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1.
Nutr. clín. diet. hosp ; 43(4): 168-174, 13 dec. 2023. tab, graf
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-229963

ABSTRACT

Introducción: El desayuno escolar aporta energía parainiciar su labor académica, su ingesta es fundamental paragarantizar un estado nutricional óptimo y la actividad físicacontribuye en el bienestar físico.Objetivos: Determinar la relación entre la calidad del de-sayuno, actividad física con el estado nutricional. Métodos: Estudio transversal, basado en una muestra bie-tápica estratificada por conglomerados. La muestra fue de699 estudiantes (341 mujeres y 358 varones) del centro edu-cativo de Educación Básica Miguel de Cervantes en el periodode noviembre del 2022 a enero del 2023. Para los análisis es-tadísticos se empleó el software SPSS versión 27. Se utilizó laprueba Chi cuadrado. Resultados: El estado nutricional de los niños fue 58,23%normal, 18,3% sobrepeso, 11,16% obesidad, 9,59% desnu-trición leve y el 3% desnutrición severa. El 48,93% consu-mieron desayuno incompleto, el 39,91% desayuno de pobrecalidad, 5,87% desayuno completo y el 5,29% sin desayunar.Se evidenció una relación entre la calidad del desayuno y laactividad física fue significativo (p<0,000), también existeuna relación entre la calidad del desayuno con el estado nu-tricional de peso /talla (p<0,000) y talla/edad (p<0,000).Conclusiones: Existe relación entre la calidad del desa-yuno con la actividad física y el estado nutricional de los es-colares. Se deben implementar programas educativos sobrealimentación y nutrición para mejorar la calidad de la dieta (AU)


Introduction: School breakfast provides energy to starttheir academic work, its intake is essential to ensure optimalnutritional status and physical activity contributes to physicalwell-being.Objectives: To determine the relationship between break-fast quality, physical activity and nutritional status.Methods: Cross-sectional study, based on a two-stagesample stratified by clusters. The sample consisted of 699students (341 females and 358 males) of the Miguel deCervantes Basic Education School from November 2022 to January 2023. SPSS software version 27 was used for statis-tical analysis. The Chi-square test was used.Results: The nutritional status of the children was58.23% normal, 18.3% overweight, 11.16% obese, 9.59%slightly undernourished and 3% severely undernourished.Incomplete breakfast was consumed by 48.93%, poor qual-ity breakfast by 39.91%, complete breakfast by 5.87% andno breakfast by 5.29%. A relationship between breakfastquality and physical activity was significant (p<0.000), thereis also a relationship between breakfast quality with nutri-tional status of weight/height (p<0.000) and height/age(p<0.000).Conclusions: There is a relationship between breakfastquality with physical activity and nutritional status of schoolchildren. Educational programs on food and nutrition shouldbe implemented to improve the quality of the diet (AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Exercise , Nutritional Status , Breakfast , Obesity/epidemiology , Malnutrition/epidemiology , Cross-Sectional Studies , Ecuador/epidemiology
2.
Nutr. clín. diet. hosp ; 43(1): 108-114, Mar 23, 2023. ilus, graf, tab
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-217973

ABSTRACT

Introducción: La obesidad en los últimos años ha incrementado su prevalencia a nivel nacional e internacional. Las dietas bajas en índice glicémico disminuyen el peso y regula los niveles de insulina en pacientes obesos.Objetivos: Determinar el efecto de una dieta de bajo índice glicémico en mujeres obesas con hiperinsulinemia.Métodos: Estudio analítico, comparativo y longitudinal. El muestreo fue no probabilístico de 102 mujeres; 42 pacientes con dieta normocalórica de 2000 calorías y 60 pacientes con dieta de bajo índice glicémico de 1300-1500 calorías, durante 4 meses. Se calculó el índice de masa corporal (IMC), peso, la circunferencia abdominal valores < 88cm, los triglicéridos <150 mg/dL en ayunas con estuches de reactivos colorimétricos de Trinder y la insulina plasmática basal entre 6-27 uUI/ml. Se realizó la prueba t de Student para las variables peso, circunferencia abdominal e IMC y la prueba de Signos de Wilcoxon, para la variable insulina y triglicéridos.Resultados: En ambas dietas hubo un efecto significativo de pérdida de peso (Δ-1,20; Δ-5,56), IMC (Δ-0,96; Δ-2,29) y circunferencia abdominal (Δ-4,88, Δ-5,03) (p<0,001). Los triglicéridos redujeron sus valores (Δ-5,76; Δ-14) pero no fue significativo en ninguna de las dietas y la dieta con bajo índice glicémico presentó una mejor reducción de la insulina (Δ-1.54) (p<0,001).Conclusiones: Ambas dietas reducen los indicadores antropométricos, la dieta de bajo índice glicémico tuvo un mejor efecto en reducir los niveles de insulina y ninguna de las dietas fue efectivas en la reducción de triglicéridos.(AU)


Introduction: Obesity in recent years has increased itsprevalence nationally and internationally. Low glycemic indexdiets decrease weight and regulate insulin levels in obese pa-tients.Objectives: To determine the effect of a low glycemic in-dex diet in obese women with hyperinsulinemia.Methods: Descriptive, comparative, longitudinal study.The sampling was non-probabilistic of 102 women; 42 patients with a normocaloric diet of 2000 calories and 60 pa-tients with a low glycemic index diet of 1300-1500 caloriesand was conducted for fourth months. Weight was meas-ured, body mass index (BMI) is calculated and waist circum-ference (<82 cm), triglycerides (<150 mg/dL), and basalplasma insulin (5-25 uU/ml) were measured. Student’s t-testwas performed for paired samples on the variables weight,waist circumference, and BMI to compare the effect of a lowglycemic and normocaloric diet before and after treatment.For the variable insulin and triglycerides, the Wilcoxon Signstest is applied.Results: In both diets there was a significant effect ofweight loss (Δ-1,20 kg; Δ-5,56 kg), BMI (Δ-0,96 kg/m2; Δ-2,29 kg/m2) and abdominal circumference (Δ-4,88 cm; Δ-5,03 cm)(p<0,001). Triglycerides decreased their values (Δ-5,76 mg/dL; Δ-14 mg/dL) but it was not significant in anyof the diets and the low glycemic index diet presented a bet-ter insulin reduction (Δ-1,64 uU/ml) (p<0,001).Conclusions: Both diets reduced anthropometric indica-tors, the low glycemic index diet had a better effect in reduc-ing insulin levels and none of the diets was effective in re-ducing triglycerides.(AU)


Subject(s)
Humans , Female , Adult , Middle Aged , Obesity , Glycemic Index , Hyperinsulinism , Diet , Diet, Food, and Nutrition , Insulin , Body Mass Index , Longitudinal Studies , Epidemiology, Descriptive , 52503
3.
Nutr. clín. diet. hosp ; 42(4): 35-42, Dic 4, 2022. tab
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-212970

ABSTRACT

Introducción: La leche materna es un alimento completoen nutrientes, es por ello, que la madre debe recibir una ali-mentación equilibrada que le permita cubrir sus propios re-querimientos nutricionales y la del lactante. Objetivo: Determinar los patrones alimentarios, composi-ción corporal y contenido calórico de la leche materna en madres lactantes. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio descriptivo,transversal. Incluyó a 377 mujeres en periodo de lactanciaque acudieron al Centro Gineco-Obstétrico (CEDIAGO) de laciudad de Guayaquil-Ecuador los años 2018 y 2019. Los pa-trones alimentarios se identificaron a través de la aplicacióndel cuestionario de recordatorio de 24 horas y encuesta defrecuencia de consumo de alimentos. La composición corpo-ral se valoró mediante la determinación del índice de masacorporal y porcentaje de grasa corporal. El contenido calóricose lo estimó con la cantidad de crematócrito o grasa de la leche materna. Resultados: Los patrones alimentarios de las investigadasse caracterizaron por una ingesta adecuada de lácteos, frutas,cereales, carnes, verduras y hortalizas. Las comidas rápidas,snack, productos de pastelería, alimentos procesados y bebidas gaseosas se consumieron en exceso. Tanto el IMC comoel porcentaje de grasa se encontraron en rangos de sobrepeso y obesidad. Finalmente, el contenido calórico de la lechematerna tuvo un promedio de 918,8 ± 221,4. Conclusiones: Tanto el consumo de alimentos como losparámetros antropométricos de las madres lactantes no seasociaron al contenido calórico de la leche materna.(AU)


Introduction: Breast milk is a complete food in nutrients,which is why the mother must receive a balanced diet that al-lows her to cover her own nutritional requirements and thatof the infant. Objective: To determine the eating patterns, body com-position and caloric content of breast milk in lactatingmothers. Materials and Methods: A descriptive, cross-sectionalstudy was carried out. It included 377 lactating women who attended the Gyneco-Obstetric Center (CEDIAGO) in the cityof Guayaquil-Ecuador in 2018 and 2019. Eating patterns wereidentified through the application of the 24-hour recall ques-tionnaire and the food frequency survey. Body compositionwas assessed by determining body mass index and body fatpercentage. The caloric content was estimated with theamount of crematocrit or fat in breast milk. Results: The eating patterns of those investigated werecharacterized by an adequate intake of dairy products,fruits, cereals, meats, vegetables and vegetables. Fastfoods, snacks, pastries, processed foods and soft drinkswere consumed in excess. Both the BMI and the percentageof fat were found in ranges of overweight and obesity.Finally, the caloric content of breast milk had an average of918.8 ± 221.4. Conclusions: Both the food consumption and theanthropometric parameters of the lactating mothers were notassociated with the caloric content of breast milk.(AU)


Subject(s)
Humans , Female , Body Composition , Feeding Behavior , Milk, Human , Mothers , Infant , 24439 , Epidemiology, Descriptive , Cross-Sectional Studies , Ecuador
4.
Nutr. clín. diet. hosp ; 42(2): 26-35, Jul 2022. tab, graf
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-207140

ABSTRACT

Introducción: La correcta alimentación durante la niñezsigue siendo un reto importante dentro del equipo sanitario, puesto que una ingesta insuficiente de alimentos puede provocar desequilibrios nutricionales irreversibles en la salud y prolongarse a edades adultas. Objetivo: Evaluar los parámetros antropométricos y dietéticos de niños internados en un Hospital Público. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, transversal. Incluyó a 262 niños y niñas entre las edadescomprendidas de 1 a 14 años, del área de pediatría del Hospital Abel Gilbert Pontón de la ciudad de Guayaquil Ecuador durante los años 2018 – 2019. Para la recolección dela información se utilizó el cuestionario de frecuencia de consumo de alimentos y recordatorio de 24 horas. Finalmente setomó medidas antropométricas del peso y talla. Resultados: La muestra de investigación estuvo constituida por 151 varones y 111 mujeres que representaron el57,6% y 42,4% respectivamente. La edad media fue de 6,3años, con valores mínimos y máximo de 1,0 y 14,4 respectivamente. El mayor porcentaje de investigados presentaron un estado nutricional normal de acuerdo a los índices peso/edad (81,7%), talla/edad (87,8%) e IMC/edad (76,7%). Con respecto a la ingesta de alimentos se observó un déficit en elconsumo de calorías, macronutrientes y micronutrientes durante la estancia hospitalaria. Los hábitos alimentarios de losinvestigados reflejaron un consumo insuficiente de carnes yderivados (63,7%). En relación con los lácteos (42,4%), verduras (50%) y frutas (58,4%) se encontraron normales. Porúltimo, los cereales (87,8%), comidas rápidas (45,4%), snack(88,2%) y bebidas gaseosas (85,5%) se ingieren en excesodentro de la dieta habitual cuando los niños/as se encuentranen casa.(AU)


Introduction: Proper nutrition during childhood continuesto be an important challenge within the health team, since insufficient food intake can cause irreversible nutritional imbalances in health and continue into adulthood. Objective: To evaluate the anthropometric and dietary parameters of children hospitalized in a Public Hospital. Materials and methods: A descriptive and cross studywas carried out. It included 262 boys and girls between theages of 1 to 14 years, from the pediatric area of the AbelGilbert Pontón Hospital in the city of Guayaquil-Ecuador during the years 2018 - 2019. For the collection of information,the food consumption frequency questionnaire and 24 hourrecall were used. Finally, anthropometric measurements ofweight and height were taken. Results: The research sample consisted of 151 men and111 women who represented 57.6% and 42.4% respectively.The mean age was 6.3 years, with minimum and maximumvalues of 1 and 14.4, respectively. The highest percentage ofthose investigated presented a normal nutritional status according to the indexes weight/age (81.7%), height/age (87.8)and BMI/age (76.7%). Regarding food intake, a deficit in theconsumption of calories, macronutrients and micronutrientswas observed during the hospital stay. The eating habits ofthose investigated reflected an insufficient consumption ofmeat and derivatives (63.7%). In relation to dairy products(42.4%), vegetables (50%) and fruits (58.4%) were normal. Lastly, cereals (87.8%), fast foods (45.4%), snacks (88.2%)and soft drinks (85.5%) are eaten in excess within the usualdiet when children find at home. Conclusions: The anthropometric and dietary evaluationis essential at the time of hospital admission,since it allowsidentifying patients who are at nutritional risk and thus beingable to implement a treatment that adapts to their nutritionalneeds.(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , 51840 , Hospitals, Public , Child Nutrition , Nutritional Status , Body Size , Epidemiology, Descriptive , Cross-Sectional Studies , 52503 , Pediatrics
5.
Nutr. clín. diet. hosp ; 42(2): 58-66, Jul 2022. tab, graf
Article in Spanish | IBECS | ID: ibc-207142

ABSTRACT

Introducción: La etapa de la niñez se caracteriza por un crecimiento lento, constante y progresivo con un incremento de la madurez psicosocial; generalmente los niños participan en distintas actividades de la escuela, donde su rendimiento se encuentra ligado directamente con sus hábitos alimentarios y actividad física. Objetivo: Evaluar los parámetros antropométricos, alimentarios y el rendimiento físico en escolares. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio descriptivo, transversal. Incluyó a 369 niños y niñas entre las edades comprendidas de 6,8 a 12,0 años de la Escuela Particular Clara Prado Olvera del Cantón Palestina-Provincia del Guayas en Ecuador durante el año 2019. Para la recolección de la información se utilizó el cuestionario de frecuencia de consumo de alimentos, se tomó medidas antropométricas como el peso y talla, para medir el rendimiento físico se aplicaron 4 test: lanzamiento de balón, flexión de tronco, corrida en metros y burpee. Resultados: La muestra de investigación estuvo constituida por 170 varones y 199 mujeres que representaron el 46,1% y 53,9% respectivamente. La alimentación se caracterizó por un bajo consumo de lácteos, vegetales, frutas, cereales y carnes. Las comidas rápidas y snack se encontraron dentro de los parámetros normales, ingiriéndose lo menos posible. El mayor porcentaje de investigados presentaron un estado nutricional normal de acuerdo a los índices peso/edad, talla/edad/ e IMC/edad. De las 4 pruebas físicas aplicadas se observó que en 3 necesitan mejorar y se evidenció diferencias estadísticamente significativas (p<0,05) al compararlo con el sexo. Conclusiones: La alimentación balanceada y la actividad física en el escolar, mejora la función cognitiva, estado nutricional y además le permite obtener puntajes más altos en las pruebas de rendimiento físico estandarizadas.(AU)


Introduction: The stage of childhood is characterized byslow, constant and progressive growth with an increase inpsychosocial maturity; generally, children participate in differ-ent school activities, where their performance is directlylinked to their eating habits and physical activity. Objective: Assess anthropometric, food and physical per-formance parameters in schoolchildren. Materials and methods: A descriptive, cross-sectionalstudy was carried out. It included 369 boys and girls betweenthe ages of 6 and 12 years from the Clara Prado Olvera Private School of the Palestine Canton-Guayas Province in Ecuadorduring the year 2019. For the collection of information, thefood consumption frequency questionnaire was used, anthro-pometric measurements such as weight and height weretaken, to measure physical performance, 3 tests were applied:ball throw, trunk flexion and running in meters. Results: The research sample consisted of 170 men and199 women. The diet was characterized by a low consump-tion of dairy products, vegetables, fruits, cereals and meats. Fast foods and snacks were within normal parameters, eatingas little as possible. The highest percentage of those investi-gated presented a normal nutritional status according to theindexes weight/age, height/age/ and BMI/age. Of the 3 phys-ical tests applied, it was observed that 2 need improvement. Conclusions: Balanced nutrition and physical activity atschool improves cognitive function, nutritional status and alsoallows you to obtain higher scores on standardized physicalperformance tests.(AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Child , Anthropometry , Feeding Methods , Diet, Food, and Nutrition , Physical Functional Performance , Motor Activity , Schools , 51840 , Child Nutrition , Cross-Sectional Studies , Epidemiology, Descriptive , Surveys and Questionnaires , 52503 , Food Service, Hospital
6.
Nucleic Acids Res ; 50(W1): W670-W676, 2022 07 05.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-35544234

ABSTRACT

RSAT (Regulatory Sequence Analysis Tools) enables the detection and the analysis of cis-regulatory elements in genomic sequences. This software suite performs (i) de novo motif discovery (including from genome-wide datasets like ChIP-seq/ATAC-seq) (ii) genomic sequences scanning with known motifs, (iii) motif analysis (quality assessment, comparisons and clustering), (iv) analysis of regulatory variations and (v) comparative genomics. RSAT comprises 50 tools. Six public Web servers (including a teaching server) are offered to meet the needs of different biological communities. RSAT philosophy and originality are: (i) a multi-modal access depending on the user needs, through web forms, command-line for local installation and programmatic web services, (ii) a support for virtually any genome (animals, bacteria, plants, totalizing over 10 000 genomes directly accessible). Since the 2018 NAR Web Software Issue, we have developed a large REST API, extended the support for additional genomes and external motif collections, enhanced some tools and Web forms, and developed a novel tool that builds or refine gene regulatory networks using motif scanning (network-interactions). The RSAT website provides extensive documentation, tutorials and published protocols. RSAT code is under open-source license and now hosted in GitHub. RSAT is available at http://www.rsat.eu/.


Subject(s)
Genomics , Transcription Factors , Animals , Transcription Factors/genetics , Genomics/methods , Software , Sequence Analysis, DNA/methods , Gene Regulatory Networks
7.
Rev. argent. cardiol ; 89(5): 422-428, oct. 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1356919

ABSTRACT

RESUMEN Introducción: La oxigenación por membrana extracorpórea venoarterial (ECMO VA) es una intervención de rescate en pacientes con shock cardiogénico (SC), y paro cardiorrespiratorio (PCR) refractarios a las terapias convencionales. Objetivo: Describir las características, y resumir nuestra experiencia inicial de 7 años de pacientes que requirieron ECMO VA por SC o PCR. Material y métodos: Se realizó un estudio de cohorte unicéntrico. Se analizaron retrospectivamente los pacientes adultos consecutivos que fueron asistidos con ECMO VA por SC o PCR refractarios entre 2014 y 2020 en el ICBA Instituto Cardiovascular. Resultados: Se incluyeron 54 pacientes, (54 ± 12 años). El 36,5% presentó miocardiopatía isquémica, y el 23,1% enfermedad valvular significativa. Las indicaciones para ECMO VA fueron: poscardiotomía (43,4%), SC refractario (28,3%), y falla primaria del injerto (20,8%). La reanimación cardiopulmonar previa a la ECMO VA se realizó en el 18,5%. La canulación fue periférica en el 81,5%, el 83,3% se asistió en INTERMACS 1, y el 87% presentaba balón de contrapulsación intraaórtico. La duración de asistencia en ECMO VA fue de 5,5 días (RIC 2,8-10). La tasa de supervivencia en ECMO VA fue del 63% (37% puente a trasplante cardíaco, y 26% recuperación), y al alta del 42,6%. Las complicaciones más frecuentes fueron: sangrado (61,1%), infección (51,9%), y complicaciones tromboembólicas (46,3%). Conclusión: La ECMO VA como tratamiento del SC o PCR refractarios en nuestro centro presentó una sobrevida aceptable al alta hospitalaria. La ECMO VA es un tratamiento efectivo cuando las terapias convencionales fallan, siendo aparentemente útil y aplicable en un país donde existe acceso limitado a los dispositivos de asistencia ventricular compleja.


ABSTRACT Background: Venoarterial extra corporeal membrane oxygenation (VA-ECMO) is a rescue intervention used in patients with cardiogenic shock (CS) or cardiac arrest (CA) refractory to conventional medical therapies. Objective: The aim of the present study is to describe the characteristics and summarize our 7-year experience in patients with CS or CA supported with VA-ECMO. Methods: We conducted a single-center retrospective study analyzing consecutive adult patients requiring VA-ECMO due to refractory CS or CA at ICBA, Instituto Cardiovascular between January 2014 and December 2020. Results: A total age 54 patients were included (54 ± 12 years), 36.5% presented ischemic cardiomyopathy and 23.1% significant valvular heart disease. The indications for VA-ECMO implantation were post-cardiotomy (43.4%), refractory CS (28.3%) and primary graft dysfunction (20.8%). Cardiopulmonary resuscitation before VA-ECMO occurred in 18.5% of the cases. Peripheral cannulation was performed in 81.5% of the cases, 83.3% had INTERMACS profile 1 and 87% were on intraaortic balloon pump. Duration of ventricular assistance on VA- ECMO was 5.5 days (IQR 2.8-10). Survival rate on ECMO VA was 63% (37% as a bridge to cardiac transplantation and 26% as a bridge to recovery) and survival to discharge was 42.6%. The most common complications were hemorrhage (61.1%), infections (51.9%), and thromboembolic complications (46.3%). Conclusion: In our center, VA-ECMO as a treatment for refractory CS or CA showed acceptable survival during ventricular support and on hospital discharge. It is an effective life support treatment to rescue critically ill patients when conventional therapies fail, is apparently useful and can be implemented in a country with limited resources and access to complex ventricular assist devices.

8.
Nucleic Acids Res ; 48(D1): D87-D92, 2020 01 08.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-31701148

ABSTRACT

JASPAR (http://jaspar.genereg.net) is an open-access database of curated, non-redundant transcription factor (TF)-binding profiles stored as position frequency matrices (PFMs) for TFs across multiple species in six taxonomic groups. In this 8th release of JASPAR, the CORE collection has been expanded with 245 new PFMs (169 for vertebrates, 42 for plants, 17 for nematodes, 10 for insects, and 7 for fungi), and 156 PFMs were updated (125 for vertebrates, 28 for plants and 3 for insects). These new profiles represent an 18% expansion compared to the previous release. JASPAR 2020 comes with a novel collection of unvalidated TF-binding profiles for which our curators did not find orthogonal supporting evidence in the literature. This collection has a dedicated web form to engage the community in the curation of unvalidated TF-binding profiles. Moreover, we created a Q&A forum to ease the communication between the user community and JASPAR curators. Finally, we updated the genomic tracks, inference tool, and TF-binding profile similarity clusters. All the data is available through the JASPAR website, its associated RESTful API, and through the JASPAR2020 R/Bioconductor package.


Subject(s)
Binding Sites , Computational Biology , Databases, Genetic , Software , Transcription Factors , Animals , Genomics/methods , Protein Binding , Transcription Factors/metabolism , User-Computer Interface , Web Browser
9.
Comput Struct Biotechnol J ; 17: 1415-1428, 2019.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-31871587

ABSTRACT

Gene regulatory regions contain short and degenerated DNA binding sites recognized by transcription factors (TFBS). When TFBS harbor SNPs, the DNA binding site may be affected, thereby altering the transcriptional regulation of the target genes. Such regulatory SNPs have been implicated as causal variants in Genome-Wide Association Study (GWAS) studies. In this study, we describe improved versions of the programs Variation-tools designed to predict regulatory variants, and present four case studies to illustrate their usage and applications. In brief, Variation-tools facilitate i) obtaining variation information, ii) interconversion of variation file formats, iii) retrieval of sequences surrounding variants, and iv) calculating the change on predicted transcription factor affinity scores between alleles, using motif scanning approaches. Notably, the tools support the analysis of haplotypes. The tools are included within the well-maintained suite Regulatory Sequence Analysis Tools (RSAT, http://rsat.eu), and accessible through a web interface that currently enables analysis of five metazoa and ten plant genomes. Variation-tools can also be used in command-line with any locally-installed Ensembl genome. Users can input personal collections of variants and motifs, providing flexibility in the analysis.

10.
Insects ; 10(10)2019 Oct 01.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-31581467

ABSTRACT

In temperate climates, beekeeping operations suffer colony losses and colony depopulation of Apis mellifera during overwintering, which are associated with biotic and abiotic stressors that impact bees' health. In this work, we evaluate the impacts of abscisic acid (ABA) dietary supplementation on honey bee colonies kept in Langstroth hives. The effects of ABA were evaluated in combination with two different beekeeping nutritional strategies to confront overwintering: "honey management" and "syrup management". Specifically, we evaluated strength parameters of honey bee colonies (adult bee and brood population) and the population dynamics of Nosema (prevalence and intensity) associated with both nutritional systems and ABA supplementation during the whole study (late autumn-winter-early spring). The entire experiment was designed and performed with a local group of beekeepers, "Azahares del sudeste", who showed interest in answering problems associated with the management of honey bee colonies during the winter. The results indicated that the ABA supplementation had positive effects on the population dynamics of the A. mellifera colonies during overwintering and on the nosemosis at colony level (prevalence) in both nutritional strategies evaluated.

11.
Nucleic Acids Res ; 46(W1): W209-W214, 2018 07 02.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-29722874

ABSTRACT

RSAT (Regulatory Sequence Analysis Tools) is a suite of modular tools for the detection and the analysis of cis-regulatory elements in genome sequences. Its main applications are (i) motif discovery, including from genome-wide datasets like ChIP-seq/ATAC-seq, (ii) motif scanning, (iii) motif analysis (quality assessment, comparisons and clustering), (iv) analysis of regulatory variations, (v) comparative genomics. Six public servers jointly support 10 000 genomes from all kingdoms. Six novel or refactored programs have been added since the 2015 NAR Web Software Issue, including updated programs to analyse regulatory variants (retrieve-variation-seq, variation-scan, convert-variations), along with tools to extract sequences from a list of coordinates (retrieve-seq-bed), to select motifs from motif collections (retrieve-matrix), and to extract orthologs based on Ensembl Compara (get-orthologs-compara). Three use cases illustrate the integration of new and refactored tools to the suite. This Anniversary update gives a 20-year perspective on the software suite. RSAT is well-documented and available through Web sites, SOAP/WSDL (Simple Object Access Protocol/Web Services Description Language) web services, virtual machines and stand-alone programs at http://www.rsat.eu/.


Subject(s)
Regulatory Sequences, Nucleic Acid , Software , Genetic Variation , Genomics/history , High-Throughput Nucleotide Sequencing/history , History, 20th Century , History, 21st Century , Internet , Nucleotide Motifs , Software/history
12.
Toxins (Basel) ; 9(3)2017 02 23.
Article in English | MEDLINE | ID: mdl-28241514

ABSTRACT

Scorpion stings on humans are medically relevant because they may contain toxins that specifically target ion channels. During antivenom production, pharmaceutical companies must use a large number of experimental animals to ensure the antivenom's efficacy according to pharmacopeia methods. Here we present an electrophysiological alternative for the evaluation of horse antivenoms produced against two species of Moroccan scorpions: Buthus mardochei and Androctonus mauretanicus. Human sodium and potassium channels and acetylcholine nicotinic receptors were analyzed by standard patch-clamp techniques. The results showed that the antivenom is capable of reversing ion current disruption caused by the venom application. We propose the use of this in vitro technique for antivenom evaluation as an alternative to using a large number of live animals.


Subject(s)
Antivenins/pharmacology , Scorpion Venoms/toxicity , Sodium Channels/physiology , Animal Testing Alternatives , Animals , Electrophysiological Phenomena , HEK293 Cells , Humans , Scorpions
13.
Rev. guatem. cardiol. (Impresa) ; 24(1): 15-17, ene.-jun. 2014.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-869905

ABSTRACT

Objetivos: Determinar el riesgo clínico para desarrollar Hipertensión Arterial según la puntuación predictiva acorto plazo de Framingham en estudiantes de la carrera Médico y Cirujano del Centro Universitario de Oriente. Métodos: Este estudio evalúa el riesgo clínico de desarrollar Hipertensión Arterial en los próximos 4 años, según el score de riesgo de Framingham en los estudiantes de medicina del Centro Universitario de Oriente durante el año 2012. Resultados: Se presentan un riesgo global de 4.2 % según los criterios de Framingham para desarrollar hipertensión arterial en los próximos 4 años. Encontrando cinco veces másriesgo de desarrollar la enfermedad en el sexo masculino (3.58%) que para el sexo femenino (0.70%). Conclusiones: Los resultados muestran un riesgo importante de desarrollar Hipertensión Arterial a e da destempranas en los estudiantes de medicina del Centro Universitario de Oriente.


Objectives: to determine the clinical risk of developing hypertension according to the short-term predictive score Framingham students from the Medical School of Campus of Northwestern of Universidad de San Carlos (CUNORI). Methods: This study evaluates the clinical risk of Hypertension in the next 4 yearsaccording to the Framingham risk score in medical students of CUNORI in 2012. Results overall risk of 4.2%are presented according to the Framingham criteria for developing hypertension in the next 4 years. We Found five times the risk of developing the disease in males (3.58%) than for females (0.70%). Conclusions: The results show a significant risk of developing arterial hypertension at early ages in medical students of CUNORI.


Subject(s)
Humans , Hypertension/complications , Hypertension/diagnosis , Risk Factors , Students, Medical
14.
16.
Rev. argent. coloproctología ; 18(1): 287-296, mar. 2007. ilus, tab
Article in Spanish | BINACIS | ID: bin-122756

ABSTRACT

Antecedentes: La necrosis isquémica o infarto del cecoascendente es una entidad rara, asociada frecuentemente a patologías extracolónicas, como las afecciones cardiológicas, metabólicas (diabetes), trastornos renales crónicos en pacientes en plan de hemodiálisis y traumatismos abdominales con shock hipovolémico. No es frecuente la necrosis isquémica del cecoascendente como único sector involucrado del colon. Objetivo: Analizar factores predisponentes y desencadenantes que contribuyen a la isquemia del cecoascendente, su forma de presentación y su sintomatología. Analizar la utilidad de los exámenes complementarios y definir la táctica quirúrgica adecuada. Diseño: Análisis retrospectivo. Pacientes y Método: En el período comprendido entre los años 1980 y 2005, se trataron en el Complejo Médico Churruca-Visca, ocho pacientes con diagnóstico de necrosis del cecoascendente como único sector colónico involucrado. Cinco (62,5 por ciento) correspondieron al sexo masculino y tres (37,5 por ciento) al femenino. Las edades oscilaron entre los 38 y 80 años con un promedio de 62 años. Cinco pacientes tenían una insuficiencia cardíaca congestiva tratada con diuréticos y digitálicos y tres una insuficiencia renal crónica en plan de hemodiálisis. El cuadro dominante de presentación fue el dolor en la fosa ilíaca derecha con reacción peritoneal. Como estudios preoperatorios se efectuaron análisis de sangre, radiografías de tórax y abdomen, ecografía abdominal y en cuatro casos tomografía axial computada. Todos los pacientes fueron explorados quirúrgicamente, hallando en dos casos necrosis cecal y en los restantes necrosis del cecoascendente. Dos pacientes presentaban una peritonitis purulenta localizada y los restantes una generalizada. Resultados: Se realizó exteriorización de la lesión cecal (cecostomía) en tres pacientes y una hemicolectomía derecha en los otros cinco casos. En estos últimos, en tres se exteriorizaron ambos cabos y en dos se realizó una anastomosis ileotr (AU)


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Aged , Aged, 80 and over , Necrosis/drug therapy , Necrosis/etiology , Necrosis/therapy , Colitis, Ischemic/drug therapy , Colitis, Ischemic/etiology , Colitis, Ischemic/therapy , Cecal Diseases/drug therapy , Cecal Diseases/etiology , Colon, Ascending/blood supply , Colonic Diseases , Cecum/blood supply , Cecum/pathology , Retrospective Studies , Colorectal Surgery/mortality , Reoperation , Age Factors , Sex Factors
17.
Rev. argent. coloproctología ; 18(1): 287-296, mar. 2007. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-471590

ABSTRACT

Antecedentes: La necrosis isquémica o infarto del cecoascendente es una entidad rara, asociada frecuentemente a patologías extracolónicas, como las afecciones cardiológicas, metabólicas (diabetes), trastornos renales crónicos en pacientes en plan de hemodiálisis y traumatismos abdominales con shock hipovolémico. No es frecuente la necrosis isquémica del cecoascendente como único sector involucrado del colon. Objetivo: Analizar factores predisponentes y desencadenantes que contribuyen a la isquemia del cecoascendente, su forma de presentación y su sintomatología. Analizar la utilidad de los exámenes complementarios y definir la táctica quirúrgica adecuada. Diseño: Análisis retrospectivo. Pacientes y Método: En el período comprendido entre los años 1980 y 2005, se trataron en el Complejo Médico Churruca-Visca, ocho pacientes con diagnóstico de necrosis del cecoascendente como único sector colónico involucrado. Cinco (62,5 por ciento) correspondieron al sexo masculino y tres (37,5 por ciento) al femenino. Las edades oscilaron entre los 38 y 80 años con un promedio de 62 años. Cinco pacientes tenían una insuficiencia cardíaca congestiva tratada con diuréticos y digitálicos y tres una insuficiencia renal crónica en plan de hemodiálisis. El cuadro dominante de presentación fue el dolor en la fosa ilíaca derecha con reacción peritoneal. Como estudios preoperatorios se efectuaron análisis de sangre, radiografías de tórax y abdomen, ecografía abdominal y en cuatro casos tomografía axial computada. Todos los pacientes fueron explorados quirúrgicamente, hallando en dos casos necrosis cecal y en los restantes necrosis del cecoascendente. Dos pacientes presentaban una peritonitis purulenta localizada y los restantes una generalizada. Resultados: Se realizó exteriorización de la lesión cecal (cecostomía) en tres pacientes y una hemicolectomía derecha en los otros cinco casos. En estos últimos, en tres se exteriorizaron ambos cabos y en dos se realizó una anastomosis ileotr


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Middle Aged , Aged, 80 and over , Colitis, Ischemic/etiology , Colitis, Ischemic/drug therapy , Colitis, Ischemic/therapy , Cecal Diseases/etiology , Cecal Diseases/drug therapy , Necrosis/etiology , Necrosis/drug therapy , Necrosis/therapy , Age Factors , Colonic Diseases , Cecum/blood supply , Cecum/pathology , Colorectal Surgery/mortality , Colon, Ascending/blood supply , Reoperation , Retrospective Studies , Sex Factors
18.
Rev. argent. coloproctología ; 15(3/4): 18-26, nov. 2004. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-434426

ABSTRACT

Antecedentes: Existe controversia sobre la mejor alternativa quirúrgica para la resolución de la obstrucción de colon izquierdo de origen neoplásico. Las opciones propuestas van desde procedimientos simplemente descompresivos hasta colectomías extendidas. Cuando las condiciones locales y generales del paciente y del medio asistencial son favorables, la cirugía en una etapa mediante resección oncológica y anastomosis inmediata se ha demostrado como la conducta de elección. Objetivo: Analizar nuestra experiencia en pacientes con obstrucción mecánica aguda de colon izquierdo por cáncer y proponer a la resección con anastomosis primaria como la táctica de elección para su resolución. Lugar de aplicación: Complejo Médico Churruca-Visca, Buenos Aires, Argentina. Diseño: estudio observacional retrospectivo consecutivo, sin selección previa. Pacientes y método: entre Enero de 1990 y Junio de 2004 se intervinieron quirúrgicamente 111 pacientes con diagnóstico intraoperatorio de cáncer obstructivo de colon izquierdo. 65 pertenecieron al sexo masculino y 46 al femenino. El promedio de edad fue de 65 años. Se realizó la revisión de historias clínicas, analizando táctica quirúrgica utilizadas en relación al estado general del paciente (ASA), morbilidad y mortalidad. Las tácticas utilizadas fueron: Colostomías transversas de descompresión en 2 casos (1,8 por ciento); Resección sin ánastomosis en 53 casos: (38 Operaciones de Hartmann (34 por ciento), 11 colostomías a cabos divorciados (10 por ciento) y 4 colectomías subtotales con abocamiento (4por ciento)); Resección con anastomosis primaria en 48 casos: (35 resecciones segmentarias (31,5 por ciento),5 resecciones segmentarias con protección (4,5 por ciento) y 14 colectomías subtotales (13 por ciento) y colocación de stent en 2 casos (1,8 por ciento). El porcentaje de resección y anastomosis se elevó al 75 por ciento (45 pacientes de 60) cuando el equipo quirúrgico estuvo integrado por miembros del servicio de Coloproctología. Resultados: La resección sin anastomosis tuvo una morbilidad del 22,64 por ciento y la resección con anastomosis del 13 por ciento, esta última con un índice de dehiscencia anastomótica del 5,55 por ciento.La mortalidad total de la serie fue del 6,30 por ciento... (TRUNCADO)


Subject(s)
Humans , Male , Adolescent , Adult , Female , Middle Aged , Colonic Neoplasms/surgery , Colonic Neoplasms/complications , Intestinal Obstruction/surgery , Anastomosis, Surgical/methods , Colonoscopy/methods , Colostomy/methods , Colostomy/mortality , Morbidity , Treatment Outcome
19.
Cir. Esp. (Ed. impr.) ; 74(3): 124-133, sept. 2003. tab
Article in Es | IBECS | ID: ibc-24892

ABSTRACT

Las lesiones traumáticas del páncreas son infrecuentes y representan aproximadamente el 4 por ciento de las lesiones abdominales, pero conllevan una tasa de morbimortlidad significativa, por lo que su reconocimiento y tratamiento precoz es primordial. El objetivo de este trabajo es presentar una descripción concisa de la perspectiva histórica y de la anatomía de este órgano. Esta última cobra especial interés en la clasificación y manejo de la lesión pancreática. Asimismo, describiremos los métodos de diagnóstico a nuestro alcance en la evaluación del traumatismo pancreático, así como la importancia de disponer de un conocimiento amplio de las técnicas quirúrgicas más utilizadas. Por último, realizaremos un análisis profundo de los rangos de morbilidad y mortalidad de estas lesiones basándonos en una extensa revisión de la bibliografía actual y aportando nuestra experiencia en el manejo de este tipo de lesiones en un centro urbano de trauma de nivel I (AU)


Subject(s)
Humans , Pancreas/injuries , Wounds and Injuries/therapy , Morbidity , Wounds and Injuries/mortality , Wounds and Injuries/diagnosis , Wounds and Injuries/surgery
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