A variety of highly divergent eukaryotic ssDNA viruses in sera of pigs.

Over the last decade, viral metagenomics has been established as a non-targeted approach for identifying viruses in stock animals, including pigs. This has led to the identification of a vast diversity of small circular ssDNA viruses. The present study focuses on the investigation of eukaryotic circular Rep-encoding single-stranded (CRESS) DNA viral genomes present in serum of commercially reared pigs from southern Brazil. Several CRESS DNA viral genomes were detected, including representatives of the families Smacoviridae (n=5), Genomoviridae (n=3), Redondoviridae (n=1), Nenyaviridae (n=1) and other yet unclassified genomes (n=9), plus a circular DNA molecule, which probably belongs to the phylum Cressdnaviricota. A novel genus within the family Smacoviridae, tentatively named 'Suismacovirus', comprising 21 potential new species, is proposed. Although the reported genomes were recovered from pigs with clinical signs of respiratory disease, further studies should examine their potential role as pathogens. Nonetheless, these findings highlight the diversity of circular ssDNA viruses in serum of domestic pigs, expand the knowledge on CRESS DNA viruses' genetic diversity and distribution and contribute to the global picture of the virome of commercially reared pigs.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Canine rabies in Rio Grande do Sul caused by an insectivorous bat rabies virus variant

Rabies is caused by rabies virus (RV), a RNA virus member of the Lyssavirus genus, family Rhabdoviridae. The aim of this study was to determine antigenic characteristics of a rabies virus isolate (RV183-07) recovered from a stray bitch that died of rabies and to infer the most likely source of contamination, since no urban rabies has been reported in the area in more than 20 years. The virus was identified by direct immunofluorescence and multiplied by one passage in mice. The antigenic profile of the isolate was determined with a panel of monoclonal antibodies to lyssavirus antigens on infected brain tissues. A fragment of the viral genome corresponding to the nucleoprotein (N) gene was submitted to reverse transcription/polymerase chain reaction and the amplicon obtained was subjected to restriction enzyme analysis. A 303 base pair fragment of the N gene was cloned, sequenced and compared to other RV sequences available at Genbank. The isolate RV183-07 displayed antigenic and genomic characteristics of rabies virus variants whose natural reservoir is the non-hematophagous bat Tadarida brasiliensis. Therefore, the most likely source of contamination of the bitch was an incidental contact with an infected bat of that species, common inhabitants of the area. In view of that, the status of urban rabies-free of the area was not compromised.

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Detecção de possíveis agentes virais associados à circovirose suína

O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um vírus ubíquo que tem sido associado a um número de síndromes em suínos. Entre elas, a Síndrome Multissistêmica do Definhamento dos Suínos (SMDS) tornou-se uma das principais causas de perdas econômicas na suinocultura nacional. No entanto, existe incerteza se o PCV2 é, de fato, o único agente responsável por esse quadro, essencialmente porque a administração isolada do vírus a animais suscetíveis não tem sido capaz de reproduzir experimentalmente a síndrome. Em vista disso, um número de outros agentes infecciosos (e não infecciosos) têm sido examinados e, sua potencial participação no desenvolvimento da SMDS, tem sido pesquisada. No presente estudo foram realizados experimentos visando determinar se outro(s) agente(s) com genoma de DNA circular poderia(m) desempenhar algum papel no desenvolvimento da SMDS. Para tanto, a técnica denominada amplificação por círculo rolante com múltiplos primers (ACRMP) foi empregada. A ACRMP é baseada na atividade da DNA polimerase do fago phi29, uma enzima capaz de sintetizar novas moléculas de DNA a partir de um molde de DNA circular. Numa segunda etapa, o DNA amplificado é clivado com enzimas de restrição, ocasionando a linearização de grande quantidade de cópias do DNA alvo original. Como a ACRMP é realizada com primers aleatórios, nenhum conhecimento prévio da seqüência de nucleotídeos alvo é necessári

Estudo antigênico de amostras do vírus da raiva isoladas no Rio Grande do Sul, Brasil

O vírus da raiva (VR) membro do gênero Lyssavirus, família Rhabdoviridae, apresenta sete genotipos presentemente identificados, sendo o VR classificado como genotipo 1. Além disso, o VR é o único membro do gênero Lyssavirus até o presente identificado na América do Sul. Apesar de ser considerado muito estável antigenicamente, diferenças têm sido encontradas entre amostras isoladas de diferentes espécies, as quais são denominadas variantes. Buscando a identificação de possíveis variantes ou lissavírus de outros genotipos circulantes no Estado do Rio Grande do Sul, foram examinadas 47 amostras de VR isoladas de diferentes espécies (bovinos, morcegos não-hematófagos e eqüino), coletadas entre janeiro de 2004 e fevereiro de 2005. As amostras foram submetidas à caracterização antigênica com um painel constituído por 12 anticorpos monoclonais (AcMs) dirigidos contra antígenos de lissavírus. Através dessa análise foi possível confirmar que todos os isolados examinados eram membros do genótipo 1. Além disso, foi possível identificar dois grupos antigenicamente distintos, sendo que o maior deles incluiu a maioria das amostras examinadas (39 de bovinos, 4 de morcegos não hematófagos e uma de eqüino). Um outro grupo foi constituído por duas amostras isoladas de morcegos não hematófagos e uma terceira, de origem bovina, que apresentava um perfil diferenciado de reatividade antigênica. Ta

Estudo antigênico de amostras do vírus da raiva isoladas no Rio Grande do Sul, Brasil

O vírus da raiva (VR) membro do gênero Lyssavirus, família Rhabdoviridae, apresenta sete genotipos presentemente identificados, sendo o VR classificado como genotipo 1. Além disso, o VR é o único membro do gênero Lyssavirus até o presente identificado na América do Sul. Apesar de ser considerado muito estável antigenicamente, diferenças têm sido encontradas entre amostras isoladas de diferentes espécies, as quais são denominadas variantes. Buscando a identificação de possíveis variantes ou lissavírus de outros genotipos circulantes no Estado do Rio Grande do Sul, foram examinadas 47 amostras de VR isoladas de diferentes espécies (bovinos, morcegos não-hematófagos e eqüino), coletadas entre janeiro de 2004 e fevereiro de 2005. As amostras foram submetidas à caracterização antigênica com um painel constituído por 12 anticorpos monoclonais (AcMs) dirigidos contra antígenos de lissavírus. Através dessa análise foi possível confirmar que todos os isolados examinados eram membros do genótipo 1. Além disso, foi possível identificar dois grupos antigenicamente distintos, sendo que o maior deles incluiu a maioria das amostras examinadas (39 de bovinos, 4 de morcegos não hematófagos e uma de eqüino). Um outro grupo foi constituído por duas amostras isoladas de morcegos não hematófagos e uma terceira, de origem bovina, que apresentava um perfil diferenciado de reatividade antigênica. Ta

Estudo antigênico de amostras do vírus da raiva isoladas no Rio Grande do Sul, Brasil

O vírus da raiva (VR) membro do gênero Lyssavirus, família Rhabdoviridae, apresenta sete genotipos presentemente identificados, sendo o VR classificado como genotipo 1. Além disso, o VR é o único membro do gênero Lyssavirus até o presente identificado na América do Sul. Apesar de ser considerado muito estável antigenicamente, diferenças têm sido encontradas entre amostras isoladas de diferentes espécies, as quais são denominadas variantes. Buscando a identificação de possíveis variantes ou lissavírus de outros genotipos circulantes no Estado do Rio Grande do Sul, foram examinadas 47 amostras de VR isoladas de diferentes espécies (bovinos, morcegos não-hematófagos e eqüino), coletadas entre janeiro de 2004 e fevereiro de 2005. As amostras foram submetidas à caracterização antigênica com um painel constituído por 12 anticorpos monoclonais (AcMs) dirigidos contra antígenos de lissavírus. Através dessa análise foi possível confirmar que todos os isolados examinados eram membros do genótipo 1. Além disso, foi possível identificar dois grupos antigenicamente distintos, sendo que o maior deles incluiu a maioria das amostras examinadas (39 de bovinos, 4 de morcegos não hematófagos e uma de eqüino). Um outro grupo foi constituído por duas amostras isoladas de morcegos não hematófagos e uma terceira, de origem bovina, que apresentava um perfil diferenciado de reatividade antigênica. Ta