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1.
PLoS One ; 7(12): e51196, 2012.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-23236453

ABSTRACT

We investigated if the transcriptional response of Salmonella Typhimurium to temperature and acid variations was hysteretic, i.e. whether the transcriptional regulation caused by environmental stimuli showed memory and remained after the stimuli ceased. The transcriptional activity of non-replicating stationary phase cells of S. Typhimurium caused by the exposure to 45 °C and to pH 5 for 30 min was monitored by microarray hybridizations at the end of the treatment period as well as immediately and 30 minutes after conditions were set back to their initial values, 25 °C and pH 7. One hundred and two out of 120 up-regulated genes during the heat shock remained up-regulated 30 minutes after the temperature was set back to 25 °C, while only 86 out of 293 down regulated genes remained down regulated 30 minutes after the heat shock ceased. Thus, the majority of the induced genes exhibited hysteresis, i.e., they remained up-regulated after the environmental stress ceased. At 25 °C the transcriptional regulation of genes encoding for heat shock proteins was determined by the previous environment. Gene networks constructed with up-regulated genes were significantly more modular than those of down-regulated genes, implying that down-regulation was significantly less synchronized than up-regulation. The hysteretic transcriptional response to heat shock was accompanied by higher resistance to inactivation at 50 °C as well as cross-resistance to inactivation at pH 3; however, growth rates and lag times at 43 °C and at pH 4.5 were not affected. The exposure to pH 5 only caused up-regulation of 12 genes and this response was neither hysteretic nor accompanied of increased resistance to inactivation conditions. Cellular memory at the transcriptional level may represent a mechanism of adaptation to the environment and a deterministic source of variability in gene regulation.


Subject(s)
Antifreeze Proteins/metabolism , Gene Expression Regulation/physiology , Heat-Shock Response/physiology , Salmonella typhimurium/growth & development , Transcription, Genetic/physiology , Analysis of Variance , Hot Temperature , Hydrogen-Ion Concentration , Microarray Analysis , Protein Folding
2.
Foodborne Pathog Dis ; 8(1): 141-8, 2011 Jan.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-20932086

ABSTRACT

Stochastic models are useful for estimating the risk of foodborne illness and they can be integrated, besides other sources of variability, into microbial risk assessment. A stochastic approach to evaluate growth of two strains of Listeria monocytogenes influenced by different factors affecting microbial growth (pH and storage temperature) was performed. An individual-based approach of growth through optical density measurements was used. From results obtained, histograms of the lag phase were generated and distributions were fitted. Histograms presented increased variation when the factors applied were suboptimal for L. monocytogenes and they were combined. The extreme value distribution was ranked as the best one in most cases, whereas normal was the poorest fitting distribution. To evaluate the influence of pH and storage temperature on L. monocytogenes CECT 5672 in real food, commercial samples of courgette and carrot soup were inoculated with this pathogen. It was able to grow in both soups at storage temperatures from 4°C to 20°C. Using the distributions adjusted, predictions of time to growth (10² cfu/g) of L. monocytogenes were established by Monte Carlo simulation and they were compared with deterministic predictions and observations in foods.


Subject(s)
Food Microbiology , Listeria monocytogenes/growth & development , Models, Biological , Models, Statistical , Temperature , Colony Count, Microbial , Hydrogen-Ion Concentration , Monte Carlo Method , Stochastic Processes
3.
Appl Environ Microbiol ; 76(9): 2908-15, 2010 May.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-20208022

ABSTRACT

The dynamic model for the growth of a bacterial population described by Baranyi and Roberts (J. Baranyi and T. A. Roberts, Int. J. Food Microbiol. 23:277-294, 1994) was applied to model the lag period and exponential growth of Listeria monocytogenes under conditions of fluctuating temperature and water activity (a(w)) values. To model the duration of the lag phase, the dependence of the parameter h(0), which quantifies the amount of work done during the lag period, on the previous and current environmental conditions was determined experimentally. This parameter depended not only on the magnitude of the change between the previous and current environmental conditions but also on the current growth conditions. In an exponentially growing population, any change in the environment requiring a certain amount of work to adapt to the new conditions initiated a lag period that lasted until that work was finished. Observations for several scenarios in which exponential growth was halted by a sudden change in the temperature and/or a(w) were in good agreement with predictions. When a population already in a lag period was subjected to environmental fluctuations, the system was reset with a new lag phase. The work to be done during the new lag phase was estimated to be the workload due to the environmental change plus the unfinished workload from the uncompleted previous lag phase.


Subject(s)
Listeria monocytogenes/growth & development , Models, Biological , Temperature , Water
4.
BMC Syst Biol ; 3: 108, 2009 Nov 16.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-19917103

ABSTRACT

BACKGROUND: The aging process of bacteria in stationary phase is halted if cells are subcultured and enter lag phase and it is then followed by cellular division. Network science has been applied to analyse the transcriptional response, during lag phase, of bacterial cells starved previously in stationary phase for 1 day (young cells) and 16 days (old cells). RESULTS: A genome scale network was constructed for E. coli K-12 by connecting genes with operons, transcription and sigma factors, metabolic pathways and cell functional categories. Most of the transcriptional changes were detected immediately upon entering lag phase and were maintained throughout this period. The lag period was longer for older cells and the analysis of the transcriptome revealed different intracellular activity in young and old cells. The number of genes differentially expressed was smaller in old cells (186) than in young cells (467). Relatively, few genes (62) were up- or down-regulated in both cultures. Transcription of genes related to osmotolerance, acid resistance, oxidative stress and adaptation to other stresses was down-regulated in both young and old cells. Regarding carbohydrate metabolism, genes related to the citrate cycle were up-regulated in young cells while old cells up-regulated the Entner Doudoroff and gluconate pathways and down-regulated the pentose phosphate pathway. In both old and young cells, anaerobic respiration and fermentation pathways were down-regulated, but only young cells up-regulated aerobic respiration while there was no evidence of aerobic respiration in old cells.Numerous genes related to DNA maintenance and replication, translation, ribosomal biosynthesis and RNA processing as well as biosynthesis of the cell envelope and flagellum and several components of the chemotaxis signal transduction complex were up-regulated only in young cells. The genes for several transport proteins for iron compounds were up-regulated in both young and old cells. Numerous genes encoding transporters for carbohydrates and organic alcohols and acids were down-regulated in old cells only. CONCLUSION: Network analysis revealed very different transcriptional activities during the lag period in old and young cells. Rejuvenation seems to take place during exponential growth by replicative dilution of old cellular components.


Subject(s)
Cell Cycle/physiology , Escherichia coli/physiology , Gene Expression Regulation, Bacterial/physiology , Gene Regulatory Networks/genetics , Transcription, Genetic/physiology , Age Factors , Carbohydrate Metabolism/physiology , Gene Regulatory Networks/physiology , Oligonucleotide Array Sequence Analysis , Oxidative Stress/physiology , Stress, Physiological/physiology , Transcription Factors/metabolism , Vesicular Transport Proteins/metabolism
5.
Rev. cuba. plantas med ; 1(3): 31-6, sept.-dic. 1996. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-186784

ABSTRACT

Se estudio el efecto de formulas que contenian un extracto acuoso de Aloe vera L. sobre las lesiones de la mucosa gastrica de ratas, producidas por los modelos experimentales de estres, etanol e indometacina. Se usaron tres formulas que contenian un extracto de la planta en concentraciones de 12,5; 25 y 50 porciento, respectivamente, en un vehiculo en forma de gel. Se usaron cinco grupos de tratamiento que recibieron, por via oral, cada una de las formulas en dosis que correspondienron a 3,6; 7,4 y 14,6 mg del material vegetal/kg de peso, respectivamente, durante cinco dias; un grupo control que recibio el vehiculo solamente y un grupo que recibio agua comun. Se determino tambien el efecto de la formula que contenia el extracto al 50 porciento sobre la secrecion acida basal y sobre la generacion de prostaglandinas (PGE2 y 6-keto-PGF1) en la mucosa gastrica. De las formulas probadas, solo la que contenia el extracto al 50 porciento disminuyeron significativamente el numero y la severidad de las lesiones gastricas inducidas por los tres agentes ulcerogenos, sin afectar la secrecion acida. Esta formula tampoco afecto la generacion mucosal de prostaglandinas. Se concluye que la formula con extracto de Aloe vera al 50 porciento podria constituir una laternativa terapeutica en el tratamiento de la ulcera gastroduodenal y que su accion gastroprotectora parece ser independiente de la secrecion de acido y de la generacion de prostaglandinas en la mucosa gastrica


Subject(s)
Animals , Male , Female , Rats , Aloe , Anti-Ulcer Agents/pharmacology , Plant Extracts/pharmacology , Rats, Wistar
6.
Rev. cuba. plantas med ; 1(3): 31-6, sept.-dic. 1996. tab
Article in Spanish | CUMED | ID: cum-8371

ABSTRACT

Se estudió el efecto de fórmulas que contenían un extracto acuoso de Aloe vera L. sobre las lesiones de la mucosa gástrica de ratas, producidas por los modelos experimentales de estrés, etanol e indometacina. Se usaron tres fórmulas que contenían un extracto de la planta en concentraciones de 12,5; 25 y 50 porciento, respectivamente, en un vehículo en forma de gel. Se usaron cinco grupos de tratamiento que recibieron, por vía oral, cada una de las fórmulas en dosis que correspondienron a 3,6; 7,4 y 14,6 mg del material vegetal/kg de peso, respectivamente, durante cinco días; un grupo control que recibió el vehículo solamente y un grupo que recibió agua común. Se determinó también el efecto de la fórmula que contenía el extracto al 50 porciento sobre la secreción ácida basal y sobre la generación de prostaglandinas (PGE2 y 6-keto-PGF1) en la mucosa gástrica. De las fórmulas probadas, sólo la que contenía el extracto al 50 porciento disminuyeron significativamente el número y la severidad de las lesiones gástricas inducidas por los tres agentes ulcerógenos, sin afectar la secreción ácida. Esta fórmula tampoco afectó la generación mucosal de prostaglandinas. Se concluye que la fórmula con extracto de Aloe vera al 50 porciento podría constituir una laternativa terapeútica en el tratamiento de la úlcera gastroduodenal y que su acción gastroprotectora parece ser independiente de la secreción de ácido y de la generación de prostaglandinas en la mucosa gástrica (AU)


Subject(s)
Animals , Male , Female , Rats , Anti-Ulcer Agents/pharmacology , Aloe , Plant Extracts/pharmacology , Rats, Wistar
7.
Rev. cuba. plantas med ; 1(3): 31-6, 1996.
Article in Spanish | CUMED | ID: cum-16303

ABSTRACT

Se estudió el efecto de fórmulas que contenían un extracto de Aloe vera L. sobre las lesiones de la mucosa gástrica de ratas, producidas por los modelos experimentales de estrés, etanol e indometacina. Se usaron tres fórmulas que contenían un extracto de la planta en concentraciones de 12,5; 25 y 50 porciento, respectivamente, en un vehículo en forma de gel. Se usaron cinco grupos de tratamiento que recibieron, por vía oral, cada una de las fórmulas en dosis que correpondieron a 3,6; 7,4 y 14,6 mg del material vegetal/kg de peso, respectivamente, durante cinco días; un grupo control que recibió el vehículo solamente y un grupo que recibió agua común. Se determinó también el efecto de la fórmula que contenía el extracto al 50 porciento sobre la secreción ácida basal y sobre la generación de prostaglandinas (PGE2 y 6-keto-PGF1) en la mucosa gástrica. De las fórmulas probadas, sólo la que contenía el extracto al 50 porciento disminuyeron significativamente el número y la severidad de las lesiones gástricas inducidas por los tres agentes ulcerógenos, sin afectar la secreción ácida. Esta fórmula tampoco afectó la generación mucosal de prostaglandinas. Se concluye que la fórmula con extracto de Aloe vera al 50 porciento podría constituir una alternativa terapéutica en el tratamiento de la úlcera gastroduodenal y que su acción gastroprotectora parece ser independiente de la secreción de ácido y de la generación de prostaglandinas en la mucosa gástrica (AU)


Subject(s)
Anti-Ulcer Agents , Chemistry, Pharmaceutical , Gastric Mucosa , Rats
8.
Rev. cuba. farm ; 24(2): 297-303, mayo-dic. 1990. tab
Article in Spanish | CUMED | ID: cum-1632

ABSTRACT

Se estudió la actividad antiulcerosa de 1 extracto total de Bidens pilosa Lin y de 3 fracciones, denominadas A, B y C, producto del fraccionamiento fitoquímico del primero, en un modelo experimental de producción de lesiones gástricas en ratas sometidas a estrés por inmovilización y frío. Se analizaron el volumen, la acidez y el pH del jugo gástrico con el fin de determinar si la Bidens pilosa modificaba la secreción gástrica de las ratas sometidas a estrés. Se realizó también un estudio histoquímico de la secreción de mucosustancias en la mucosa gástrica de ratas que recibieron el extracto total y sus controles. Tanto el extracto total como las 3 fracciones mostraron una evidente actividad antiulcerosa, expresada por una disminución del número y la severidad de las lesiones, así como del índice de lesión que fue altamente significativo en el extracto total y en la fracción B. Ninguna de las formas administradas de Bidens pilosa produjo variaciones significativas en el volumen, acidez o pH de la secreción gástrica en las ratas sometidas a estrés por inmovilización y frío. La secreción de mucosustancias neutras y ácidas fue aproximadamente similar en las ratas que recibieron extracto total y las que recibieron agua; hubo un predominio de las neutras en las primeras (similar a las normales) y de las ácidas en las segundas


Subject(s)
Rats , Animals , Plants, Medicinal , Anti-Ulcer Agents/therapeutic use , Plant Extracts/therapeutic use , Gastric Mucosa
9.
Rev. cuba. farm ; 24(2): 297-303, mayo-dic. 1990. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-93404

ABSTRACT

Se estudió la actividad antiulcerosa de 1 extracto total de Bidens pilosa Lin y de 3 fracciones, denominadas A, B y C, producto del fraccionamiento fitoquímico del primero, en un modelo experimental de producción de lesiones gástricas en ratas sometidas a estrés por inmovilización y frío. Se analizaron el volumen, la acidez y el pH del jugo gástrico con el fin de determinar si la Bidens pilosa modificaba la secreción gástrica de las ratas sometidas a estrés. Se realizó también un estudio histoquímico de la secreción de mucosustancias en la mucosa gástrica de ratas que recibieron el extracto total y sus controles. Tanto el extracto total como las 3 fracciones mostraron una evidente actividad antiulcerosa, expresada por una disminución del número y la severidad de las lesiones, así como del índice de lesión que fue altamente significativo en el extracto total y en la fracción B. Ninguna de las formas administradas de Bidens pilosa produjo variaciones significativas en el volumen, acidez o pH de la secreción gástrica en las ratas sometidas a estrés por inmovilización y frío. La secreción de mucosustancias neutras y ácidas fue aproximadamente similar en las ratas que recibieron extracto total y las que recibieron agua; hubo un predominio de las neutras en las primeras (similar a las normales) y de las ácidas en las segundas


Subject(s)
Rats , Animals , Anti-Ulcer Agents/therapeutic use , Gastric Mucosa/drug effects , Plant Extracts/therapeutic use , Plants, Medicinal
10.
Rev. méd. Panamá ; 12(3): 165-72, sept. 1987.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-43416

ABSTRACT

Durante el período comprendido entre Enero y Marzo de 1986 fueron examinadas 183 prostitutas para determinar la incidencia de ADN del virus de papiloma humano (VPH). Ellas acudían a las clínicas de Higiene Social, coordinadas por el Ministerio de Salud en diferentes Centro de Salud de la Ciudad de Panamá. A cada una de ellas se les efectuó una encuesta epidemiológica, el examen físico, y cultivos virales y bacterianos para la determinación de los agentes de enfermedades de transmisión sexual; además, se les hizo un hisopado del endocervix, para la detección del ADN del virus de papiloma humano (VPH). La infección con el virus se determinó con la técnica de hibridización in situ, en papel filtro de nitrocelulosa, bajo condiciones estrictas y no estrictas. De las 183 prostitutas estudiadas, 41 (22,4%) tenían uno de los tipos de VPH buscados; 31 (16.9%) presentaban los tipos 16-18, y 20 (10.9%) los tipos 6-11, bajo condiciones de hibridización estrictas. Se sugiere que el aumento de la promiscuidad sexual en la población estudiada incrementa el riesgo de infección con el VPH, tipo 16-18


Subject(s)
Adult , Humans , Female , Papillomaviridae/isolation & purification , Tumor Virus Infections/epidemiology , Uterine Cervicitis/microbiology , Sex Work , Panama , Cervix Uteri/microbiology
11.
Rev. cuba. med ; 12(4-5-6): 373-376, jul.-dic. 1973. tab
Article in Spanish | CUMED | ID: cum-26005

ABSTRACT

Se presentan los resultados obtenidos con la prueba de aparición de la bromosulftaleína en bilis, en 64 casos, de los cuales 26, fueron casos de control y 38 casos , de diversas afecciones con íctero: Hepatitis, cirrosis, colestasis intrahepática y colestasis extrahepática. Se expone la técnica empleada, destacándose que el flujo de bilis durante la prueba debe ser continua para que ésta tenga validez(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Jaundice/diagnosis , Cholagogues and Choleretics/pharmacokinetics , Bile
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