Jun.
Artículo
en Inglés
| MEDLINE | ID: mdl-15297986