ABSTRACT
Abstract Some bacteria release volatile organic compounds (VOCs) that can influence the growth of other microorganisms including some pathogens. Identifying bacteria with antifungal activity makes it possible to use such bacteria in the development of biocontrol agents. Thus, the present study focuses on screening VOCs released by eight isolates from Paenibacillus genus, collected at Old Providence and Santa Catalina coral reef (Colombian Caribbean Sea), with antifungal activity against phytopathogenic fungi Colletotrichum gloeosporioides 26B. The VOCs from Paenibacillus sp (PNM-50) showed inhibition rates higher than 50% in the mycelial fungi growth accompanied by macroscopic morphological changes and a reduction in conidiation. In order to identify the VOCs responsible for this antifungal bioactivity, Headspace-Solid Phase Microextraction (HS-SPME) from the bacterial culture was conducted, followed by Gas Chromatography Mass Spectrometry (GC-MS). The chromatographic results revealed a high abundance of VOCs released just by culture media. Once, the difference between VOCs emitted by culture media and bacteria was established, it was possible to make a putative identification of 2-furanmethanol, phenylacetonitrile, and 2,4-dimethylpentanol as possible VOCs responsible for the antifungal activity.
Resumen Algunas bacterias liberan compuestos orgánicos volátiles (COVs) que pueden influir en el crecimiento de otros microorganismos incluyendo algunos patógenos. La identificación de bacterias con actividad antifúngica hace posible el uso de tales bacterias en el desarrollo de agentes de biocontrol. Así pues, en este estudio, se realizó un examen dirigido exclusivamente a los COVs emitidos por ocho aislamientos bacterianos del género Paenibacillus, recolectados en el arrecife de coral de Providencia y Santa Catalina (Mar Caribe colombiano), con actividad antifúngica contra el hongo fitopatógeno Colletotrichum gloeosporioides 26B. Los COVs del aislamiento Paenibacillus sp (PNM-50) mostraron tasas de inhibición superiores al 50% en el crecimiento micelial del hongo, acompañado de cambios morfológicos macroscópicos y una reducción en la conidiación. Para identificar los COVs responsables de esta bioactividad antifúngica, se realizó microextracción en fase sólida del espacio de cabeza (HS-SPME) del cultivo de las bacterias y posterior análisis por cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas (GC-MS). Los resultados cromatográficos revelaron gran abundancia de COVs emitidos por los medios de cultivo. Una vez que se estableció la diferencia entre los COVs emitidos por el medio de cultivo y las bacterias, fue posible identificar tentativamente 2-furanmetanol, fenilacetonitrilo y 2,4-dimetilpentanol como COVs posiblemente responsables de la actividad antifúngica.
Resumo Algumas bactérias liberam compostos orgânicos voláteis (COV) que podem influenciar o crescimento de outros microorganismos, incluindo alguns patógenos. A identificação de bactérias com atividade antifúngica, possibilita seu uso no desenvolvimento de agentes de biocontrole. Neste estudo, foi realizada uma triagem focada nos COV liberados por oito isolados bacterianos do gênero Paenibacillus, coletados nos recifes de coral Old Providence e Santa Catalina (mar do Caribe colombiano), com atividade antifúngica contra fungos fitopatogênicos Colletotrichum gloeosporioides 26B. Os COV de Paenibacillus sp (PNM-50) apresentaram taxas de inibição superiores à 50% sobre o crescimento de fungos miceliais, acompanhadas de alterações morfológicas macroscópicas e redução da conidiação. Para identificar os COV responsáveis por essa bioatividade antifúngica, foi conduzida uma Microextração de Fase Sólida Headspace (HS-SPME) da cultura bacteriana e, em seguida, foi analisada por Cromatografia Gasosa associada à Espectrometria de Massa (GCMS). Os resultados cromatográficos revelaram uma alta abundância de COVs liberados apenas pelos meios de cultura. Uma vez estabelecida a diferença entre os COV emitidos pelos meios de cultura e bactérias, foi possível fazer uma identificação parcial de 2-furanmetanol, fenilacetonitrila e 2,4-dimetilpentanol como possíveis COV responsáveis pela atividade antifúngica.
ABSTRACT
RESUMEN INTRODUCCIÓN: El estado epiléptico (EE) es una condición ocasionada por la falla en los mecanismos de supresión de las crisis epilépticas. Se considera como una urgencia neurológica y obliga al profesional de la salud a conocer las características de presentación para poder estabilizar al paciente. La mortalidad varía entre el 2 % y el 50 % según el grupo etario. OBJETIVO: Construir una serie de sugerencias para el tratamiento del EE, como resultado del consenso por común acuerdo de expertos en epilepsia, teniendo en cuenta el contexto colombiano. MÉTODOS: Se llevó a cabo un consenso formal de expertos con 16 neurólogos-epileptólogos de adultos y niños. Las preguntas y sugerencias fueron revisadas en dos fases, donde fueron calificadas y consensuadas por los participantes. RESULTADOS: Se evaluaron 15 preguntas, con sus respectivas sugerencias sobre el manejo del estado epiléptico, se tuvieron en cuenta referencias bibliográficas relevantes consideradas por los expertos y de acuerdo con el contexto colombiano. CONCLUSIONES: Los resultados de este consenso presentan una serie de sugerencias para el tratamiento del estado epiléptico tanto en los primeros niveles de atención como en los de alta complejidad para mejorar el pronóstico del paciente, de acuerdo con el contexto colombiano.
SUMMARY INTRODUCTION: Status epilepticus is a condition caused by failure in the mechanisms of suppression of epileptic seizures. It is considered a neurological emergency, and mortality varies between 2 % to 50 % according to the age group. Due to the above, it is relevant that health professionals know the characteristics of SE in order to stabilize the patient. OBJECTIVE: To define a series of propositions for the treatment of SE, as a result of consensus by common agreement of experts in epilepsy, taking into account the Colombian context. METHODS: A formal consensus of experts was carried out with 16 adult and pediatric neurologists-epilep-tologists. The questions and propositions were reviewed in two phases, where they were graded and agreed by the participants. RESULTS: Fifteen questions were evaluated on the management of status epilepticus. Relevant bibliographic references were considered by the experts according to the Colombian context. CONCLUSIONS: As results of this consensus we present a series of propositions for the treatment of status epilepticus for the primary level of care and high complexity level of care in order to improve the patient's prognosis, according to the Colombian context.
Subject(s)
Transit-Oriented DevelopmentABSTRACT
INTRODUCCIÓN: las epilepsias genéticas generalizadas (EGG) siguen patrones de herencia compleja. Este fenotipo es producto de la interacción de diferentes genes con factores ambientales. Los genes/loci más consistentemente asociados con este grupo de epilepsias son ECA1, ECA2-GABRG2, ECA3-CLCN2 (también conocido como JME6-CLCN2), JME1-EFHC1 y JME5-GABRA1. En Colombia poco se sabe sobre la contribución de las variantes genéticas en estos genes a la susceptibilidad para ser afectado por cualquiera de las formas de EGG. Nuestro propósito fue evaluar el papel de los cinco genes/loci más consistentemente asociados en otros estudios en un grupo de familias colombianas con EGG. MÉTODOS: se evaluaron dos marcadores para cada locus/gen. Los genotipos se obtuvieron mediante las técnicas de PCR-RFLP y ARMS-Tetraprimer. Los análisis estadísticos incluyeron pruebas de asociación alélica y haplotípica, además de pruebas de interacción gen-gen. RESULTADOS: se incluyeron 98 familias, de las cuales 51 fueron epilepsia de ausencias, mientras que 47 fueron epilepsia mioclónica juvenil. Se identificó una interacción significativa entre el alelo G del marcador rs4428455 (valor P=0,0008; gen GABRA1) y el alelo G de marcador rs719395 (valor P=0,002; gen EFHC1). CONCLUSIÓN: estos dos marcadores parecen incrementar el riesgo de EGG en población colombiana. Otros genes no analizados aquí podrían estudiarse con una muestra de mayor tamaño
INTRODUCTION: Generalized genetic epilepsies (GGE) follow complex inheritance patterns. This phenotype is due to interaction of several genes with environmental factors. The genes/loci most consistently associated with this group of epilepsies are ECA1, ECA2-GABRG2, ECA3-CLCN2 (also known as JME6-CLCN2), JME1-EFHC1 and JME5-GABRA1. In Colombia, little is known about the contribution of gene variants to susceptibility to GGE forms. Our purpose was to evaluate the role of the five most consistently associated genes /loci in other studies, in Colombian families set with GGE. METHODS: Genotypes were obtained by means of PCR-RFLP and ARMS-Tetraprimer. Statistical analyses included both allelic and haplotypic association tests, in addition to gene-gene interaction tests. Two genetic markers were tested for each gene/locus. RESULTS: Ninety-eight families were included, from which 51 had absence epilepsy, and 47 had juvenile myoclonic epilepsy. A significant interaction was identified between allele G at marker rs4428455 (P-value= 0.0008; gene GABRA1) and allele G at marker rs719395 (P-value= 0.002; gene EFHC1). CONCLUSION: Our results suggest that these two markers are associated with GGE in the Colombian population. Other genes not analyzed could be tested using a larger sample size.