Resultados de implementación de una plataforma farmacogenómica basada en tecnologías NGS. Combinación de abordajes asistencial y de investigación / Results of the implementation of a pharmacogenomics platform based on NGS technologies. Combining clinical and research approaches
Artículo
en Español
| IBECS (España) | ID: ibc-218734
Objetivo:
A medida que se incorporan más genes a los procesos farmacogenómicos asistenciales y se otorga más importancia a las variantesraras, el uso de paneles de secuenciación dirigida por captura se ha propuesto como una alternativa muy eficiente atendiendo a sus costes, su rendimiento y la cobertura profunda, característica de los datos de secuenciaciónde nueva generación de alta calidad. El objeto de este trabajo es describirla prevalencia de variantes farmacogenéticas clínicamente procesables descritas previamente en la literatura científica, así como de nuevas variantesidentificadas mediante tecnologías de secuenciación de nueva generacióny evaluar los fármacos potencialmente afectados por estas variantes.
Método:
Se evaluó un panel de 18 genes relacionados con la farmacogenómica clínicamente procesables en 41 individuos con diagnóstico de cáncerde mama que van a recibir tratamiento adyuvante y neoadyuvante. Se estudió la prevalencia de variantes clínicamente procesables previamente descritas enla literatura científica, así como de los fenotipos farmacogenéticos clasificadossegún los estándares de interpretación actuales. Asimismo, se evaluaron lostratamientos farmacológicos potencialmente afectados por las variantes identificadas. Se estimó la prevalencia de variantes posiblemente deletéreas nodescritas previamente seleccionadas con criterios bioinformáticos. (AU)
Objective:
As more genes are incorporated into pharmacogenomiccare processes and more importance is given to rare variants, the use oftargeted capture sequencing panels has been proposed as a very efficient alternative due to their affordability, high throughput, and deep coverage, all of them characteristics of high-quality next-generation sequencingdata. The purpose of this study is to describe the prevalence of clinicallyactionable pharmacogenetic variants previously described in the scientificliterature, as well as that of new variants identified by next-generationsequencing technologies, and to evaluate the drugs potentially affectedby such variants.
Method:
A panel of 18 clinically actionable pharmacogenomics-related genes was evaluated in 41 subjects diagnosed with breast cancerundergoing neoadjuvant treatment. The prevalence of previously described clinically actionable variants as well as of phenotypes classifiedaccording to current interpretation standards was studied. The pharmacological treatments potentially affected by the identified variants were alsoevaluated. An estimation was made of the prevalence of not previouslydescribed, possibly deleterious, variants selected using bioinformaticscriteria. (AU)