ABSTRACT
PURPOSE: The purpose of this study is to evaluate the frequency of viral and bacterial respiratory pathogens detected by molecular methods in sputum samples of patients hospitalized for COVID-19 and to evaluate its impact on mortality and unfavorable outcomes (in-hospital death or mechanical ventilation). PATIENTS AND METHODS: The prospective cohort included patients with diagnosis of COVID-19 hospitalized at Hospital Nacional Hipólito Unanue. Sociodemographic and clinical data were collected from clinical records. Sputum samples were analyzed with the Biofire Filmarray Pneumonia plus® respiratory panel. Crude and adjusted associations with unfavorable outcomes were evaluated using logistic regression models. RESULTS: Ninety-three patients who were able to collect sputum samples were recruited between September 8 and December 28, 2020. The median age was 61.7 years (IQR 52.3-69-8) and 66 (71%) were male. The most frequent symptoms were dyspnea, cough, fever, and general malaise found in 80 (86%), 76 (82%), 45 (48%), and 34 (37%) patients, respectively. Fifty-three percent of patients had comorbidities. Seventy-six (82%) patients received antibiotics prior to admission and 29 (31%) developed unfavorable outcome. Coinfection was evidenced in 38 (40.86%) cases. The most frequently found bacteria were Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae, Haemophilus influenzae and Klebsiella pneumoniae in 11 (11.83%), 10 (10.75%), 10 (10.75%), and 8 (8.6%) cases, respectively. Streptococcus pneumoniae was found in one case (1.08%). We neither identify atypical bacteria nor influenza virus. No association was found between the presence of viral or bacterial microorganisms and development of unfavorable outcomes (OR 1.63; 95% CI 0.45-5.82). CONCLUSION: A high frequency of respiratory pathogens was detected by molecular methods in patients with COVID-19 pneumonia but were not associated with unfavorable outcomes. No atypical agents or influenza virus were found. The high use antibiotics before admission is a concern. Our data suggest that the use of drug therapy against atypical bacteria and viruses would not be justified in patients hospitalized for COVID-19.
ABSTRACT
Objetivo: determinar el efecto de la pronación consciente en la saturación de oxígeno (SaO2) en pacientes hospitalizados por COVID-19. Métodos: estudio de corte transversal analítico. La población estuvo conformada por los pacientes hospitalizados en uno de los pabellones por COVID-19 en el Hospital Nacional Hipólito Unanue durante el periodo junio a agosto del 2020. Se realizó un muestreo por conveniencia de tipo consecutivo de todos los pacientes comprendidos en el periodo de estudio. Se incluyó a pacientes hospitalizados mayores de 18 años, con el diagnóstico de neumonía por COVID-19. Fueron excluidos aquellos con algún grado de encefalopatía, post operados, gestantes, pacientes con inestabilidad hemodinámica. Se comparó la media de saturación arterial de oxígeno (SaO2) basal con la obtenida luego de una y dos horas de pronación. Asimismo, se evaluaron los factores asociados al cambio en la saturación. Resultados: de los 198 pacientes hospitalizados incluidos en el estudio, 144 (72.7%) fueron varones. El 31,8% eran mayores de 65 años y 30.3% menores de 49 años. La hipertensión arterial estaba presente en el 62,6%, siendo la comorbilidad más común seguida de la diabetes mellitus y la obesidad. La media de la SaO2 antes de la pronación fue de 89,4±0,24, incrementándose significativamente (p<0,001) a la hora posterior a la pronación a 95,6±0,30. A las dos horas, la media de SaO2 se incrementó a 96,7±0,30 (p < 0,001). En el análisis multivariado, el mayor recuento de linfocitos y plaquetas se asociaron en forma significativa a una mejor respuesta a la pronación, mientras que el antecedente de tuberculosis y los niveles de urea se asociaron a una menor respuesta. Conclusión: la pronación consciente se asocia a mejoras significativas en la SaO2 luego de una y dos horas de realizada la intervención. Esta intervención debe ser incluida en los protocolos de atención hospitalaria en el paciente con neumonía grave asociada a COVID-19.
