Estimate of genetic parameters for carcass traits and visual scores inmeat sheep using Bayesian inference via threshold and linear models

ABSTRACT: The aim of this study was to estimate the variance components and genetic parameters for marbling in the ribeye area (MRA) and body condition score (BCS) using Bayesian inference via mixed linear and threshold animal models. Data were obtained from Santa Ines breed sheep reared in the Brazilian Mid-North region. Analyses considering the Monte Carlo methods were performed with Markov chains from 500000 cycles onward. A 200000-cycle initial burn-in was considered with values taken at every 250 cycles, in a total of 1200 samples. The Monte Carlo Error deviations were low for the means heritability in all chains by both linear and threshold models. Additive variances estimated by threshold model were higher than those estimated by the linear model. Marble meat from the ribeye area and body condition score can be used as selection criteria to obtain genetic progress in Santa Inês sheep.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi estimar componentes de variância e parâmetros genéticos para marmoreio na área de olho de lombo (MOL) e escore de condição corporal (ECC) usando Inferência Bayesiana por meio dos modelos animais linear misto e de limiar. Os dados foram obtidos em rebanhos de ovinos da raça Santa Inês criados no Meio-Norte do Brasil. As análises, considerando os métodos de Monte Carlo, foram realizadas com cadeias de Markov a partir de 500000 ciclos. Considerou-se burn-in inicial de 200000 ciclos com valores tomados a cada 250 ciclos, obtendo-se 1200 amostras. Os desvios do erro de Monte Carlo foram baixos para as herdabilidades médias em todas as cadeias, tanto pelo modelo linear quanto de limiar. As variâncias aditivas, estimadas pelo modelo de limiar, foram maiores que aquelas obtidas pelo modelo linear. O marmoreio na área de olho de lombo e o escore da condição corporal podem ser usados como critérios de seleção para obter progresso genético em ovinos da raça Santa Inês.

Estrutura e distribuição geográfica do rebanho de ovinos Santa Inês no estado do Piauí

This study aimed to describe the quantity, distribution and structure of the Santa Inês sheep flock in the Piauí state. We analyzed data of genealogical records of Santa Inês variety, maintained by the Brazilian Association of Breeders Sheep (ARCO), from 1992 to 2012. Descriptive statistical analyzes were performed in order to know how the Santa Inês herd is structured. We classified the herd according to its organizational structure, determined according to the origin and the use of the breeders, using the program ENDOG.v.4.8. The registration of animals of Santa Ines variety, in Piauí, started in 1990, and highest representation was verified in the period from 1993 to 2001. As for the structure of the herds, 56.8% were classified as multiplying livestocks (intermediate stratum of the pyramid) and 43.2% as commercial herds (base of the pyramid), and there was neither nucleus nor isolated herds. The lack of nucleus herds of Santa Inês variety in the state may be one of the causes of the reduction in the number of animals recorded in recent years in Piauí.

Objetivou-se descrever o quantitativo, distribuição e estrutura do rebanho de ovino da raça Santa Inês no estado do Piauí. Foram analisados dados de registros genealógicos da raça Santa Inês, mantidos pela Associação Brasileira de Criadores de Ovinos (ARCO), referentes ao período de 1992 a 2012. Foram realizadas análises estatísticas descritivas de modo a conhecer como o rebanho Santa Inês está estruturado. Foi realizada a classificação do rebanho quanto a sua estrutura organizacional, determinada com base na origem e uso dos reprodutores, utilizando-se o programa ENDOG. v.4.8. O registro dos animais da raça Santa Inês, no Piauí, teve inicio em 1990, e a maior representatividade foi verificada no período de 1993 a 2001. Quanto à estrutura dos rebanhos, 56,8% foram classificados como rebanhos multiplicadores (estrato intermediário da pirâmide) e 43,2% como rebanhos comerciais (base da pirâmide), sendo que não se observou nenhum rebanho núcleo e nem isolado. A falta de rebanhos núcleo da raça no Estado pode ser uma das causas da redução do número de animais registrados nos últimos anos no Piauí.

Environmental and genetic aspects of reproductive and productive traits in dairy goats using Gibbs sampling / Aspectos ambientais e genéticos de características reprodutivas e produtiva em cabras leiteiras utilizando amostragem de Gibbs

This study aimed to evaluate the use of mineral and mineral protein supplement in finishing phase Nellore, grazing Brachiaria brizantha during the rainy season, and its implications for forage intake, animal performance and nutrient digestibility. The fieldwork was located in an area of 26 ha, divided into four paddocks of approximately 6.5 hectares (ha), formed with Brachiaria brizantha Marandu. We used 18 Nellore with 28 months live weight of 400.5 ± 7.5kg and castrated in two treatments: mineral supplementation until the termination, and mineral supplementation of low protein intake to termination. There was no effect on the consumption of pasture, neutral detergent fiber, crude protein, ether extract, non-fiber carbohydrates, ash and total digestible nutrients. The animal performance and feed conversion were not affected by supplementation. There was no effect on the coefficient of digestibility of dry matter, organic matter, crude protein, ether extract and neutral detergent fiber. There was an effect of protein salt supplementation on the digestibility of non-fiber carbohydrates. In the rainy season the utilization of mineral salt allows the use of animals in pastures.

Objetivou-se estudar efeitos ambientais e genéticos sobre cabras mestiças, exploradas para a produção leiteira. Foram estimados componentes de covariância e parâmetros genéticos das características: idade ao primeiro parto; intervalo de partos e produção de leite em análise uni e multicaracterística, mediante a estatística Bayesiana sob modelo animal. As análises genéticas foram realizadas com cadeias de 1.000.000 de ciclos. Considerou-se o burn-in dos 100.000 valores iniciais, tomados a cada 300 ciclos, para se obter a distribuição a posteriori com 3.000 amostras. As médias obtidas para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite foram 581,68 79,44; 322,89 132,02 dias e 226,99 89,72kg de leite, respectivamente. Todos os efeitos incluídos no modelo foram significativos, exceto o tipo de nascimento para o intervalo de partos e produção de leite. As herdabilidades, em análise unicaracterística, foram 0,14; 0,05 e 0,10 para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite, respectivamente. Na mesma ordem, em análise multicaracterística, as herdabilidades foram de 0,16; 0,06 e 0,11. As estimativas de repetibilidade, para as características intervalo de partos e produção de leite, foram 0,10 e 0,20 respectivamente. As características estudadas mostraram-se fortemente influenciadas pelo ambiente. Os valores da repetibilidade indicam a necess

Aspectos ambientais e genéticos de características reprodutivas e produtiva em cabras leiteiras utilizando amostragem de Gibbs

This study aimed to evaluate the use of mineral and mineral protein supplement in finishing phase Nellore, grazing Brachiaria brizantha during the rainy season, and its implications for forage intake, animal performance and nutrient digestibility. The fieldwork was located in an area of 26 ha, divided into four paddocks of approximately 6.5 hectares (ha), formed with Brachiaria brizantha Marandu. We used 18 Nellore with 28 months live weight of 400.5 ± 7.5kg and castrated in two treatments: mineral supplementation until the termination, and mineral supplementation of low protein intake to termination. There was no effect on the consumption of pasture, neutral detergent fiber, crude protein, ether extract, non-fiber carbohydrates, ash and total digestible nutrients. The animal performance and feed conversion were not affected by supplementation. There was no effect on the coefficient of digestibility of dry matter, organic matter, crude protein, ether extract and neutral detergent fiber. There was an effect of protein salt supplementation on the digestibility of non-fiber carbohydrates. In the rainy season the utilization of mineral salt allows the use of animals in pastures.

Objetivou-se estudar efeitos ambientais e genéticos sobre cabras mestiças, exploradas para a produção leiteira. Foram estimados componentes de covariância e parâmetros genéticos das características: idade ao primeiro parto; intervalo de partos e produção de leite em análise uni e multicaracterística, mediante a estatística Bayesiana sob modelo animal. As análises genéticas foram realizadas com cadeias de 1.000.000 de ciclos. Considerou-se o burn-in dos 100.000 valores iniciais, tomados a cada 300 ciclos, para se obter a distribuição a posteriori com 3.000 amostras. As médias obtidas para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite foram 581,68 ± 79,44; 322,89 ± 132,02 dias e 226,99 ± 89,72kg de leite, respectivamente. Todos os efeitos incluídos no modelo foram significativos, exceto o tipo de nascimento para o intervalo de partos e produção de leite. As herdabilidades, em análise unicaracterística, foram 0,14; 0,05 e 0,10 para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite, respectivamente. Na mesma ordem, em análise multicaracterística, as herdabilidades foram de 0,16; 0,06 e 0,11. As estimativas de repetibilidade, para as características intervalo de partos e produção de leite, foram 0,10 e 0,20 respectivamente. As características estudadas mostraram-se fortemente influenciadas pelo ambiente. Os valores da repetibilidade indicam a necessidade de se tomar mais medidas antes da decisão de manter ou descartar o animal. As análises multicaracterísticas levaram a estimativas ligeiramente maiores de herdabilidade.

Environmental and genetic aspects of reproductive and productive traits in dairy goats using Gibbs sampling / Aspectos ambientais e genéticos de características reprodutivas e produtiva em cabras leiteiras utilizando amostragem de Gibbs

This study aimed to evaluate the use of mineral and mineral protein supplement in finishing phase Nellore, grazing Brachiaria brizantha during the rainy season, and its implications for forage intake, animal performance and nutrient digestibility. The fieldwork was located in an area of 26 ha, divided into four paddocks of approximately 6.5 hectares (ha), formed with Brachiaria brizantha Marandu. We used 18 Nellore with 28 months live weight of 400.5 ± 7.5kg and castrated in two treatments: mineral supplementation until the termination, and mineral supplementation of low protein intake to termination. There was no effect on the consumption of pasture, neutral detergent fiber, crude protein, ether extract, non-fiber carbohydrates, ash and total digestible nutrients. The animal performance and feed conversion were not affected by supplementation. There was no effect on the coefficient of digestibility of dry matter, organic matter, crude protein, ether extract and neutral detergent fiber. There was an effect of protein salt supplementation on the digestibility of non-fiber carbohydrates. In the rainy season the utilization of mineral salt allows the use of animals in pastures.

Objetivou-se estudar efeitos ambientais e genéticos sobre cabras mestiças, exploradas para a produção leiteira. Foram estimados componentes de covariância e parâmetros genéticos das características: idade ao primeiro parto; intervalo de partos e produção de leite em análise uni e multicaracterística, mediante a estatística Bayesiana sob modelo animal. As análises genéticas foram realizadas com cadeias de 1.000.000 de ciclos. Considerou-se o burn-in dos 100.000 valores iniciais, tomados a cada 300 ciclos, para se obter a distribuição a posteriori com 3.000 amostras. As médias obtidas para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite foram 581,68 79,44; 322,89 132,02 dias e 226,99 89,72kg de leite, respectivamente. Todos os efeitos incluídos no modelo foram significativos, exceto o tipo de nascimento para o intervalo de partos e produção de leite. As herdabilidades, em análise unicaracterística, foram 0,14; 0,05 e 0,10 para idade ao primeiro parto, intervalo de partos e produção de leite, respectivamente. Na mesma ordem, em análise multicaracterística, as herdabilidades foram de 0,16; 0,06 e 0,11. As estimativas de repetibilidade, para as características intervalo de partos e produção de leite, foram 0,10 e 0,20 respectivamente. As características estudadas mostraram-se fortemente influenciadas pelo ambiente. Os valores da repetibilidade indicam a necess