ABSTRACT
Background: In British Columbia (BC), self-collected saline gargle (SG) is the only alternative to health care provider (HCP)-collected nasopharyngeal (NP) swabs to detect SARS-CoV-2 in an outpatient setting by polymerase chain reaction (PCR). However, some individuals cannot perform a SG. Our study aimed to assess combined throat-bilateral nares (TN) swabbing as a swab-based alternative. Methods: Symptomatic individuals greater than 12 years of age seeking a COVID-19 PCR test at one of two COVID-19 collection centres in Metro Vancouver were asked to participate in this study. Participants provided a HCP-collected NP sample and a self-collected SG and TN sample for PCR testing, which were either HCP observed or unobserved. Results: Three-hundred and eleven individuals underwent all three collections. Compared against HCP-NP, SG was 99% sensitive and 98% specific (kappa 0.97) and TN was 99% sensitive and 99% specific (kappa 0.98). Using the final clinical test interpretation as the reference standard, NP was 98% sensitive and 100% specific (kappa 0.98), and both SG and TN were 99% sensitive and 100% specific (both kappa 0.99). Mean cycle threshold values for each viral target were higher in SG specimens compared to the other sample types; however, this did not significantly impact the clinical performance, because the positivity rates were similar. The clinical performance of all specimen types was comparable within the first 7 days of symptom onset, regardless of the observation method. SG self-collections were rated the most acceptable, followed by TN. Conclusions: TN provides another less invasive self-collection modality for symptomatic outpatient SARS-CoV-2 PCR testing.
Historique: En Colombie-Britannique (C.-B.), l'autoprélèvement de gargarisme d'eau saline (GS) est la seule alternative aux écouvillons nasopharyngés (NP) prélevés par un professionnel de la santé (PdS) pour déceler le SRAS-CoV-2 par test PCR en milieu ambulatoire. Cependant, certaines personnes ne peuvent pas effectuer de GS. La présente étude visait évaluer l'écouvillonnage de la gorge et des deux narines (GN) pour remplacer le GS. Méthodologie: Les personnes symptomatiques de plus de 12 ans qui demandaient un test PCR de la COVID-19 à l'un des deux centres de dépistage de la COVID-19 du Grand Vancouver ont été invitées à participer à la présente étude. Les participants ont fourni un prélèvement NP recueilli par un PdS ainsi qu'un autoprélèvement de GS et GN en vue d'un test PCR, observés ou non par un PdS. Résultats: Au total, 311 personnes ont participé aux trois prélèvements. Par rapport au prélèvement NP-PdS, le GS avait une sensibilité de 99 % et une spécificité de 98 % (kappa 0,97) et le prélèvement GN, une sensibilité de 99 % et une spécificité de 99 % (kappa 0, 98). À l'aide de l'interprétation définitive du test clinique comme norme de référence, le prélèvement NP avait une sensibilité de 98 % et une spécificité de 100 % (kappa 0,98) et tant le GS que le prélèvement GN avaient une sensibilité de 99 % et une spécificité de 100 % (deux kappa 0,99). Les valeurs seuils du cycle moyen de chaque cible virale étaient plus élevées dans les échantillons de GS quand dans les autres types d'échantillons, mais n'avaient pas d'effet significatif sur le rendement clinique, puisque les taux de positivité étaient semblables. Le rendement clinique de tous les types d'échantillons était comparable dans les sept premiers jours suivant l'apparition de la maladie, quel que soit le mode d'observation. L'autoprélèvement de GS a été classé comme le plus acceptable, suivi du prélèvement GN. Conclusions: Le prélèvement GN est un autre mode d'autoprélèvement moins invasif chez les patients ambulatoires symptomatiques qui effectuent un test PCR du SRAS-CoV-2.
ABSTRACT
Bacillus cereus is a ubiquitous spore-forming organism that is infrequently implicated in extraintestinal infections. The authors report three cases of B cereus bacteremia among injection drug users presenting within one month to an urban tertiary care hospital. Treatment with intravenous vancomycin was successful in all three cases. While temporal association suggested an outbreak, molecular studies of patient isolates using pulsed-field gel electrophoresis did not suggest a common source. A review of the association of B cereus infections with heroin use and treatment of this pathogen is provided.
Le Bacillus cereus est un organisme sporulé omniprésent qui est parfois responsable d'infections extra-intestinales. Les auteurs rendent compte de trois cas de bactériémie à B cereus chez des consommateurs de drogue injectable qui ont consulté au cours du même mois dans un hôpital urbain de soins tertiaires. Dans les trois cas, un traitement intraveineux à la vancomycine a donné de bons résultats. L'association temporelle laissait suggérer une éclosion, mais des études moléculaires d'isolats de patients par électrophorèse en champ pulsé n'évoquaient pas une source commune. Les chercheurs proposent une analyse de l'association des infections à B cereus à la consommation d'héroïne et du traitement de cet agent pathogène.
ABSTRACT
BACKGROUND: Serogroup C meningococcal disease has been endemic in Canada since the early 1990s, with periods of hyperendemic disease documented in the past two decades. The present study characterized invasive serogroup C meningococci in Canada during the period from 2002 to 2009. METHODS: Serogroup C meningococci were serotyped using monoclonal antibodies. Their clonal types were identified by either multilocus enzyme electrophoresis or multilocus sequence typing. RESULTS: The number of invasive serogroup C Neisseria meningitidis isolates received at the National Microbiology Laboratory (Winnipeg, Manitoba) for characterization has dropped from a high of 173 isolates in 2001 to just 17 in 2009, possibly related to the introduction of the serogroup C meningococcal conjugate vaccine. Before 2006, 80% to 95% of all invasive serogroup C meningococci belonged to the electrophoreic type (ET)-15 clonal type, and the ET-37 (but not ET-15) type only accounted for up to 5% of all isolates. However, beginning in 2006, the percentage of the ET-15 clonal type decreased while the ET-37 (but not ET-15) type increased from 27% in 2006 to 52% in 2009. The percentage of invasive serogroup C isolates not belonging to either ET-15 or ET-37 also increased. Most ET-15 isolates expressed the antigenic formula of C:2a:P1.7,1 or C:2a:P1.5. In contrast, the ET-37 (but not ET-15) isolates mostly expressed the antigens of C:2a:P1.5,2 or C:2a:P1.2. CONCLUSION: A shift in the antigenic and clonal type of invasive serogroup C meningococi was noted. This finding suggests vigilance in the surveillance of meningoccocal disease is warranted.
HISTORIQUE: La maladie à méningocoque du sérogroupe C est endémique au Canada depuis le début des années 1990, des périodes de maladie hyperendémique étant attestées depuis vingt ans. La présente étude caractérise des groupes de méningocoques invasifs du sérogroupe C au Canada entre 2002 et 2009. MÉTHODOLOGIE: Les chercheurs ont sérotypé les méningocoques du sérogroupe C au moyen d'anticorps monoclonaux. Ils ont déterminé leur groupe clonal par électrophorèse d'enzyme multilocus ou par typage séquentiel multilocus. RÉSULTATS: Le nombre d'isolats de Neisseria meningitidis invasifs du sérogroupe C envoyés au National Microbiology Laboratory de Winnipeg, au Manitoba, en vue de leur caractérisation a fléchi d'un pic de 173 isolats en 2001 à seulement 17 en 2009, peut-être en raison de l'adoption du vaccin conjugué contre le méningocoque du sérogroupe C. Avant 2006, de 80 % à 95 % de tous les méningocoques invasifs du sérogroupe C appartenaient au groupe clonal du type électrophorétique ET-15, et l'ET-37 (mais pas l'ET-15) ne représentait que jusqu'à 5 % de tous les isolats. Cependant, à compter de 2006, le pourcentage de groupe clonal ET-15 a diminué, tandis que l'ET-37 (mais pas l'ET-15) est passé de 27 % en 2006 à 52 % en 2009. Le pourcentage d'isolats invasifs du sérogroupe C n'appartenant ni à l'ET-15 ni à l'ET-37 a également augmenté. La plupart des isolats d'ET-15 exprimaient la formule antigénique C:2a:P1.7,1 ou C:2a:P1.5. Par contre, les isolats d'ET-37 (mais pas d'ET-15) exprimaient surtout les antigènes C:2a:P1.5,2 ou C:2a:P1.2. CONCLUSION: Les chercheurs ont remarqué une transition du groupe antigénique et clonal des méningocoques invasifs du sérogroupe C. En raison de cette observation, il serait judicieux d'être vigilant en matière de surveillance de la maladie à méningocoque.
