[C677T polymorphism of the methylentetrahydrofolate reductase gene as risk factor in women with recurrent abortion]. / Polimorfismo C677T del gen de la Metiltetrahidrofolato Reductasa como factor de riesgo en mujeres con aborto recurrente.

The pathogenesis of recurrent spontaneous abortion is multifactorial, presumably involving the interaction of several genetic and environmental factors. The methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) gene C677T polymorphism has been implicated as risk factor for recurrent spontaneous abortion (RA). The main objective of this research was to investigate the association between the C677T polymorphism of the MTHFR gene as a genetic risk factor for idiopathic RA. Molecular analysis was performed in 80 DNA samples from 30 patients with RA and among 50 healthy control subjects. Using the Polymerase Chain Reaction (PCR), a 198 bp (bases pairs) fragment, was digested with the restriction enzyme Hinf1, which can recognize the C > T substitution responsible for the polymorphism. 677T MTHFR allele frequencies for group with RA and the control group were 35% and 33%, respectively and 677C MTHFR allele frequencies were 65% and 67%, respectively. There was no significant difference in allele frequency between these two groups. The data presented in this study fail to support the relationship between MTHFR C677T polymorphism and risk in women with RA.

Polimorfismo C677T del gen de la metiltetrahidrofolato reductasa como factor de riesgo en mujeres con aborto recurrente / C677T polymorphism of the methylentetrahydrofolate reductase gene as risk factor in women with recurrent abortion

La patogénesis de los abortos espontáneos recurrentes es multifactorial; probablemente se debe a la interacción de varios factores ambientales y genéticos. El polimorfismo C677T del gen de la metiltetrahidrofolato reductasa (MTHFR), ha sido implicado como factor de riesgo para aborto espontáneo recurrente (AR). El objetivo de este trabajo fue investigar la asociación del polimorfismo C677T de la MTHFR como factor de riesgo en AR idiopático. Se analizaron 80 muestras de ADN, correspondientes a 30 mujeres con AR y a 50 mujeres controles. A través de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se amplificó un fragmento de 198 pares de base (pb), el cual se sometió a digestión con la enzima de restricción HinfI, que reconoce el sitio de restricción creado por la transición C>T en la posición 677. La frecuencia alélica de la MTHFR en el grupo de estudio y control fue 35% y 33% respectivamente; para el alelo T y 65% y 67% respectivamente, para el alelo C. No se encontró diferencia significativa entre el alelo T ni el C al ser comparados en ambos grupos. No se demostró un factor predisponente entre el polimorfismo C677T de la MTHFR y el AR en la muestra estudiada.

The pathogenesis of recurrent spontaneous abortion is multifactorial, presumably involving the interaction of several genetic and environmental factors. The methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) gene C677T polymorphism has been implicated as risk factor for recurrent spontaneous abortion (RA). The main objective of this research was to investigate the association between the C677T polymorphism of the MTHFR gene as a genetic risk factor for idiopathic RA. Molecular analysis was performed in 80 DNA samples from 30 patients with RA and among 50 healthy control subjects. Using the Polymerase Chain Reaction (PCR), a 198 bp (bases pairs) fragment, was digested with the restriction enzyme HinfI, which can recognize the C > T substitution responsible for the polymorphism. 677T MTHFR allele frequencies for group with RA and the control group were 35% and 33%, respectively and 677C MTHFR allele frequencies were 65% and 67%, respectively. There was no significant difference in allele frequency between these two groups. The data presented in this study fail to support the relationship between MTHFR C677T polymorphism and risk in women with RA.

[Indirect prenatal molecular diagnostic of haemophilia A and B]. / Diagnóstico prenatal molecular indirecto de Hemofilia A y B.

Haemophilia A (HA) and B (HB) are the most common inherited bleeding diseases. HA and HB are X-linked recessive disorders caused by mutation in the factor VIII gene which maps to Xq28 and factor IX located at Xq27, respectively; resulting in absence or deficiency of these proteins. Several mutations have been reported as responsible for the disturbance of these genes; therefore, the use of direct molecular techniques to analyze the carrier status of women and their affected fetuses in not easy to perform. Thus, gene linked polymorphisms analysis is the most convenient molecular test since it is independent from the nature of the mutation, allowing the identification of the mutant X chromosome by following its segregation along the pedigree. The main objective of this research was to perform the molecular diagnosis of HA or HB carrier status in pregnant women and male fetuses affected or not, who were referred to the Medical Genetic Unit of the University of Zulia (UGM-LUZ), Maracaibo, Venezuela. Molecular analysis for HA and HB was performed in 32 DNA samples from 8 pregnant women, 8 fetuses, 8 affected and 8 healthy males. Using the Polymerase Chain Reaction (PCR), a 142 bp (bases pairs) fragment, which corresponds to intron 18 of the Factor VIII gene, was amplified. This fragment has a restriction polymorphism for the enzyme Bcl I. Additionally, a Duplex PCR was performed for the STRs (short tandem repeat) of introns 13 and 22 of the same gene. On the other hand, Hinf I, Xmn I y Taq I polymorphism in the factor IX gene were also amplified, so, we were able to build the haplotypes for each one of the key members in the families affected. The latter, allowed us to identify, in five of the eight cases, the mutant X chromosome responsible of HA and HB, thus, prenatal diagnosis was possible with the following results: three healthy males fetuses, two affected males fetuses with HA and three females fetuses.

Diagnóstico prenatal molecular indirecto de hemofilia A y B / Indirect prenatal molecular diagnostic of haemophilia A and B

La hemofilia A (HA) y B (HB), son enfermedades hereditarias de la coagulación sanguínea, su mecanismo de transmisión es recesivo ligado al cromosoma X y son debidas a mutaciones en los genes que codifican respectivamente para el factor VIII, localizado en Xq28 y para el factor IX, localizado en Xq27; esto ocasiona deficiencia o ausencia de estas proteínas en el plasma. Múltiples mutaciones son responsables de la alteración en estos dos genes, razón por la cual resulta poco práctica la aplicación de un método de diagnóstico molecular directo en la identificación de mujeres portadoras y de fetos afectados; por ello, la estrategia diagnóstica adecuada es el empleo de polimorfismos ligados al gen, los cuales son independientes de la mutación y su análisis permite seguirle la pista al cromosoma X portador de la mutación, apoyándose en el estudio del árbol genealógico familiar. El objetivo de este trabajo fue identificar desde el punto de vista molecular, gestantes portadoras de HA o HB y fetos varones afectados o no por estas enfermedades, referidos a la Unidad de Genética Médica de la Universidad del Zulia (UGM-LUZ), Maracaibo, Venezuela. Se analizaron 32 muestras de DNA correspondientes a 8 gestantes, 8 fetos, 8 varones afectados y 8 varones sanos para el factor VIII. A través de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), se amplificó un fragmento de 142 pares de bases (pb) que corresponde al intrón 18 del gen, el cual contiene un polimorfismo de restricción para la enzima BclI y a través de PCR duplex se amplificaron secuencias STRs de los intrones 13 y 22, y para el factor IX, se amplificaron los polimorfismos HinfI, XmnI y TaqI; se pudieron elaborar los haplotipos respectivos en las personas clave de las familias afectadas, que permitieron identificar en 5 de las 8 familias al cromosoma X portador de la mutación responsable de estas enfermedades, logrando diagnosticar tres fetos varones sanos, dos fetos varones afectados con HA y tres fetos hembras.

[Molecular analysis of microdeletions of the Y chromosome in Venezuelan males with idiopathic infertility]. / Frecuencia de microdeleciones del cromosoma Y en hombres venezolanos con infertilidad idiopática.

Today infertility is a major health problem affecting about 10-20% of couples. A male factor is assumed to be responsible in about 50% of the infertile couples. The origin of reduced testicular sperm function is unknown in about 60-70% of cases. There are several causes of male infertility such as varicocele, spermatic duct obstruction, and endocrine disorders. Micro-deletions in the Yq are known to represent the pathogenic mechanisms for infertile males. Three different non-overlapping regions designated as AZFa, AZFb, and AZFc are located in interval 5-6 of Yq, and are associated with impaired spermatogenesis in humans. To determine the prevalence of Y chromosomal microdeletions in Venezuelan males with idiopathic infertility, chromosomal, seminal, histological and molecular analyses were carried out in 29 Venezuelan males with idiopathic azoospermia or oligoospermia. Y-microdeletions analyses were performed using a multiplex polymerase chain reaction (PCR)-based technique with 22 sequences-tagged-sites (STSs). One of 29 patients (3.4%) had Yq microdeletions on AZFc. The frequency of AZF microdeletions in Venezuelan patients was similar to other populations with different ethnical or geographical origin.

Frecuencia de microdeleciones del cromosoma y en hombres venezolanos con infertilidad idiopática / Molecular analysis of microdeletions of the y chromosome in venezuelan males with idiopathic infertility

La infertilidad hoy día es un problema de salud importante que afecta cerca de 10-20 por ciento de las parejas. El factor masculino es el responsable del 50 por ciento de las parejas infértiles. Se desconoce el origen de la reducción espermática en cerca del 60-70 por ciento de casos. Existen varias causas de la infertilidad masculina tales como varicocele, obstrucción espermática del conducto y desórdenes endocrinos. Tres regiones diferentes no solapantes conocidas como AZFa, AZFb, y AZFc localizadas en el intervalo 5-6 del brazo largo del cromosoma Y (Yq), han sido asociadas a falla espermatogénica en humanos. El objetivo de este trabajo fue determinar la frecuencia de las microdeleciones del cromosoma Y en hombres venezolanos con infertilidad idiopática. Se realizó análisis cromosómico, seminal, histológico y molecular en 29 hombres venezolanos con azoospermia u oligozoospermia idiopática. El análisis molecular se efectuó a través de la Reacción en Cadena de la Polimerasa (RCP) múltiple de 22 STS. Se detectaron microdeleciones en la región AZFc del cromosoma Y en 1 de 29 pacientes (3,4 por ciento). Estos resultados sugieren que la frecuencia de las microdeleciones del cromosoma Y en pacientes venezolanos, es similar a la de otras poblaciones con diferente origen geográfico y étnico

[Frequency of delta F508 mutation in Venezuelan patients with cystic fibrosis]. / Frecuencia de la mutación delta F508 en pacientes venezolanos afectados con fibrosis quística.

Cystic Fibrosis (CF) is the most common and severe autosomal recessive disease in Caucasian populations, with an incidence of 1 in 2500 live births. It is characterized by a generalized disturbance in exocrine glands and it is caused by over one thousand mutations at the cystic fibrosis conductance regulator gene (CFTR) mapped at 7q31. AF508 is the most frequent mutation worldwide and it consists in a deletion of the codon that encodes fenilalanine at the 508 protein's position. The aim of this study was to determine the frequency of the delta F508 mutation in Venezuelan patients with CF using the Polymerase Chain Reaction (PCR). We studied thirty patients of twenty eight families who were diagnosed with CF based on their clinical features and sweat chloride level > 60 mEq/l in two determinations. Detection of the mutation was performed from the amplification of a 98 pair of bases (pb) CF gene segment which contains the codon that encodes fenilalanine in the 508 position by PCR. This PCR product is absent in those who have the mutation. The delta F508 allelic frequency was 26.79%, distributed in six homozygous and seven compound heterozygote delta F508/X. The reminder mutations (no delta F508) represent 73.21%. The delta F508 frequency in our sample is less than the reported in European countries. On the other hand, a delta F508 frequency highly heterogeneous has been observed in Latin-American countries. This variation results from mixed populations with a different genetic background influenced by external migration and CF molecular alterations, which exists in the analyzed populations. In this study, the delta F508 mutation comes mainly from grandparents (79.41%) who were born in Mediterranean countries and Colombia, while the no delta F508 mutations come from grandparents who were born in Venezuela (79.27%) and Colombia (17.07%).

Frecuencia de la mutación F508 en pacientes venezolanos afectados con fibrosis quística / Frecuency of F508 mutation in venezuelan patients with cystic fibrosis

La fibrosis quística (FQ), es la enfermedad autosómica recesiva severa más frecuente en poblaciones caucásicas, en las que tiene una inicidencia de 1/2500 individuos. Se caracteriza por una alteración generalizada de las glándulas exocrinas y es producida por más de mil mutaciones de un gen localizado en la región 7q31, que codifica una proteína llamada regulador de la conductancia transmembrana de FQ (RCTFQ). La mutación más frecuente es la F508, que consiste en la deleción del codón que codifica a la fenilalanina en la posición 508. El objetivo de este trabajo fue determinar la frecuencia de la mutación F508 en pacientes venezolanos afectados con FQ mediante la reacción en cadena de la polimerasa (RCP). Se estudiaron 30 pacientes pertenecientes a 28 familias, que por clínica y 2 determinaciones de cloruros en sudor > 60 meq/L fueron diagnósticados como afectados con FQ. La detección de la mutación se realizó a partir de amplificación por RCP de un segmento del gen de FQ de 98 pares de bases (pb) que contiene el codón que codifica a la fenilalanina en la posición 508 y el cual está ausente en los que tienen la mutación. La frecuencia del alelo F508 fue de 26,79 por ciento, distribuídos en 6 hemocigotos F508 y 7 heterocigotos compuestos F508/X. El resto de las mutaciones, no F508, representaron el 73,21 por ciento. La frecuencia del alelo F508 en esta muestra es menor a la reportada en países europeos. En América Latina se ha observado una gran heterogeneidad en su frecuencia, esta variación podría explicarse por los diferentes patrones de mestizaje dados por migración externa y de las alteraciones moleculares de FQ que existen en la población que analice. En este trabajo, la mutación F508 proviene de abuelos en su mayoría (79,41 por ciento) nacidos en países mediterráneos y en Colombia y en las no F508, los abuelos son nacidos preferentemente en Venezuela (79,27 por ciento) y Colombia (17,07 por ciento)

Behavior of loci D1S1656 and D12S391 in a sample from Maracaibo, Venezuela.

Two recently reported short tandem repeat polymorphisms characterized by PCR, D1S1656 and D12S391, were investigated in a sample from Maracaibo, an admixed population of Venezuela, in order to evaluate their application in forensic and population genetics studies. The unbiased heterozygosities were 0.9011 and 0.8444 for locus D1S1656 and D12S391, respectively. The joint discrimination power and joint probability of exclusion were 0.99972 and 0.93287. When allele frequencies of locus D1S1656 from Maracaibo were compared with eight other populations, our group clustered with the European or European-derived samples, mainly from Spain. In the comparison of locus D12S391 with 16 populations, Maracaibo clustered with 3 Asian samples. The high heterozygosity and discrimination power make these two loci important candidates to be considered for STR packages for forensic and population genetic purposes.

[Analysis of Bsm I polymorphism of the vitamin D receptor (VDR) gene in Venezuelan female patients living in the state of Zulia with osteoporosis]. / Análisis del polimorfismo Bsm I del gen receptor de la vitamina D (VDR) en pacientes venezolanas residentes del estado Zulia con osteoporosis.

Among genes implied on the osteoporosis genetics, the most studied gene worldwide is the receptor gene of D vitamin (VDR), through the characterization of Bsm I polymorphism. The main objective of this research was to analyze the Bsm I polymorphism of the VDR gene in a sample of 133 postmenopausal women distributed in three groups: 54 with osteoporosis, 24 with osteopenia and 55 normal controls for the disease. 28 of the women with osteoporosis presented the BB genotype, which is related in other countries to bone mineral density decrease, 20 had the Bb genotype, and 6 the bb genotype. Of the control group only 11 women presented the BB genotype, 36 showed the heterozygote genotype and 8 the bb genotype. The frequencies of the B and b alleles in the analyzed population were 0.6 and 0.4 respectively. The BB genotype was found in 52% of the group with osteoporosis, and in 20% of the control group, these findings are statistically significant, which suggest an association between the BB genotype and osteoporosis.

Anomalías cromosómicas clonales en tumores colorectales / Clonal chromosomal abnormalities in colorectal tumors

Los tumores colorectales constituyen un motivo de consulta frecuente en los servicios de gastroenterología a nivel mundial, representando la segunda causa de muerte en el mundo y la cuarta causa de mortalidad por cáncer en Venezuela. Usualmente comienza como un pólipo benigno que en muchas ocasiones se transforma en maligno debido a una mutación a nivel del código genético que controla el crecimiento y la reparación celular. El presente trabajo reporta las alteraciones cromosómicas observadas en 15 muestras de tumores colorectales benignos y malignos estudiados en la Unidad Genética médica de la Universidad del Zulia. Se encontraron anomalías cromosómicas clonales en 11/15 (73,33 por ciento), 4 correspondieron a carcinomas y 7 a pólipos adenomatosos, en 7/11 (63,6 por ciento) se encontraron anomalías tipo monosomía de los cromosomas 8 y 22, otras anomalías correspondieron a trisomías de los cromosomas 11 y 18 y uno solo de los casos con una anomalía estructural que correspondió a una del (17p). Las anomalías cromosómicas clonales en pólipos adenomatosos han sido relacionadas con inicio de la enfermedad maligna, y en el caso de los carcinomas, se ha relacionado con progresión de la enfermedad hacia la metástasis y muerte, por lo que la utilización del análisis citogenética podría establecerse como un facrtor pronóstico para los pacientes con poliposis adenomatosa no familiar

[Clonal chromosomal anomalies in colorectal tumors]. / Anomalías cromosómicas clonales en tumores colorectales.

Colorectal tumors constitute a reason of frequent consultation in gastroenterology services in the world. They constitute the second cause of mortality in the world and the fourth cause of mortality for cancer in Venezuela. It usually begins as a polyp that becomes malignant due to a mutation at the level of the genetic code that controls the growth and the repair of cells. The present work reports the clonal chromosomal abnormalities observed in 15 samples from benign tumors as well as malignant colorectal tumors and to relate these findings. There were clonal chromosomal anomalies in 11/15 (73.33%), 4 corresponded to carcinomas and 7 to adenomatous polyps. In 7/11 (63.6%) there were anomalies of the monosomy type in the chromosomes 8 and 22, other anomalies corresponded to trisomy of the chromosomes 11 and 18, and a single case with a structural anomaly that corresponded to a del(17p). The chromosomal anomalies in adenomatous polyposis have been related with the beginning of malignant disease and, in the case of carcinomas, it has been related with progression of the illness toward metastasis and death. The use of this tool could be used as a prognostic factor for patients with non familial adenomatous polyposis.

Diagnóstico molecular prenatal de fibrosis quística: reporte de tres casos / Prenatal diagnosis of cystic fibrosis: report of three cases

La fibrosis quística (FQ) es una enfermedad autosómica recesiva severa, causada por múltiples mutaciones en el gen RCTFQ. La mutación más frecuente en el mundo es la AF508, que consiste en la delección del codón que codifica a la fenilalanina en la posición 508. En este trabajo se presentan los primeros casos venezolanos de diagnóstico prenatal molecular en parejas de alto riesgo para tener descendencia con FQ. El diagnóstico molecular de la mutación AF508 se realizó en ADN extraído directamente de amnioticos o de células cultivadas y la aplicación de la Reacción de la Polimerasa (RCP) y electroforesis en gel de poliacrilamida. En los dos primeros casos, los fetos fueron homocigotos para el alelo AF508 y el tercer feto presentaba un alelo AF508, descartándose la homocigosis del alelo normal. El asesoramiento genético prenatal a estas parejas permitió que tomaran decisiones reproductivas objetivas en base al conocimiento del genotipo fetal, lo cual solo es posible con la aplicación de estas técnicas para el análisis del genoma