Natural SARS-CoV- 2 infection in domestic cats and dogs of humans diagnosed with COVID-19 in Valle de Aburrá, Antioquia / Infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros domésticos de personas con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia

Introducción. El síndrome respiratorio agudo grave causado por el nuevo coronavirus SARSCoV-2 es causa de la emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19. Si bien el humano es el el principal huésped vulnerable, en estudios experimentales y reportes de infección natural, se han encontrado casos de zoonosis inversa de SARS-CoV-2 en animales. OBJETIVO: Evaluar la infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros de propietarios con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. La circulación del SARS-CoV-2 se evaluó por RT-qPCR y RT-PCR en muestras de frotis nasofaríngeos y orofaríngeos de gatos y perros cuyos propietarios se encontraban dentro del periodo de los 14 días de aislamiento. Los casos positivos se verificaron amplificando fragmentos de los genes RdRp, N y E; se secuenció el gen RdRp y se analizó filogenéticamente. RESULTADOS: De 80 animales evaluados, seis gatos y tres perros fueron casos confirmados de infección natural por SARS-CoV-2. Los animales no presentaron signos clínicos y sus propietarios, que padecían la infección, reportaron únicamente signos leves de la enfermedad sin complicaciones clínicas. En el análisis de una de las secuencias, se encontró un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) con un cambio en la posición 647, con sustitución del aminoácido serina (S) por una isoleucina (I). Los casos se presentaron en los municipios de Caldas, Medellín y Envigado. CONCLUSIONES: Se infiere que la infección natural en los gatos y perros se asocia al contacto directo con un paciente con COVID-19. No obstante, no es posible determinar la virulencia del virus en este huésped, ni su capacidad de transmisión  zoonótica o entre especie.

Introducción. El síndrome respiratorio agudo grave causado por el nuevo coronavirus SARSCoV-2 es causa de la emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19. Si bien el humano es el el principal huésped vulnerable, en estudios experimentales y reportes de infección natural, se han encontrado casos de zoonosis inversa de SARS-CoV-2 en animales. Objetivo. Evaluar la infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros de propietarios con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. La circulación del SARS-CoV-2 se evaluó por RT-qPCR y RT-PCR en muestras de frotis nasofaríngeos y orofaríngeos de gatos y perros cuyos propietarios se encontraban dentro del periodo de los 14 días de aislamiento. Los casos positivos se verificaron amplificando fragmentos de los genes RdRp, N y E; se secuenció el gen RdRp y se analizó filogenéticamente. Resultados. De 80 animales evaluados, seis gatos y tres perros fueron casos confirmados de infección natural por SARS-CoV-2. Los animales no presentaron signos clínicos y sus propietarios, que padecían la infección, reportaron únicamente signos leves de la enfermedad sin complicaciones clínicas. En el análisis de una de las secuencias, se encontró un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) con un cambio en la posición 647, con sustitución del aminoácido serina (S) por una isoleucina (I). Los casos se presentaron en los municipios de Caldas, Medellín y Envigado. Conclusiones. Se infiere que la infección natural en los gatos y perros se asocia al contacto directo con un paciente con COVID-19. No obstante, no es posible determinar la virulencia del virus en este huésped, ni su capacidad de transmisión zoonótica o entre especie.

Infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros domésticos de personas con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia / Natural SARS-CoV- 2 infection in domestic cats and dogs of humans diagnosed with COVID-19 in Valle de Aburrá, Antioquia

Introducción. El síndrome respiratorio agudo grave causado por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2 es causa de la emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19. Si bien el humano es el principal huésped vulnerable, en estudios experimentales y reportes de infección natural, se han encontrado casos de zoonosis inversa de SARS-CoV-2 en animales. Objetivo. Evaluar la infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros de propietarios con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. La circulación del SARS-CoV-2 se evaluó por RT-qPCR y RT-PCR en muestras de frotis nasofaríngeos y orofaríngeos de gatos y perros cuyos propietarios se encontraban dentro del periodo de los 14 días de aislamiento. Los casos positivos se verificaron amplificando fragmentos de los genes RdRp, N y E; se secuenció el gen RdRp y se analizó filogenéticamente. Resultados. De 80 animales evaluados, seis gatos y tres perros fueron casos confirmados de infección natural por SARS-CoV-2. Los animales no presentaron signos clínicos y sus propietarios, que padecían la infección, reportaron únicamente signos leves de la enfermedad sin complicaciones clínicas. En el análisis de una de las secuencias, se encontró un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) con un cambio en la posición 647, con sustitución del aminoácido serina (S) por una isoleucina (I). Los casos se presentaron en los municipios de Caldas, Medellín y Envigado. Conclusiones. Se infiere que la infección natural en los gatos y perros se asocia al contacto directo con un paciente con COVID-19. No obstante, no es posible determinar la virulencia del virus en este huésped, ni su capacidad de transmisión zoonótica o entre especie.

Introduction: The severe acute respiratory syndrome caused by the new coronavirus SARS-CoV-2 is the cause of the health emergency due to the COVID-19 pandemic. Although humans are the main susceptible host, experimental studies and reported cases of natural infection have evidenced scenarios of SARS-CoV-2 reverse zoonosis in animals. Objective: To evaluate the natural infection of SARS-CoV-2 in cats and dogs with owners diagnosed with COVID-19 in the Valle de Aburrá subregion in Antioquia, Colombia. Materials and methods. The circulation of SARS-CoV-2 was evaluated by RT-qPCR and RT-PCR in samples of nasopharyngeal and oropharyngeal smears from cats and dogs whose owners presented latent COVID-19 infection. Positive cases were verified through amplification of N, E and RdRp gene fragments; with the latter being sequenced and the phylogenetically analyzed. Results. From 80 tested animals, 6 cats and 3 dogs resulted positive for natural SARS-CoV-2 infection. These animals did not show any clinical signs; and their infected owners only reported mild signs of COVID-19, without clinical complications. Regarding analysis of one of the sequences, a single nucleotide polymorphism (SNP) was found, with a substitution in position 647, resulting in the change of the amino acid serine (S) for isoleucine (I). The cases occurred in the municipalities of Caldas, Medellín and Envigado. Conclusions. It is inferred that natural infection in cats and dogs is associated with direct contact with a positive COVID-19 patient.

Parámetros del líquido amniótico para diagnóstico de respuesta inflamatoria en parto pretérmino / Amniotic fluid parameters for the diagnosis of inflammatory response in preterm delivery

OBJETIVO: Evaluar el rendimiento del Gram, la glucosa y los leucocitos en líquido amniótico para el diagnóstico de respuesta inflamatoria fetal y materna en pacientes con parto pretérmino. MÉTODO: Estudio de rendimiento de pruebas diagnósticas. Se incluyeron 63 pacientes a quienes se les realizó amniocentesis por sospecha de infección intraamniótica. Se estudió la placenta y se comparó con el Gram, la glucosa y el recuento de leucocitos en líquido amniótico para ver su relación con la respuesta inflamatoria. Se evaluaron la sensibilidad, la especificidad, las razones de verosimilitud (LR, likelihood ratio), los valores predictivos y el valor de kappa. RESULTADOS: Las pruebas con mejor rendimiento fueron en conjunto la glucosa 50/mm3 en líquido amniótico, con una especificidad del 94,3% (intervalo de confianza del 95% [IC95%]: 84,6-98,1), LR + 8,83 (IC95%: 2,5-31,2) y kappa de 0,48 (IC95%: 0,15-0,82). También se consideró la propuesta de un nuevo punto de corte para el recuento de leucocitos en líquido amniótico en la respuesta inflamatoria fetal. CONCLUSIONES: La combinación del recuento de leucocitos en líquido amniótico y los valores de glucosa mejora el rendimiento para el diagnóstico de respuesta inflamatoria fetal en comparación con la histopatología de la placenta, lo que proporciona información útil para el enfoque de los recién nacidos.

OBJECTIVE: To evaluate the performance of Gram, glucose and leukocytes in amniotic fluid for the diagnosis of fetal and maternal inflammatory response in patients with preterm delivery. METHOD: A diagnostic performance test study was carried out. Sixty-three patients with preterm labor were included who underwent amniocentesis due to suspected intra-amniotic infection. Histopathology of the placenta was studied and compared with the Gram result, glucose and leukocyte count in amniotic fluid, and their relationship with the maternal and fetal inflammatory response. Sensitivity, specificity, likelihood ratios, predictive values, and kappa were evaluated. RESULTS: The tests with the best performance were overall glucose 50/mm3 in amniotic fluid for the diagnosis of the fetal inflammatory response, with a specificity of 94.3% (95% confidence interval [95% CI]: 84.6-98.1%), likelihood positive ratio 8.83 (95% CI: 2.5-31.2) and kappa of 0.48 (95% CI: 0.15-0.82). A new cut-off point for leukocyte count in amniotic fluid to diagnose fetal inflammatory response was proposed. CONCLUSIONS: The combination of amniotic fluid leukocyte count and amniotic fluid glucose values improves performance for the diagnosis of inflammatory response compared with placental histopathology, providing useful information for newborns approach.

Aislamiento e identificación de bacterias con potencial nosocomial procedentes de ambientes y superficies de una clínica veterinaria Universitaria del Área Metropolitana del Valle de Aburrá, Antioquia-Colombia / Isolation and identification of bacteria with nosocomial potential from environments and surfaces of a veterinary university clinic of Metropolitan area of Aburra Valley Antioquia-Colombia

Introducción: Las infecciones nosocomiales son aquellas adquiridas por los pacientes durante la hospitalización. Son de gran importancia en medicina humana pero aún se desconoce cuál es su papel en medicina veterinaria. Objetivo: Identificar la presencia de bacterias asociadas a infecciones hospitalarias en ambientes y superficies en una clínica veterinaria. Materiales y métodos: Se realizaron dos muestreos, se determinó a través de sedimentación y torunda la presencia de bacterias en el ambiente y las superficies de las 8 unidades de la clínica veterinaria. La presencia de nosocomiales se determinó por el crecimiento y purificación en medios diferenciales, la identificación se hizo por descripción macroscópica de las colonias y tinción de Gram y posteriormente se realizó una caracterización bioquímicamente por medio del API20E y API50 CH/E y un antibiograma en las cepas relacionadas con resistencia a antibióticos. Resultados: Se obtuvo 95 aislados y se logró determinar la presencia de 28 agentes potencialmente nosocomiales, donde se destaca la presencia de Pseudomonas aeruginosa, Proteus sp. y Staphylococcus sp. microorganismos relacionados con infecciones asociadas a hospitales veterinarios. Conclusiones: Se realiza la primera aproximación a este tipo de infecciones en hospitales veterinarios en Antioquia, y se evidencia la circulación en ambiente y superficies de potenciales bacterias nosocomiales en la clínica veterinaria.

Introduction: Care associated infections are of importance in human medicine but few is known in veterinary medicine. Aims: To identify pathogenic bacteria in surfaces of veterinary clinics. Materials and methods: Two samples with cotton hissops were obtained in inert surfaces from 8 veterinary clinics. The presence of pathogenic bacteria was established by growth in agar media, identification of species was performed through colonies morphology and Gram stain and biochemistry identification with API20E and API50 CH/E system and antibiogram. Results: 95 isolates were characterized and within them 28 were pathogenic. The most prevalent were Pseudomonas aeruginosa, Proteus sp. and Staphylococcus sp. Conclusions: This is the first description of pathogenic microorganisms present in veterinary clinics in Antioquia that have potential for clinical consequences for personnel working at this veterinary centers.

External validation of the relative fat mass (RFM) index in adults from north-west Mexico using different reference methods.

BACKGROUND: Analysis of body composition is becoming increasingly important for the assessment, understanding and monitoring of multiple health issues. The body mass index (BMI) has been questioned as a tool to estimate whole-body fat percentage (FM%). Recently, a simple equation described as relative fat mass (RFM) was proposed by Woolcott & Bergman. This equation estimates FM% using two anthropometric measurements: height and waist circumference (WC). The authors state that due to its simplicity and better performance than BMI, RFM could be used in daily clinical practice as a tool for the evaluation of body composition. The aim of this study was to externally validate the equation of Woolcott & Bergman to estimate FM% among adults from north-west Mexico compared with Dual-energy X-ray absorptiometry (DXA) as an alternative to BMI and secondly, to make the same comparison using air displacement plethysmography (ADP), Bioelectrical Impedance Analysis (BIA) and a 4-compartment model (4C model). METHODS: Weight, height and WC were measured following standard procedures. The RFM index was calculated for each of the 61 participating subjects (29 females and 32 males, ages 20-37 years). The RFM was then regressed against each of the four body composition methods for estimating FM%. RESULTS: Compared with BMI, RFM was a better predictor of FM% determined by each of the body composition methods. In terms of precision the best equation was RFM regressed against DXA (y = 1.12 + 0.99 x; R2 = 0.84 p<0.001). Accuracy (represented by the closeness to the zero-intercept) was 1.12 (95% CI: -2.44, to 4.68) and thus, not significantly different from zero. For the rest of the methods, precision in the prediction of FM% was improved compared to BMI, with significant increases in the R2 and reduction of the root mean squared error (RMSE). However, the intercepts of each regression did not show accuracy since they were different from zero, for ADP: -9.95 (95%CI: -15.7 to -4.14), for BIA: -12.6 (95%CI: -17.5 to -7.74) and for the 4C model: -13.6 (95%CI: -18.6 to -8.60). Irrespectively, FM% measured by each of the body composition methods was higher for DXA than the other three methods (p<0.001). CONCLUSIONS: This external validation proved that the performance of the RFM equation used in this study to estimate FM% was more consistent than BMI in this Mexican population, showing a stronger correlation with DXA than with the other body composition methods.