A Genome-Focused Investigation Reveals the Emergence of a Mycobacterium tuberculosis Strain Related to Multidrug-Resistant Tuberculosis in the Amazon Region of Brazil.

A previous study in Pará, Northern Brazil, described a strain of Mycobacterium tuberculosis with a unique genotype (SIT2517/T1) associated with multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB). To improve our understanding of MDR-TB transmission dynamics of these strains within this region, we performed phenotypic and genotypic drug susceptibility testing (pDST/gDST), 24-loci mycobacterial interspersed repetitive units (MIRU-VNTR) genotyping, whole-genome sequencing (WGS) and geo-epidemiology analysis. Of the 28 SIT2517/T1 isolates, 19 (67.9%) could be genotyped by 24-loci MIRU-VNTR and 15 by WGS. All belonged to sublineage 4.1.1.3, distinct from other representative Lineage 4 isolates identified in Brazil. The MDR phenotype determined by pDST was confirmed by gDST, the latter also demonstrating the presence of additional mutations conferring pre-extensively drug-resistance (pre-XDR). Discrepancies between gDST and pDST were observed for pyrazinamide and fluoroquinolones. Thirteen out of 15 isolates analyzed by WGS were clustered when applying a 12 single nucleotide polymorphisms (SNPs) cutoff. The SIT2517/T1 isolates were distributed across the metropolitan regions of Belém and Collares municipalities, showing no geographic clustering. WGS-transmission network analysis revealed a high likelihood of direct transmission and the formation of two closely linked transmission chains. This study highlights the need to implement TB genomic surveillance in the Brazilian Amazon region.

Analysis of potential household transmission events of tuberculosis in the city of Belem, Brazil.

Tuberculosis (TB) is an infectious disease with a higher risk for infection and disease among household contacts (HHC). Here, we report a molecular epidemiology-based approach to study disease transmission and the genetic characteristics of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains among HHC in the city of Belem, the capital of the state of Para in north Brazil. The study included 63 TB patients belonging to 26 HHC groups (HHC1 to HHC26). Spoligotyping and 24-loci Mycobacterial Interspersed Repetitive Unit - Variable Number of Tandem Repeat (MIRU-VNTR) revealed indistinguishable bacterial genotypes among 26 patients in 14 (53.8%) HHC groups. Drug susceptibility testing (DST) revealed that 45 (71.4%) of the Mtb isolates were multidrug resistant. The major cluster composed of isolates from five HHCs and on three of these, whole genome sequencing (WGS) was performed confirming their high genetic similarity. These results pinpoint the need for improved vigilance for TB control in households in the city of Belém. When comparing WGS versus phenotypic resistance detection methods as DST and Minimum Inhibitory Concentration (MIC) our data suggest that depending on the colonies selection, results may present variation.

Detecção de sintomáticos respiratórios em serviços de saúde da rede pública de Belém, Pará, Bras / Detection of respiratory symptoms in the public health network of Belém, Pará State, Brazil

A tuberculose é considerada um grave problema de saúde pública, e a identificação dos sintomáticos respiratórios, uma ação primordial para facilitar o diagnóstico precoce dos casos. Os objetivos deste estudo foram: conhecer o número de sintomáticos respiratórios identificados entre as pessoas que procuram o atendimento nos serviços de saúde; e conhecer onúmero de pessoas não identificadas pelos serviços como tal. Participaram do estudo 21 unidades básicas de saúde em Belém, Pará. Na construção e análise dos dados foi usado o programa Epi-Info Versão 6.0B. Foram entrevistadas 1.008 pessoas usuárias das unidades. Constatou-se que a prevalência de sintomáticos respiratórios entre os entrevistados foi de 10,03 porcento. A identificação dos mesmos nas unidades não foi feita em 72 por cento dos casos, sendo que, dos identificados como tal,33 por conto foram encaminhados para exame de escarro. Não houve diferença estatisticamente significativa (p = 0,07) para a associação entre a pergunta sobre tosse e a duração da tosse, nas unidades pesquisadas. Essa identificação, mediante a busca de tossidores, deve ser uma atividade incorporada na rotina das unidades, para facilitar o diagnóstico precoce epronto atendimento dos casos bacilíferos, como forma de quebrar a cadeia de transmissão da doença.

Tuberculosis is considered a serious public health problem, and the identification of its respiratory symptoms is of extreme importance to facilitate a precocious diagnosis of the disease. This study aimed to discover the number of respiratory symptomatic patients identified among the people that sought treatment in the local public health network, as well as the number of individuals not identified as symptomatic by its health care providers. Twenty-one health care units in Belém, Pará State, Brazil, were involved in this study, and 1,008 individuals were surveyed. Selection and analysis of the data collected was carried out using Epi-Info Version 6.0B software. The prevalence rate of respiratory symptomatic patients was 10.03 percent; their identification was not carried out in 72 percent of the cases. Of the identified ones, 33 percent were directed for sputum examination. There was no statistically significant difference (p = 0.07) in the association between the question of cough and its duration. This identification through the search for patients with chronic cough should be a procedure incorporated in the Health Units' daily routine, in order to facilitate an early diagnosis and the immediate treatment of bacilliferous cases, as a form of breaking the transmission chain of the disease.

III Brazilian Thoracic Association Guidelines on tuberculosis.

New scientific articles about tuberculosis (TB) are published daily worldwide. However, it is difficult for health care workers, overloaded with work, to stay abreast of the latest research findings and to discern which information can and should be used in their daily practice on assisting TB patients. The purpose of the III Brazilian Thoracic Association (BTA) Guidelines on TB is to critically review the most recent national and international scientific information on TB, presenting an updated text with the most current and useful tools against TB to health care workers in our country. The III BTA Guidelines on TB have been developed by the BTA Committee on TB and the TB Work Group, based on the text of the II BTA Guidelines on TB (2004). We reviewed the following databases: LILACS (SciELO) and PubMed (Medline). The level of evidence of the cited articles was determined, and 24 recommendations on TB have been evaluated, discussed by all of the members of the BTA Committee on TB and of the TB Work Group, and highlighted. The first version of the present Guidelines was posted on the BTA website and was available for public consultation for three weeks. Comments and critiques were evaluated. The level of scientific evidence of each reference was evaluated before its acceptance for use in the final text.

III Diretrizes para Tuberculose da Sociedade Brasileira de Pneumologia e Tisiologia / III Brazilian Thoracic Association Guidelines on Tuberculosis

Diariamente novos artigos científicos sobre tuberculose (TB) são publicados em todo mundo. No entanto, é difícil para o profissional sobrecarregado na rotina de trabalho acompanhar a literatura e discernir o que pode e deve ser aplicado na prática diária juntos aos pacientes com TB. A proposta das "III Diretrizes para TB da Sociedade Brasileira de Pneumologia e Tisiologia (SBPT)" é revisar de forma crítica o que existe de mais recente na literatura científica nacional e internacional sobre TB e apresentar aos profissionais da área de saúde as ferramentas mais atuais e úteis para o enfrentamento da TB no nosso país. As atuais "III Diretrizes para TB da SBPT" foram desenvolvidas pela Comissão de TB da SBPT e pelo Grupo de Trabalho para TB a partir do texto das "II Diretrizes para TB da SBPT" (2004). As bases de dados consultadas foram LILACS (SciELO) e PubMed (Medline). Os artigos citados foram avaliados para determinação do ...

New scientific articles about tuberculosis (TB) are published daily worldwide. However, it is difficult for health care workers, overloaded with work, to stay abreast of the latest research findings and to discern which information can and should be used in their daily practice on assisting TB patients. The purpose of the III Brazilian Thoracic Association (BTA) Guidelines on TB is to critically review the most recent national and international scientific information on TB, presenting an updated text with the most current and useful tools against TB to health care workers in our country. The III BTA Guidelines on TB have been developed by the BTA Committee on TB and the TB Work Group, based on the text of the II BTA Guidelines on TB (2004). We reviewed the following databases: LILACS (SciELO) and PubMed (Medline). The level of evidence of the cited articles was determined, and 24 recommendations ...

[Nested-PCR for gene that encodes the antigen b applied to the diagnosis of pulmonary tuberculosis]. / Nested-PCR do gene que codifica o antígeno b aplicada ao diagnóstico da tuberculose pulmonar.

The polymerase chain reaction used for amplifying an internal sequence of a previously amplified fragment (nested-PCR) was investigated as a complementary alternative for searching for alcohol-acid resistant bacilli and Mycobacterium tuberculosis cultures in Lowenstein-Jensen medium. 144 sputum samples were investigated from patients with suspected tuberculosis that were sent to the Tuberculosis Laboratory of the Evandro Chagas Institute in Belém, between June 2002 and December 2003. From the 144 samples, 121 were characterized as tuberculosis: 119 were positive in cultures, 95 under bacilloscopy and 128 using nested-PCR. The sensibility of the nested-PCR was 96% (116/121), while the specificity was 48% (11/23). Nested-PCR may be a complementary tool for diagnosing tuberculosis, since it presents sensitivity equivalent to that of cultures. However, further evaluations are needed with the aim of minimizing the number of false-positive results.

Nested-PCR do gene que codifica o antígeno b aplicada ao diagnóstico da tuberculose pulmonar / Nested-PCR for gene that encodes the antigen b applied to the diagnosis of pulmonary tuberculosis

A reação em cadeia da polimerase usada para amplificação de uma seqüência interna de um fragmento previamente amplificado (nested-PCR) foi investigada como uma alternativa complementar a pesquisa de bacilos álcool ácido resistentes e a cultura do Mycobacterium tuberculosis em meio de Lowenstein-Jensen. Foram investigadas 144 amostras de escarro de pacientes suspeitos de tuberculose encaminhados ao Laboratório de Tuberculose do Instituto Evandro Chagas em Belém, no período de junho de 2002 a dezembro de 2003. Das 144 amostras, 121 foram caracterizadas como tuberculose, 119 foram positivas na cultura, 95 na baciloscopia e 128 na nested-PCR. A sensibilidade da nested-PCR foi 96 por cento (116/121), enquanto a especificidade foi 48 por cento (11/23). A nested-PCR poderá ser uma ferramenta complementar para o diagnóstico da tuberculose, pois apresenta sensibilidade equivalente à cultura, no entanto, necessita de maiores avaliações visando minimizar o número de resultados falso-positivos.

The polymerase chain reaction used for amplifying an internal sequence of a previously amplified fragment (nested-PCR) was investigated as a complementary alternative for searching for alcohol-acid resistant bacilli and Mycobacterium tuberculosis cultures in Lowenstein-Jensen medium. 144 sputum samples were investigated from patients with suspected tuberculosis that were sent to the Tuberculosis Laboratory of the Evandro Chagas Institute in Belém, between June 2002 and December 2003. From the 144 samples, 121 were characterized as tuberculosis: 119 were positive in cultures, 95 under bacilloscopy and 128 using nested-PCR. The sensibility of the nested-PCR was 96 percent (116/121), while the specificity was 48 percent (11/23). Nested-PCR may be a complementary tool for diagnosing tuberculosis, since it presents sensitivity equivalent to that of cultures. However, further evaluations are needed with the aim of minimizing the number of false-positive results.

Diagnóstico molecular da tuberculose pulmonar / Molecular diagnosis of pulmonary tuberculosis

A reação em cadeia da polimerase (PCR) e suas variações, como a nested-PCR, têm sido destacadas como técnicas moleculares promissoras para o diagnóstico rápido da tuberculose (TB). No presente estudo avaliou-se a nested-PCR utilizando-se como marcadores moleculares a seqüência IS6110 e o antígeno b aplicados ao diagnóstico da TB. Foram submetidas a baciloscopia, cultura e nested-PCR 136 amostras clínicas de pacientes com suspeita de TB. O diagnóstico de tuberculose pulmonar foi atribuído a 116 pacientes e, desses, 97 foram multibacilares e 111 apresentaram cultura positiva para M. tuberculosis. As reações de nested-PCR identificaram 70 por cento (antígeno b) e 94 por cento (IS6110) dos casos paucibacilares. Os valores de sensibilidade determinados para cultura, nested-PCR do IS6110 e antígeno b foram 95 por cento, 98 por cento e 86 por cento, respectivamente. A especificidade foi de 100 por cento, 15 por cento e 45 por cento para cultura, nested-PCR do IS6110 e antígeno b, respectivamente. O diagnóstico molecular da tuberculose deve estar fundamentado na análise conjunta de vários parâmetros, como baciloscopia, cultura, manifestações clínicas, prova terapêutica e história prévia de tuberculose.

Chain reaction of polimerase (PCR) and its variations such as the nested-PCR have been outstanding as promising molecular techniques for the fast diagnosis of the tuberculosis (TB). In the present study the nested-PCR was evaluated using as molecular markers the sequence IS6110 and the antigen b applied to the diagnosis of TB. One hundred and thirty six clinical samples of patients with suspicion of TB were submitted to the baciloscopia, culture and nested-PCR. The diagnosis of pulmonary tuberculosis was attributed to 116 patients, of these, 97 were multi-bacilli and 111 presented positive culture for M. tuberculosis. The nested-PCR reactions identified 70 percent (antigen b) and 94 percent (IS6110) of the acid-fast smear negative cases of tuberculosis. The sensibility values determined for culture, and nested-PCR of IS6110 and antigen b were 95 percent, 98 percent and 86 percent, respectively. The specificity was 100 percent, 15 percent and 45 percent for culture, nested-PCR of IS6110 and antigen b, respectively. The molecular diagnosis of the tuberculosis should be based in the combined analysis of several parameters, as the baciloscopia, culture, clinical manifestations, therapeutic proves and previous history of tuberculosis.

Diagnóstico nutricional de pacientes internados por tuberculose em Belém do Pará

Doenças infecciosas crônicas, como a tuberculose (TB), são causas de distúrbios metabólicos que interferem na utilização e mobilização de nutrientes corporais, afetando o estado nutricional. A função imunológica de doentes desnutridos é alterada, o que implica maior incidência de infecções. Neste estudo objetivou-se diagnosticar o estado nutricional de pacientes recém-internados por tuberculose no Hospital Universitário João de Barros Barreto, em Belém, aplicando uma técnica de avaliação subjetiva global (ASG) e verificando sua concordância com um método objetivo, o índice de massa corporal (IMC). Foi utilizado o método indutivo-descritivo e parte dele descritivo-analítico, transversal, tendo como população de referência pacientes de tuberculose encaminhados para hospitalização, excluindo aqueles com meningite tuberculosa. As variáveis controladas foram peso, altura, sexo, formas de TB, alterações de peso, de gordura subcutânea, de massa muscular, da ingestão alimentar e da capacidade funcional, a presença de sintomas gastrointestinais, sinais de edema e ascite. O perfil nutricional observado foi de 77,8% de desnutridos, sendo, destes, 83,78% moderados e 16,22% graves, com um IMC médio de 18,66 ± 3,86 Kg/m2. A maioria relatou perda ponderal nos últimos seis meses antes da internação, em níveis de 5% a 10% do seu peso habitual; 73,82% relataram modificação para menos na ingesta alimentar, e presença de sintomas gastrointestinais em 64,58% deles, sendo a anorexia o mais freqüente, seguida de náuseas, vômitos e diarréia. A perda da capacidade funcional foi referida em 100% (nutridos e desnutridos). Ao exame físico foi possível perceber que 79,16% apresentavam perda de gordura subcutânea e massa muscular, conjuntamente, e nenhum caso apresentou edema ou ascite. A tuberculose pulmonar foi a mais incidente, sendo encontrados três casos de TB ganglionar e um de TB óssea, associada à aids. O IMC, em relação à ASG, apresentou um coeficiente de Kappa igual a 0,47, validade sensível de 67% e especificidade de 100%. A ASG se mostrou uma técnica de boa aplicabilidade, demonstrando na prática dados inerentes não só ao estado nutricional, mas também ao modo de vida dos indivíduos, oferecendo subsídios relevantes para a terapêutica no nível hospitalar(Resumo íntegra vide documento)

Estudo de abcesso pulmonar em pacientes internados no Hospital Universitário João de Barros Barreto

Os autores apresentam um estudo das características clinicas e radiológicas de abscesso pulmonar em 194 pacientes internados no Hospital Universitário João de Barros Barreto e mostram os elementos considerados no diagnóstico, a conduta dotada e a evolução apresentada pelos pacientes

Perfil sócio-econômico de pacientes asmáticos atendidos ambulatorialmente no HUJBB

A asma brônquica é uma doença inflamatória crônica das vias aéreas que atinge pessoas de todas as idades e ambos os sexos,com prevalência estimada entre (cinco e dez porcento) da população mundial e morbi-mortalidade fortemente influenciadas pelo status sócio-econômico.seu tratamento farmacológico prevê o uso frequente e ou contínuo de medicamentos,os quais pelo seui alto custo,são de dificil aquisição por significativa parcela da população brasileira.os autores apresentam um estudo do perfil sócio-econômico de 134 portadores de asma brônquica acompanhados ambulatorialmente no HUJBB,no período de março a junho de 1995.Entre os resultados encontrados destacam a renda familiar mediana de R$300,00,opercentual de (setenta e dois porcento) da clientela portadores da forma moderada e grave da doença e oalto grau de comprometimento de sua renda pelo custo do tratamento medicamentoso.Concluem,portanto,que é necessário criar parâmetros para selecionar dentre a clientela assistida aqueles que não dosem de meios para arcar com o seu tratamento, com qual deve ser garantido pelo sistema de saúde

Infecção pulmonar por mycobacterium chelonae: relato de um caso

A autora relata o caso de uma paciente de 56 anos,sexo feminino,considerada comoportadora de Tuberculose Pulmonar,diagnosticada em abril de 1993,com base em baciloscopia do escarro positiva para BAAR e que,apesar do tratamento regular,apresentava evolução clinico-radiológica e baciloscopica insatisfatória.Ao ser admitida no ambulatório de pneumologia do HUJBB em janeiro de 1994,já utilizando o esquema de reserva para turberculose,a investigação bacteriológica mediante identificação da micobactéria,constatou tratar-se de um caso de micobacteriose atípica por Mycobacterium Chelonae.A paciente evolui regularmente sem tratamento específico e,em face do comprometimento pulmonar ser unilateral direito,encontra-se em estudo cirúrgico para ressecção pulmonar direita

Reabilitaçäo pulmonar em portadores de insuficiência respiratória - um trabalho multiprofissional no Hospital Universitário Joäo de Barros Barreto / Pulmonar rehabilitation in patients of respiratory insufficiency

Os autores apresentam um estudo de 26 pacientes portadores de insuficiência respiratória, acompanhados no HUJBB durante programa multidisciplinar de reabilitaçäo respiratória de 6 meses de duraçäo; mostram os dados clínico-funcionais considerados para a avaliaçäo e descrevem os resultados obtidos, comparando=os com a literatura consultada

Notificaçäo de casos de tuberculose pelo Hospital Universitário Joäo de Barros Barreto no ano de 1993

Os autores analisam a notificaçäo dos casos de tuberculose no Ano de 1993 pelo Hospital Universitário Joäo de Barros Barreto, utilizando os dados da ficha padronizada pelo PNCT - Programa Nacional de Controle da Tuberculose do Ministério da Saúde = mostram os aspéctos epidemiológicos; as formas de diagnóstico e analisam a importância das informaçöes apresentadas visto que representam 20 por cento de todos os casos diagnosticados no Estado do Pará