ABSTRACT
The increase in lipid plasma values is an important cardiovascular risk factor. Lipoprotein lipase (LPL) plays an important role in the lipoprotein metabolism and metabolic and genetic factors may influence its levels and functions. The S447X variant of the lipoprotein lipase gene is associated with changes in plasma lipids in different populations. The objective of this research was to analyze the S447X variant of the LPL gene and its relation with plasma lipids of individuals in Zulia state, Venezuela. With this purpose, we studied 75 individuals (34 men and 41 women) between 20 and 60 years of age. Each subject had a medical history which included family history, anthropometric characteristics, nutritional status evaluation and biochemical tests. Genomic DNA was extracted for the molecular study and the polymerase chain reaction was used, followed by enzyme digestion, for restriction fragments length polymorphisms using the Hinf I enzyme. The individuals studied had normal levels of blood glucose, triglycerides, total cholesterol and low density lipoproteins (LDL-C) and slightly decreased levels of high density lipoproteins (HDL-C). The genotypic distribution of the LPL gene S447X variant in the studied population was 90.6% for the homozygous genotype SS447 and 9.4% for the heterozygote SX447. The genotype 447XX was not identified. The population was found in Hardy Weinberg genetic equilibrium. No association between the S447X polymorphism of lipoprotein lipase gene and plasma lipids was observed.
Subject(s)
Lipids/blood , Lipoprotein Lipase/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide , Adult , Blood Glucose/analysis , Body Mass Index , DNA Mutational Analysis , Female , Genotype , Humans , Insulin/analysis , Male , Middle Aged , Polymerase Chain Reaction , Polymorphism, Restriction Fragment Length , Venezuela , Young AdultABSTRACT
El aumento en los valores de los lípidos sanguíneos, constituye un importante factor de riesgo cardiovascular. La lipoproteína lipasa (LPL) juega un papel importante en el metabolismo lipoproteico. Factores metabólicos y genéticos pueden influir en la función de la LPL. La variante S447X de la LPL se ha asociado con cambios en el perfil lipídico en diferentes poblaciones. El objetivo de esta investigación fue analizar la relación entre la variante S447X del gen de la LPL y lípidos plasmáticos de individuos del Estado Zulia, Venezuela. Se estudiaron 75 individuos entre 20 y 60 años, 34 hombres y 41 mujeres. A cada individuo se le realizó una historia clínica con antecedentes familiares, características antropométricas, estado nutricional y pruebas bioquímicas. Para el estudio molecular, se extrajo el ADN genómico, se utilizó la reacción en cadena de la polimerasa (RCP) seguida de digestión enzimática para polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción utilizando la enzima Hinf I. Los individuos estudiados presentaron niveles normales de glicemia, triglicéridos, colesterol total, lipoproteínas de baja densidad (C-LDL) y niveles ligeramente disminuidos de las lipoproteínas de alta densidad (C-HDL). La distribución genotípica dela variante S447X del gen LPL fue 90,6% para el genotipo homocigoto 447SS y 9,4% para el genotipo heterocigoto 447SX; no se identificó el genotipo 447XX. La población se ajustó al equilibrio genético de Hardy Weinberg. No se encontró relación entre el polimorfismo S447X del gen LPL y los valores lipídicos plasmáticos.
The increase in lipid plasma values is an important cardiovascular risk factor. Lipoprotein lipase (LPL) plays an important role in the lipoprotein metabolism and metabolic and genetic factors may influence its levels and functions. The S447X variant of the lipoprotein lipase gene is associated with changes in plasma lipids in different populations. The objective of this research was to analyze the S447X variant of the LPL gene and its relation with plasma lipids of individuals in Zulia state, Venezuela. With this purpose, we studied 75 individuals (34 men and 41 women) between 20 and 60 years of age. Each subject had a medical history which included family history, anthropometric characteristics, nutritional status evaluation and biochemical tests. Genomic DNA was extracted for the molecular study and the polymerase chain reaction was used, followed by enzyme digestion, for restriction fragments length polymorphisms using the Hinf I enzyme. The individuals studied had normal levels of blood glucose, triglycerides, total cholesterol and low density lipoproteins (LDL-C) and slightly decreased levels of high density lipoproteins (HDL-C). The genotypic distribution of the LPL gene S447X variant in the studied population was 90.6% for the homozygous genotype SS447 and 9.4% for the heterozygote SX447. The genotype 447XX was not identified. The population was found in Hardy Weinberg genetic equilibrium. No association between the S447X polymorphism of lipoprotein lipase gene and plasma lipids was observed.
Subject(s)
Adult , Female , Humans , Male , Middle Aged , Young Adult , Lipids/blood , Lipoprotein Lipase/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide , Body Mass Index , Blood Glucose/analysis , DNA Mutational Analysis , Genotype , Insulin/analysis , Polymerase Chain Reaction , Polymorphism, Restriction Fragment Length , VenezuelaABSTRACT
Con el objeto de evaluar la fertilidad al primer servicio (FPS) de novillas doble propósito se llevó a cabo una investigación a partir de la información obtenida de dos rebaños comerciales. Se utilizó un total de 6.823 registros provenientes de animales cruzados. La variable respuesta fue FPS de las novillas. Los análisis fueron realizados bajo dos enfoques: frecuentista y Bayesiano. Para el primero se utilizó un modelo animal simple que incluía los efectos fijos discretos de rebaño, grupo racial y año-época de servicio, así como las covariables edad al primer servicio y peso al destete, ambos en forma cuadrática. Además, incluyó los efectos aleatorios genético aditivo directo del animal y el del error. En el primer caso, los análisis se realizaron con el programa MTDFREML. Mientras que en el segundo caso, los datos fueron analizados con el mismo modelo animal en forma umbral univariado, para lo cual fue usado el programa MTGSAM. Bajo este último enfoque, el tamaño de la cadena de muestreo, el período de entrenamiento y el filtrado fueron aproximados con el programa GIBBSIT, en tanto que el análisis de la distribución posterior de las muestras fue realizado con el programa GIBANAL. La longitud total de la cadena fue de 136.000 muestras, descartándose las primeras 1.000 y estableciéndose un filtrado de cada 14vo elemento de la secuencia. El porcentaje global de FPS fue de 65%. Bajo el enfoque frecuentista, el índice de herencia fue de 0,03 ± 0,02, el cual al ser transformado a la escala normal subyacente correspondió a 0,05, mientras que bajo el enfoque Bayesiano el análisis de las 9.642 muestras reflejaron que la media de la distribución posterior del índice de herencia fue de 0,0735; la mediana de la misma distribución fue de 0,0650, con estimadores en el rango entre 0,0130 y 0,2270. Se concluye que la selección por esta variable sólo podría producir cambios muy lentos en la población.
In order of evaluating first service fertility (FPS) on dual purpose heifers, this research was carry out with the electronic records from two commercial herds. A total of 6,823 records from crossbred animals. The response variable was first service fertility of the heifers. The analyses were realized under two approaches: classic and Bayesian. For the classic analysis, it was used a simple animal model that included the discrete fixed effects of herd, breed group and year-season of service, as well as the covariates age at the first service and weaning weight, both in quadratic form. In addition, it included the random additive direct genetic effect of the animal and the residual. In the first case, the analyses were realized with the program MTDFREML. Whereas in the second case, the data were analyzed with the same model animal in a threshold form, for which was used the program MTGSAM. Under this approach the size of the sampling chain, the burn in period and the thinning rate were approximated with GIBBSIT program, whereas the analysis of posterior distribution of the sampling chain were realized with program GIBANAL. The overall length of the chain was 136,000 samples, discarding the first 1,000 and settling down a thinning rate retaining each 14th element of the sequence. The global percentage of FPS was of 65%. Under the classic approach the heritability was 0.03 ± 0.02, which once transformed to the underlying normal scale raised to 0.05. Meanwhile under the Bayesian approach the analysis of the 9,642 samples reflected that the average of the posterior distribution of the heritability was 0.0735; the median of the same distribution was 0.0650, with estimators in the rank between 0.0130 and 0.2270. Selection for this variable could only produce very slow changes in the population.
ABSTRACT
Con el objeto de caracterizar el gen de la beta-lactoglobulina (BLG) en la raza Criollo Limonero, se utilizó la técnica PCR-RFLP en 163 animales puros de la estación local Carrasquero (Carrasquero-estado Zulia), los genotipos fueron determinados a través de electroforesis en geles de agarosa. Las frecuencias obtenidas del locus de la BLG fueron A (0,22) y B (0,78) y las frecuencias genotípicas fueron AA (0,07 ); AB (0,29) y BB (0,64), la población estudiada se encuentra en equilibrio de Hardy-Weinberg (P<0,05), los resultados indican que la frecuencia alélica del alelo B fue más alta que la de A, siendo esto importante, ya que se han determinado los efectos de esta variante alélica de la BLG sobre la cantidad de grasa y proteínas en la leche, la selección a favor del alelo B en la población conllevará a una mejora en la calidad y rendimiento en la producción de queso, estos resultados representan un valioso aporte al conocimiento de esta raza y de su importancia, ya que, representa una alternativa para sistemas dirigidos a la producción de queso.
In order to characterize the beta-lactoglobulina gene (BLG) in the Limonero Creole cattle through PCR-RFLP technique, 163 purebreed animals were used from the Carrasquero local station (Carrasquero-Zulia State), genotypes were determined through gel electroforesis in agarosa. Gene and genotypic frequencies obtained were A (0.22) and B (0.78) and AA (0.07), AB (0.24) and BB (0.64) respectively, the population is in equilibrium of Hardy-Weinberg with (P<0.05), the results indicate that the alelic frequency of was more high B but that A, being this important one, since the effects of the variants of the BLG on the amount of fat and proteins in milk have been determined, the selection in favor of allele B in the population will entail to an improvement in the quality and yield in the cheese production, these results represent a valuable contribution the knowledge of this race and its importance, since, represents an alternative for systems directed to the cheese production.
ABSTRACT
The aim of this study was to determine the association of the Gly482Ser polymorphism of the PGC-1 gene with insulin resistance and type 2 diabetes mellitus in subjects from the city of Maracaibo. The study was performed on 64 no-diabetic subjects (36 without insulin resistance and 28 with insulin resistance) and 13 with type 2 diabetes. A clinical and nutritional history was carried out and the evaluation of anthropometric parameters was included. Fasting serum glucose, fasting serum insulin, total cholesterol, HDL-C and LDL-C, were measured. The Gly482Ser polymorphism was detected by PCR-RFLP. It was found that the allelic frequencies for A and G were 0.36 and 0.64, respectively. The population was found in genetic equilibrium of Hardy Weinberg. The genotypes of the polymorphism Gly482Ser were not associated with insulin resistance and type 2 diabetes mellitus (OR = 1.320, p = 0.74; OR = 2, p = 0.47 respectively). Nevertheless, the diabetic subjects with the genotype AA presented values of LDL-C higher (p < 0.05) than the individuals with the genotypes GG and GA. The diabetics with the genotype GA showed significantly higher concentrations of triglycerides (>150 mg/dL) compared with the genotype GG. According to the results, the polymorphism Gly482Ser of the PGC-1 gene would be able to contribute to the cardiovascular risk in type 2 diabetics, while in the insulin resistant individuals, this polymorphism was not associated with cardiovascular risk factors.
Subject(s)
Diabetes Mellitus, Type 2/genetics , Heat-Shock Proteins/genetics , Insulin Resistance/genetics , Polymorphism, Single Nucleotide , Transcription Factors/genetics , Adult , Amino Acid Substitution , Blood Glucose/analysis , Cholesterol/blood , Diabetes Mellitus, Type 2/blood , Female , Genotype , Humans , Hypertriglyceridemia/blood , Hypertriglyceridemia/etiology , Insulin/blood , Male , Middle Aged , Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma Coactivator 1-alpha , Polymerase Chain Reaction , Polymorphism, Restriction Fragment Length , Triglycerides/blood , Urban Population/statistics & numerical data , Venezuela/epidemiologyABSTRACT
Con el objeto de estudiar el polimorfismo del gen CSN3 en la raza bovina Criollo Limonero, se extrajeron muestras séricas de 163 individuos (machos y hembras), los cuales fueron caracterizados mediante la técnica PCR-RFLP. Los resultados obtenidos indican que las frecuencias encontradas correspondieron a 0,11; 0,56 y 0,33 para los AA, AB y BB, respectivamente, correspondiendo a frecuencias alélicas de 0,39 para el alelo A y 0,61 para el B, respectivamente. Cabe destacar que a partir de esta información de la CSN3 y su relación con caracteres, tales como la producción de leche y rendimiento quesero, se pueden llevar a cabo planes de mejoramiento asistido por marcadores, garantizando el mantenimiento de la variabilidad genética de estas poblaciones locales que se caracterizan por censos reducidos y la amenaza constante por cruzamientos con razas mejoradoras o comerciales, que buscan incrementar el volumen de producción de leche en detrimento de la calidad del producto; así mismo, se indica la ventaja potencial que presenta la leche del ganado Criollo Limonero en la producción de quesos, por mostrar mayoritariamente alelos del tipo B de la CSN3.
In order to assess the polymorphism of CSN3 gen in Limonero Creole breed, blood samples were collected from 163 male and female individuals, with which characterization through RFLP-PCR was conducted. Results showed that genotypic frequencies were 0.11, 0.56 and 0.33 for AA, AB and BB, respectively. Allelic frequencies were 0.39 and 0.61 for allele A and B, accordingly. It is important to mention that with this information of CSN3 and its relationship with some traits such as milk production and cheese productivity, markers-assisted genetic improvement plans can be undertaken, which would maintain genetic variability of these local populations characterized by small numbers of animals and by the constant threat of crossbreeding with improved or commercial breeds, with the objective of increasing milk production over product quality; moreover, a potential advantage of Limonero Creole breed in milk production by its having mainly B-type alleles in CSN3 is shown.
Subject(s)
Cattle , Animals , Caseins/genetics , DNA , Polymorphism, Genetic , Receptors, Opioid, kappa , Polymerase Chain Reaction/methods , Polymerase Chain Reaction/veterinary , Veterinary MedicineABSTRACT
El objetivo de este estudio fue determinar la asociación entre el polimorfismo Gly482Ser del gen PGC-1 con resistencia a la insulina y la diabetes mellitus tipo 2 en individuos de la ciudad de Maracaibo. Se estudiaron 64 individuos no diabético (36 sin resistencia a la insulina, 28 resistentes a la insulina) y 13 diabéticos tipo 2. Se realizó una historia clínica nutricional que incluyó la evaluación de parámetros antropométricos. Se midieron los niveles de glicemia e insulina basal, colesterol total, HDL-C y LDL-C. El polimorfismo Gly482Ser fue detectado empleando la reacción en cadena de la polimerasa y polimorfismo de restricción de fragmentos largos. Se encontró que las frecuencias alélicas para A y G resultaron 0,36 y 0,64 respectivamente. La población se encontró en equilibrio genético de Hardy Weinberg. Al asociar los genotipos del polimorfismo Gly482Ser con la resistencia a la insulina y la diabetes mellitus tipo 2, no se encontró asociación estadística significativa (OR=1,320, p=0,74; OR=2, p=0,47 respectivamente). Sin embargo, los individuos diabéticos con genotipo AA presentaron valores de LDL-C más elevados (p<0,05) que los individuos con el genotipo GG y GA. Los diabéticos con el genotipo GA mostraron concentraciones significativamente elevadas de triglicéridos (>150 mg/dL) comparados con los del genotipo GG. De acuerdo a los resultados obtenidos, el polimorfismo Gly482Ser del gen PGC-1 podría contribuir al riesgo cardiovascular en los individuos diabéticos tipo 2, mientras que en los individuos resistentes a la insulina este polimorfismo no estuvo asociado a factores de riesgo cardiovascular.
The aim of this study was to determine the association of the Gly482Ser polymorphism of the PGC-1 gene with insulin resistance and type 2 diabetes mellitus in subjects from the city of Maracaibo. The study was performed on 64 no-diabetic subjects (36 without insulin resistance and 28 with insulin resistance) and 13 with type 2 diabetes. A clinical and nutritional history was carried out and the evaluation of anthropometric parameters was included. Fasting serum glucose, fasting serum insulin, total cholesterol, HDL-C and LDL-C, were measured. The Gly482Ser polymorphism was detected by PCR-RFLP. It was found that the allelic frequencies for A and G were 0.36 and 0.64, respectively. The population was found in genetic equilibrium of Hardy Weinberg. The genotypes of the polymorphism Gly482Ser were not associated with insulin resistance and type 2 diabetes mellitus (OR=1.320, p=0.74; OR = 2, p=0.47 respectively). Nevertheless, the diabetic subjects with the genotype AA presented values of LDL-C higher (p<0.05) than the individuals with the genotypes GG and GA. The diabetics with the genotype GA showed significantly higher concentrations of triglycerides (>150 mg/dL) compared with the genotype GG. According to the results, the polymorphism Gly482Ser of the PGC-1 gene would be able to contribute to the cardiovascular risk in type 2 diabetics, while in the insulin resistant individuals, this polymorphism was not associated with cardiovascular risk factors.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Diabetes Mellitus, Type 1 , Insulin Resistance , Peroxisome Proliferators , Polymorphism, Genetic , Polymerase Chain Reaction/methods , Nutrition AssessmentABSTRACT
En las explotaciones porcinas de Venezuela, no es común comercializar canales provenientes de machos enteros a pesar de las ventajas que ofrece su producción, esto es debido a la preocupación de que un porcentaje indeterminado de canales presenten el defecto sensorial denominado olor sexual. Por ello se planificó un estudio con el objetivo de determinar el efecto de la condición sexual (machos enteros y castrados) y distintos pesos al sacrificio (83,8 ± 6,3; 95 ±5 ,0 y 106±6,0) sobre las características de la canal y calidad de la carne de cerdo. Para ello, se utilizaron 84 cerdos (42 machos castrados y 42 machos enteros), provenientes del cruzamiento de hembras F1 (Yorkshire × Landrace) y machos Dalland Tempo (B80) de la línea comercial Topigs. Los resultados muestran que los cerdos machos enteros presentaron menor espesor de grasa subcutánea que los cerdos castrados (P < 0,01). El área del ojo del lomo de los machos enteros superó en un 12,86 por ciento a los castrados (P < 0,01). Los cerdos machos enteros presentaron menor pérdida por goteo a las 24h y mayores pérdidas por cocción y resistencia al corte (P<0,01). El análisis sensorial reveló que los consumidores no fueron capaces de detectar el olor sexual (olor a orina) principal desventaja en el uso de éstas carnes en los rangos de pesos evaluados en el presente estudio. El uso de machos enteros es una alternativa viable para los productores por presentar mejores características de la canal que los machos castrados, esto sin detrimento de la calidad en sus carnes.
In Venezuela, the pig production systems is not common to market carcasses coming from pigs in spite of its multiple advantages. This is due to the concerns arisen by the detection of sensory defect called boar taint in an undetermined percentage of carcasses. The objective of this study was to determine the effect of sexual condition (noncastrated or boars and castrated males) and different weights at slaughter (83.8 ± 6.3, 95 ± 5.0 and 106 ± 6) on carcass characteristics and meat quality. In order to persue this objective 84 crossbred pigs [DallandTempo (B80) X F1 Yorkshire × Landrace], including 42 boars and 42 castrated males were used. Non-castrated male pigs had lower backfat than castrated ones (P <0.01). The loin eye area of boars was 12.86 percent greater of that of castrated males (P <0.01). Boars had a lower drip loss at 24h and a higher cooking loss and shear force than castrated males (P<0.01). The sensorial analysis showed that consumers were not capable of detecting the boar taint defect, which is a main disadvantage of the use of boar meat in the weight range evaluated in the present study. The use of boars is a good alternative for pig producers due to better carcass characteristics compared to castrated males, without detriment of its meat quality.
Subject(s)
Animals , Commerce/methods , Sexual Behavior, Animal , Swine , Weights and Measures , Veterinary MedicineABSTRACT
El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia del polimorfismo Pro12Ala del gen PPARgamma2 en individuos no emparentados con síndrome metabólico de la ciudad de Maracaibo. Se seleccionaron 50 individuos (22 con síndrome metabólico y 28 sin síndrome metabólico) entre 22 y 58 años. A cada individuo se le realizó una evaluación clínica, nutricional y bioquímica. Para analizar la secuencia de la variante Pro12Ala del gen PPAR se empleó PCR y digestión enzimática de los fragmentos de restricción del polimorfismo (PCR-RFLP). En los individuos con síndrome metabólico el porcentaje de portadores del alelo Ala fue de 13,6%, mientras que en el grupo sin síndrome metabólico fue de 32,14%. La frecuencia para el alelo Ala del polimorfismo Pro12Ala fue de 0,12 y para el alelo Pro fue de 0,88. Los individuos con síndrome metabólico y portadores del alelo Ala presentaron niveles más bajos de triglicéridos y col-HDL más alto. Se concluye que la presencia del alelo Ala en individuos con síndrome metabólico mostró un efecto protector sobre el perfil lipídico.
The aim of this paper was to determine the prevalence of the polymorphism pro12ala in non-related individuals with metabolic syndrome from Maracaibo-Venezuela. Fifty subjects (22 with metabolic syndrome and 28 without metabolic syndrome) between 22 to 58 years of age were selected. For each individual, biochemical, nutritious, and clinical evaluations were carried out. PCR and restriction-fragment length polymorphism enzyme digestion were used to analyze the Pro12Ala sequence variant of the PPAR gene. The distribution of the Ala allele was 13.6% in the individuals with metabolic syndro- and 32.14% in the group without metabolic syndrome. The frequency distributions of the PPAR gamma sequence variants were 0.12 for Ala variant and 0.88 for Pro. The subjects with the metabolic syndrome and carriers of the Ala 12 allele had lower concentration of triglycerides and higher HDL-C. It can be concluded that the Ala12 allele in individuals with metabolic syndrome had a protective effect on the lipid profile.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Polymorphism, Genetic/genetics , Metabolic Syndrome/epidemiology , Venezuela , Metabolic Syndrome/blood , Peroxisome Proliferator-Activated Receptors/bloodSubject(s)
Animals , Crosses, Genetic , Genetics , Hybridization, Genetic , Livestock Industry , VenezuelaABSTRACT
Con la finalidad de estudiar la variabilidad genética de la raza Criollo Limonero considerada patrimonio Nacional y orientada a la producción de leche, se analizaron 95 animales puros utilizando 14 marcadores moleculares de ADN del tipo microsatélites. Los animales pertenecen al rebaño de la estación local Carrasquero, adscrita al Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas del estado Zulia (INIA-Zulia) y ubicado al noroeste del Estado. Para medir la diversidad genética se estimaron y discutieron los valores de heterocigosis observada (HO) y esperada (HE) total y entre familias (HMO, HME), probabilidad de exclusión (PE), Índice de Contenido Polimórfico (PIC) y número de alelos por locus. El número promedio de alelos por locus, HE y PIC fueron: 8,7; 0,689 y 0,651, respectivamente. Las HE variaron desde 0,355 hasta 0,787 y el PIC fluctuó de 0,302 a 0,757. El locus menos polimórfico fué el ILST5 y el más polimórfico fue el CSSM66. La PE con los 14 marcadores fue de 0,9962 y 0,9999 para uno y dos padres conocidos, respectivamente. Los resultados indicaron que este grupo de marcadores resultaron ser eficientes para realizar pruebas de paternidad en esta raza, así mismo se muestran que los niveles de heterocigosis indican la existencia de una alta diversidad molecular en la población estudiada, la cual deberá mantenerse como estrategia para la conservación del Criollo Limonero como recurso genético bovino de Venezuela para la producción animal en la región tropical.
In order to study the genetic variability of the Criollo Limonero Breed, a dairy breed considered National Patrimony of Venezuela, 95 purebred animals were analyzed using 14 DNA microsatellites. The animals belonged to the local Carrasquero station, assigned to the National Institute of Agriculture Research of Zulia (INIA-Zulia) and located in the northwest of Zulia State. Average values of observed and expected heterocigocities (HO, HE), between families (HMO, HME) respectively, exclusion probability (PE), Polymorphic Information Content (PIC) and number of alelles by locus were considered and discussed to measure the genetic diversity. The average of alleles by locus, HE and PIC were: 8.7; 0.689 and 0.651, respectively. HE ranged from 0.355 to 0.787 and PIC fluctuated from 0.302 to 0.757. The least polymorphic locus was ILST5 and the most polymorphic was the CSSM66. PE with the 14 markers was of 0.9962 and 0.9999 for one and both known parents, respectively. The results indicate that this set of markers are efficient to make paternity tests in this breed, it is also evident that there are heterozigosity levels indicating the existence of a high molecular diversity in this population, which should be maintained as a strategy for the conservation of the Criollo Limonero breed, a bovine genetic resource of Venezuela for animal production in the tropical regions.
Subject(s)
Cattle , Animals , Animals, Genetically Modified/genetics , Genetic Markers , Racial Groups/genetics , Microsatellite Instability , Genetic Techniques/veterinary , Veterinary MedicineABSTRACT
Con el objetivo de continuar el programa de conservación genética de la raza Criollo Limonero, se realizó un estudio para evaluar la variabilidad genética del rebaño, utilizando 2552 registros genealógicos disponibles entre los años 1985 y 2003 en la Estación Local Carrasquero, ubicada en el sector playa Bonita, municipio Mara, al norte del estado Zulia-Venezuela. Se determinó la consanguinidad de cada animal y la consanguinidad global del rebaño (fh), el promedio de relación de parentesco (AR), los parámetros de la probabilidad de orígen del gen, el número de fundadores (NF), el número efectivo de fundadores (fe), el número efectivo de ancestros (fa), número de genomas fundadores (Ng) y el número de fundadores que explican el 50 por ciento (F50) de la variabilidad genética. La fh en el año 2003 fue de 0,35 por ciento y el AR 3,4 por ciento, el NF 386, fe 63,5, fa 38, Ng 27,71; y el valor de F50 fue 18. La fh no tuvo un incremento marcado a pesar que el AR indicó que existe una alta relación entre los individuos de la población, por lo que los apareamientos deben planificarse para evitar el apareamiento de animales emparentados. Los valores de probabilidad de origen de los genes indican que la población ha perdido variabilidad genética por un efecto de cuello de botella y por deriva genética aunque este deterioro no se refleje en un incremento en la consanguinidad. Aun existe una cantidad importante de diversidad que debe preservarse, dada la importancia que representa este germoplasma para la región y el país.
In order to continue the genetic program for the conservation of the Criollo Limonero population, a study was carried out to evaluate the genetic variability of this local breed. For this purpose, 2552 genealogical records from the Criollo herd at the Carrasquero Local Station (INIA) located at Playa Bonita, Mara County, North of Zulia State-Venezuela, during the 1985-2003 period were used. Global inbreeding of the herd (fH) and animal inbreeding were determined; in addition, Average of relatedness (AR), probabilities of gene origin, number of founders (NF), effective number of founders (fe), effective ancestors number (fa), genome founders number (Ng ) and number of founders explaining 50% (F50) of the genetic variability. For the year 2003 fH was 0.35%, whereas AR, NF, fe, fa, Ng and F50 were 3.4%, 386, 63.5, 38, 27.71 and 18 respectively. Even though AR showed a high relationship among the individuals in the herd, fH did not have a significant increase. For this reason, mates should be planned carefully in order to avoid related mates. Probabilities of gene origin suggest that genetic variation has decreased in this population due to a bottleneck effect and genetic drift, without increasing inbreeding. An important genetic diversity exists in this population which should be preserved, given the importance of this genetic resource for the region and the country.
Subject(s)
Animals , Consanguinity , Probability , Genetic Techniques/veterinary , Veterinary MedicineABSTRACT
Los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para las características de crecimiento fueron estimados en dos rebaños afiliados a la fundación para la ganadería de doble propósito (GANADOBLE), ubicados en dos ambientes tropicales del estado Zulia, Venezuela. Los análisis fueron realizados bajo la metodología de los modelos mixtos, implementado por un modelo animal utilizando máxima verosimilitud restringida (REML), bajo el enfoque libre de derivadas, usando el paquete MTDFREML. Cuatro modelos mixtos fueron propuestos bajo un enfoque univariado aplicados sobre las características del peso al nacer (PN) y los pesos ajustados a 244 (P244); 365, (P365) y 548, (P548) días de edad, respectivamente. Se utilizaron 11587; 4412; 5774 y 3720 registros, correspondientes a PN, P244, P365 y P548, respectivamente. Los modelos difirieron para cada característica solamente en la parte aleatoria de los mismos: el modelo I incluyó solamente el efecto aditivo directo del animal; en el modelo II se incorporó además el efecto aditivo materno, el cual se asumió independiente del aditivo directo; en el modelo III, se admitió una covarianza entre los efectos genéticos aditivos directo y materno, de carácter proporcional a la matriz de relación y el modelo IV fue similar al III, pero se incluyó además el efecto ambiental permanente. Los efectos fijos incluidos en el modelo fueron: sexo del animal, grupo racial predominante, rebaño-año-época de nacimiento y el número de partos de la madre, el último solo para PN, P244 y P365. La prueba de la razón de verosimilitud (PRV) fue utilizada como criterio para la escogencia del modelo y fue realizada con el logaritmo de la función de verosimilitud de los modelos II vs. I, III vs. II y IV vs. III con la finalidad de encontrar la significancia estadística de: el efecto aditivo materno, la covarianza entre los efectos genéticos aditivos directo y el efecto ambiental permanente con el materno, respectivamente...
(Co)variance components and genetic parameters for growth traits were estimated in two dual purpose herds affiliated to the GANADOBLE foundation. The herds are located in two tropical environments in Zulia State, Venezuela. Animals were from a crisscrossing program between the Holstein and Brahman breeds mainly. Method of analysis was by Mixed Models, implemented under restricted Maximum Likelihood (REML) on an animal model, by using the derivative free algorithm and the MTDFREML package. Four models were proposed for the analyses under univariate mode and applied to the traits birth weight (PN), and adjusted weights at 244, 365 and 558 days of age (P244), (P365) y (P548) respectively. A total of 11587, 4412, 5774 y 3720 records were used for PN, P244, P365 and P548 respectively. Models differed for each trait only in the random part, as well as, in the assumptions made on them: model I was a simple animal model including the direct additive genetic effect; model II included the maternal additive effect as well, which was assumed to be independent of the first; in model III was admitted a covariance between the additive genetic effects proportional to the numerator relationship matrix; model IV was similar to model III but included the permanent maternal effect. The fixed part of the model included the effects: sex of animal, breed predominance, herd-year-season of birth and parity number of the dam, the later only for PN, P244 and P365. The likelihood ratio test (PRV) was performed based on the logarithm of the likelihood function from results of models II vs. I, III vs. II and IV vs. III in order to asses the significance of the additive maternal, the covariance between the additive effects and the maternal permanent effect. The PRV showed the necessity of incorporating the additive maternal along with the direct additive genetic effects on the prediction of the breeding values for PN, P244 and P365 (P<0.01)...
Subject(s)
Cattle , Animals , Growth , Models, Animal , Templates, Genetic , Veterinary MedicineABSTRACT
Existen investigaciones donde se miden variables en varios períodos de tiempo sobre el mismo animal. Este tipo de información puede analizarse estadísticamente mediante tres opciones: Análisis univariados con la instrucción RANDOM del GLM; Análisis univariados o multivariados a través de transformaciones lineales mediante la instrucción REPEATED del GLM; y con modelos mixtos de covarianza con el procedimiento MIXED. Con el objetivo de evaluar estos tres métodos estadísticos y conocer cual es más preciso, se analizaron durante 7 meses los pesos corporales quincenales de una finca ubicada en el estado Táchira, Venezuela, (bosque húmedo tropical), donde 30 mautas mestizas con un peso y edad promedio de 176,9 ± 24,6 Kg y 17,22 ± 2,23 meses respectivamente, fueron distribuidas aleatoriamente dentro tres grupos de suplementación: (1) Control, (2) Alimento balanceado comercial, y (3) Harina de Gliricidia sepium con harina de maíz y melaza. Se obtuvieron estructuras de covarianzas, comparándose el procedimiento GLM con sus instrucciones RANDOM y REPEATED vs. el procedimiento MIXED en sus opciones CS, UN y AR1, todas del paquete estadístico SAS. Como variable respuesta se evaluó el peso de las mautas durante el período del ensayo y como variable independiente el grupo de suplementación, el período y la interacción lineal entre ambas. Así mismo, al realizar el análisis de la varianza utilizando la estructura de errores más indicada, se pudo corroborar que existe una interacción significativa entre el tratamiento y el período (P<0,01), es decir, que las curvas de crecimiento tienden a no ser paralelas. Los resultados indican que el análisis más ajustado es el Procedimiento MIXED con la opción AR1, ya que permite ajustar la matriz de covarianza.
There are investigations where variables are measured in periods of time on the same animal. This type of information should be analyzed statistically trough three ways: univariate analyses with the RANDOM statement of the GLM procedure; univariate or multivariate analysis with the method of lineal transformations with the REPEATED statement of the GLM; and with mixed models of covariance with the MIXED procedure. With the objective of evaluating these three statistical methods and to know the most precise, biweekly live weight coming from a rehearsal carried out located in the Tachira State, Venezuela (topical damp woods) was analyzed during 7 weeks, where 30 crossbred heifers with an average weight and age of 176.9 ± 24.6 Kg and 17.22 ± 2.23 months respectively, were randomly distributed between three groups: (1) control, (2) balanced commercial feed, and (3) Flour of Gliricidia sepium with flour of corn and molasses. It was modeled covariance structures, comparing the GLM procedure with its RANDOM and REPEATED statements vs. the MIXED procedure in its CS, UN and AR1 options, of the statistical package SAS. As dependent variable it was studied the weight of the heifers during the assay period and as independent variables the supplementation group, the period and the linear interaction among both. When carrying out the analysis of variance using the most suitable structure of errors, it can be conclude that there was a significant interaction between treatment and period (P<0.01), and that is to say that the curves of growth spread unless parallel. Results indicate that the best fitting analysis is the Proc MIXED with the AR1 option, since it allows to adjust the covariance womb.
ABSTRACT
Para evaluar el efecto de los días postparto al tratamiento (DPP), predominio racial (PR), número de partos (NP) y época del año (E) sobre la ciclicidad y fertilidad de vacas mestizas en anestro tratadas con esponjas intravaginales (EI) impregnadas con Medroxi-acetato progesterona (MAP) más una inyección de eCG y PGF2a; se condujo un experimento en una finca ubicada en un bosque húmedo-tropical en el municipio Machiques de Perijá-Zulia, Venezuela. Se seleccionaron 72 vacas mestizas Bos taurus × Bos indicus primíparas (47) y multíparas (25) entre 45 y 108 días postparto (DPP) y condición corporal (CC) entre 3 y 3,5. Las vacas recibieron el siguiente esquema hormonal: Día 0: inserción de la EI, inyección de 5 mg de 17b-Estradiol y 50 mg de MAP im; Día 6: 500 UI de eCG y 25 mg de PGF2a im; Día 8: retiro de la EI; Día 9: 1 mg de 17b-Estradiol im. Un grupo fue tratado antes de los 70 DPP (MAP < 70DPP; n = 25) y otro después de los 70 DPP (MAP > 70DPP; n = 47). Se estudió la tasa de sincronización (TS), fertilidad al primer servicio (F), fertilidad global (FG), Intervalo Tratamiento-Concepción (ITC), Intervalo Parto-Concepción (IPC) y periodo de sincronización (PS). Las variables TS, F, y FG se analizaron con PROC LOGISTIC, SAS; mientras que ITC, IPC y PS con PROC GLM, SAS. No se encontró efectos del PR y NP sobre la TS, F, FG, ITC, IPC y PS. Las vacas con PR Bos indicus presentaron mayor F y FG en el grupo MAP < 70DPP comparada con MAP > 70DPP (F: 81,8 vs 43,7%; FG: 84,6 vs 45,5%). La TS fue mayor en las vacas tratadas en la época lluviosa comparada con la seca (96,4 vs 69,8%). La F solo fue mayor en la época lluviosa cuando las vacas fueron tratadas antes de 70DPP vs MAP > 70DPP (87,5 vs 42,1%). El PS fue menor en la época seca (36,9 h) vs la época lluviosa (48,8 h). El IPC fue menor en MAP < 70DPP (95,8 días) comparado con MAP > 70DPP (148,3 días). En conclusión, los días postparto al momento de la aplicación de la EI fue el factor que más ...
An experiment was done to evaluate the effect of postpartum interval to treatment (DPP) breed (PR), number of calving (NP) and season (E) on ciclicity and fertility of anestrous crossbred cows treated with intravaginal sponges (EI) impregnated with progesterone medroxi acetate (MAP) plus im injection of eCG and PGF2a. The study was conducted in a farm located in a tropical rainforest in Machiques de Perijá, Venezuela. Seventy two primiparous (47) and multiparous (25) Bos taurus × Bos indicus crossbred cows, between 45 and 108 days postpartum (DPP) and body condition (CC) between 3.0 and 3.5. Cows were treated as follows: MAP; Day 0, EI insertion + 5 mg 17b-Estradiol and 50 mg MAP im; Day 6, 500 IU eCG and 25 mg PGF2a im; day 8 EI removed; day 9 1 mg 17b-Estradiol im. One group was treated before 70 DPP (MAP < 70DPP; n = 25) and another after 70 DPP (MAP > 70DPP; n = 47). Studied variables were: Synchronization rate (TS), first service conception rate (F), total pregnancy rate (FG), treatment to conception interval (ITC), calving to conception interval (IPC) and synchronization period (PS). Variables TS, F, and FG were analyzed with PROC LOGISTIC, SAS, while ITC, IPC and PS were analyzed with the PROC GLM, option SAS. Variables TS, F, FG, ITC, IPC and PS were not affected by PR and NP. Cows predominantly Bos indicus in MAP < 70DPP had greater (P < 0.05) F and FG than those in MAP > 70DPP (F: 81.8 vs 43.7%; FG: 84.6 vs 45.5%). The TS was greater (P < 0.01) in cows treated during the rainy season than those treated during the dry season (96.4 vs 69.8%). During the rainy season, cows in MAP < 70DPP had greater (P < 0.01) F than did those in MAP > 70DPP (87.5 vs 42.1%, respectively). The PS was shorter (P < 0.01) during the dry season (36.9 h) vs the rainy season (48.8 h). The IPC was shorter (P < 0.01) in MAP < 70DPP (95.8 days) compared to MAP > 70DPP (148.3 days). In conclusion, days to EI insertion after parturition was the most important ...
ABSTRACT
Se describe un modelo determinístico dinámico para la simulación de un sistema de producción de doble propósito, la escala vaca-maute se utilizó para estimar los efectos sobre el margen bruto, resultado de cambios en los niveles productivos generados por mejoramiento genético de las características biológicas involucradas. El modelo se concibió compuesto de al menos dos versiones principales, que se articulan integradamente para alcanzar los objetivos de simulación. La versión descriptiva consistió en la caracaterización de la estructura de un sistema de produccioón doble propósito, escala vaca-maute, ubicado en la cuenca del Lago de Maracaibo, cuyas variables biológicas y económicas constituyeron el andamiaje teórico de referencia. La otra versión se refierio a las ecuaciones matemáticas, las cuales les permitieron completar las fases de análisis y simulación. La validación del modelo fue realizada con datos suministrados por el sistema de registros e información para la ganadería de doble propósito, provenientes del municipio Sucre del estado Zulia. En la fase de experimentación se pudo comprobar que, en las condiciones que se realizó la simulación, las características que podrían integrar el objetivo de selección del sistema doble propósito son, peso adulto y producción de leche, la sihuiente fase en el proceso de definición del programa genéticoserá determinar los indicadores más adecuados que sean necesario evaluar para optimizar el progreso en esas características.
Subject(s)
Animals , Cattle , Dairying , Genetics , Food Economics , VenezuelaABSTRACT
Los componentes de (co)varianza y parámetros genéticos para las características de crecimiento fueron estimados en una población de animales cruzados, provenientes de un programa de cruzamientos alternos entre las razas Brahmán y Holstein, en dos rebaños de doble propósito afiliados a la fundación GANADOBLE y mantenidos bajo condiciones tropicales en el estado Zulia, Venezuela. Análisis univariados fueron efectuados usando el método de máxima verosimilitud restringida (REML), con un algoritmo libre de derivadas con los programas MTDFREML. Las características incluidas en los análisis fueron: peso al nacer (PN, n= 11587), pesos ajustados para cada animal a los 244 (P244, n= 4412), 365 (P365, n= 5774) y 548 (P548, n = 3720) días, respectivamente. El modelo mixto usado incluyó como parte aleatoria los efectos aditivos directo y materno, se admitió una posible covarianza entre ellos, la cual se asumió proporcional al numerador de la matriz de parentesco, el efecto materno permanente y el residual, los últimos se suponen no correlacionados con ninguno de los otros efectos. La parte fija incluyó el sexo del animal, el rebaño-año-época de nacimiento, la predominancia racial y la edad de la madre, incluida esta última sólo en PN. P244 y P365. Los parámetros genéticos estimados fueron: índice de herencia directa, 0,24 ± 0,05; 0,17 ± 0,06; 0,17 ± 0,06 y 0,038 ± 0,10, índice de herencia materna, 0,04 ± 0,02; 0,12 ± 0,12; 0,17 ± 0,08 y 0,03 ± 0,07, maternal permanente, 0,04 ± 0,02 0,00 ± 0,00, 0,05 ± 0,05 y 0,05 ± 0,05, para las características PN, P244, P365 y P548, respectivamente. Las correlaciones entre los efectos aditivos fueron: 0,03 ± 0,24; -0,16 ± 0,49; -0,63 ± 0,17 y -0,85 ± 0,82. Los datos evidencian que existe suficiente variación aditiva como para obtener respuesta a la selección en cualquiera de esas fases de crecimiento y que los efectos maternos pudieran ser de importancia, manteniéndose inclusive hasta edades próximas al año. No obstante...