Distribution of hepatitis B virus genotypes among patients with chronic infection.

UNLABELLED: Hepatitis B virus (HBV) can be classified into at least eight genotypes, A-H. We evaluated the distribution HBV genotypes among patients with chronic infection. METHODS: We consecutively evaluated adult patients with chronic HBV infection from Salvador, Brazil. Patients were classified according to HBV infection chronic phases based on HBV-DNA levels and presence of serum HBV markers. HBV-DNA was qualitatively and quantitatively detected in serum by polymerised chain reaction (PCR). Isolates were genotyped by comparison of amino acid mutations and phylogenetic analysis. RESULTS: One-hundred and fourteen patients were evaluated. HBV-DNA was positive in 96 samples. HBV genotype was done in 76. Mean age was 36 +/- 11.3. In 61 of 76 cases subjects were classified as inactive HBsAg carriers. Their mean HBV serum level was 1760 copies/ml and 53 of 61 were infected with HBV genotype A, seven with HBV genotype F and one with genotype B. Twelve of the 76 patients had detectable hepatitis B e-antigen (HBeAg) in serum. Ten were infected with HBV genotype A and two with genotype F; most had increased alanine aminotransferase and high HBV-DNA levels. Three patients were in the immunotolerant phase, two were infected with HBV genotype A and one with genotype F. HBV subtyping showed subtypes adw2 and adw4. CONCLUSIONS: HBV genotype A adw2 and genotype F adw4 were the most prevalent isolates found. We could not find differences in genotype distribution according to HBV clinical phases and DNA levels. We did not detect HBV genotype D in contrast to a previous study in our center with acute hepatitis B. All inactive HBsAg carriers had low HBV-DNA levels.

Caracterização de genomas completos do vírus da hepatite B de diferentes genótipos isolados no Brasil

A infecção pelo Vírus da Hepatite B (HBV) está relacionada a diversas formas de evolução clínica, porém os fatores determinantes do curso clínico da infecção ainda não estão claramente definidos. Diversos estudos têm evidenciado que a variabilidade genética do HBV pode estar associada com diferentes taxas de transmissão, evolução clínica da doença, resposta ao tratamento ou progressão para carcinoma hepatocelular. A prevalência da infecção pelo HBV no Brasil é considerada intermediária, porém algumas regiões apresentam uma elevada endemicidade, apesar disso ainda há poucas informações disponíveis sobre a variabilidade genética das cepas circulantes. O objetivo deste trabalho foi padronizar reações de PCR e seqüenciamento para a caracterização de genomas completos do HBV de diferentes genótipos que circulam no Brasil. Uma amostra previamente determinada como genótipo D foi utilizada para a padronização, posteriormente 30 amostras pertencentes aos diferentes genótipos já caracterizados no Brasil com base na seqüência parcial do gene S foram então caracterizadas. O DNA extraído foi amplificado utilizando-se os “primers” P1 e P2 (Günther et al., 1995) e a mistura de enzimas ELONGASE, sendo que para amplificar algumas amostras houve a necessidade de realização de reações de “nested” PCR. Os produtos amplificados foram purificados e seqüenciados utilizando-se o seqüenciador automático ABI model 377. Com esta metodologia, foram caracterizados 19 genomas completos do HBV (4 genótipo A, 1 genótipo B, 5 genótipo C, 3 genótipo D, 5 genótipo F e 1 genótipo H). A análise filogenética demonstrou que os dois subgruposdo genótipo A (A1 e A2) circulam no Brasil, assim como dois subgrupos (Ib e II) do genótipo F. No gene pré-core foi observada a mutação G1896A, principalmente entre as amostras pertencentes ao genótipo C e D; no genepré-S foram identificadas deleções em duas amostras genótipo F; no gene S de algumas amostras foram identificadas mutações relacionadas ao escape ...

Caracterização de genomas completos do vírus da hepatite B de diferentes genótipos isolados no Brasil / Characterization of complete genomas of the virus of hepatitis B of different isolated genotypes in Brazil

A infecção pelo Vírus da Hepatite B (HBV) está relacionada a diversas formas de evolução clínica, porém os fatores determinantes do curso clínico da infecção ainda não estão claramente definidos. Diversos estudos têm evidenciado que a variabilidade genética do HBV pode estar associada com diferentes taxas de transmissão, evolução clínica da doença, resposta ao tratamento ou progressão para carcinoma hepatocelular. A prevalência da infecção pelo HBV no Brasil é considerada intermediária, porém algumas regiões apresentam uma elevada endemicidade, apesar disso ainda há poucas informações disponíveis sobre a variabilidade genética das cepas circulantes. O objetivo deste trabalho foi padronizar reações de PCR e seqüenciamento para a caracterização de genomas completos do HBV de diferentes genótipos que circulam no Brasil. Uma amostra previamente determinada como genótipo D foi utilizada para a padronização, posteriormente 30 amostras pertencentes aos diferentes genótipos já caracterizados no Brasil com base na seqüência parcial do gene S foram então caracterizadas. O DNA extraído foi amplificado utilizando-se os “primers” P1 e P2 (Günther et al., 1995) e a mistura de enzimas ELONGASE, sendo que para amplificar algumas amostras houve a necessidade de realização de reações de “nested” PCR. Os produtos amplificados foram purificados e seqüenciados utilizando-se o seqüenciador automático ABI model 377. Com esta metodologia, foram caracterizados 19 genomas completos do HBV (4 genótipo A, 1 genótipo B, 5 genótipo C, 3 genótipo D, 5 genótipo F e 1 genótipo H). A análise filogenética demonstrou que os dois subgruposdo genótipo A (A1 e A2) circulam no Brasil, assim como dois subgrupos (Ib e II) do genótipo F. No gene pré-core foi observada a mutação G1896A, principalmente entre as amostras pertencentes ao genótipo C e D; no genepré-S foram identificadas deleções em duas amostras genótipo F; no gene S de algumas amostras foram identificadas mutações relacionadas ao escape d