ABSTRACT
Los genotipos del virus de hepatitis C fueron investigados utilizando muestras seroactivas-PCR positivas provenientes de 8 pacientes que concurrieron a nuestra Unidad de Diálisis en Paysandú, Uruguay. Con posteridad a la detección de HCV RNA por reacción de transcripción reversa y reacción de polimerasa en cadena, la genotipificación fue llevada a cabo por ampliación tipo "nested PCR" de la región core de HCV, utilizando sondas genotipo-específicas. Los resultados obtenidos fueron a su vez confirmados por metodología basada en hibridización reversa que detecta los productos ampliados a través de sondas genotipo-específicas marcadas, dirigidas contra porciones de la región 5UTR. Los genotipos de HCV fueron asignados según la clasificación de Simmonds. Cinco pacientes observaron genotipo 1b, uno presentó tipo 3a y uno no fue clasificable. Un paciente negativizó su PCR en el momento en que se llevó a cabo la genotipificación(AU)
Subject(s)
Hepatitis C/genetics , Renal Dialysis , Genotype , Polymerase Chain Reaction/statistics & numerical data , Hybridization, Genetic , Risk Groups , ArgentinaABSTRACT
Los genotipos del virus de hepatitis C fueron investigados utilizando muestras seroactivas-PCR positivas provenientes de 8 pacientes que concurrieron a nuestra Unidad de Diálisis en Paysandú, Uruguay. Con posteridad a la detección de HCV RNA por reacción de transcripción reversa y reacción de polimerasa en cadena, la genotipificación fue llevada a cabo por ampliación tipo "nested PCR" de la región core de HCV, utilizando sondas genotipo-específicas. Los resultados obtenidos fueron a su vez confirmados por metodología basada en hibridización reversa que detecta los productos ampliados a través de sondas genotipo-específicas marcadas, dirigidas contra porciones de la región 5'UTR. Los genotipos de HCV fueron asignados según la clasificación de Simmonds. Cinco pacientes observaron genotipo 1b, uno presentó tipo 3a y uno no fue clasificable. Un paciente negativizó su PCR en el momento en que se llevó a cabo la genotipificación
Subject(s)
Genotype , Renal Dialysis , Hepatitis C/genetics , Hybridization, Genetic , Polymerase Chain Reaction/statistics & numerical data , Risk Groups , ArgentinaABSTRACT
Hepatitis C virus types were investigated by using samples from eight sero-reactive and PCR positive patients attending our Hemodialysis Unit en Paysandú, Uruguay. After HCV RNA detection by reverse transcription and polymerase chain reaction, HCV genotyping was carried out by a nested PCR amplification, using type specific primers of HCV core region. These results were confirmed using a method based upon reverse hybridation of amplified products by enzyme-labeled type-specific probes to portions of the 5' UTR region. HCV genotypes were assigned according to Simmonds' classification. Type 1b was found in five patients, type 3a was found in one and one patient was not classified. There was a patient who became PCR negative at the moment the genotyping was carried out.
