ABSTRACT
1. The aim of the present study was to determine if the 9R-strain of the Salmonella Gallinarum live vaccine was responsible for having fowl typhoid outbreaks in chicken flocks from both chicken and turkey breeders as well as to verify the antimicrobial resistance of the isolates from the outbreaks. 2. The triplex polymerase chain reaction, standard antimicrobial test, beta-lactamase genes identification and Ion Torrent PMG whole-genome sequence were used in the field isolates and in the vaccine strain of S. Gallinarum. 3. The 60 tested isolates were not from vaccine origin and manifested high resistance to drugs from macrolide and quinolone groups. Whole-genome sequencing (WGS) and single nucleotide polymorphism analysis on selected isolates for core genes from Salmonella enterica confirmed the wild origin of these isolates and showed two possible sources of S. Gallinarum in the studied outbreaks. 4. S. Gallinarum isolated from fowl typhoid outbreaks in the studied period were not caused by the use of the SG9R live vaccine. The source of strains sequenced was diverse.
Subject(s)
Chickens , Drug Resistance, Bacterial , Genome, Bacterial , Poultry Diseases/epidemiology , Salmonella Infections, Animal/epidemiology , Salmonella enterica/physiology , Turkeys , Animals , Brazil/epidemiology , Phylogeny , Polymorphism, Single Nucleotide , Poultry Diseases/microbiology , Salmonella Infections, Animal/microbiology , Salmonella Vaccines/analysis , Salmonella enterica/classification , Salmonella enterica/genetics , Sequence Alignment/veterinary , Vaccines, Attenuated/analysis , Whole Genome Sequencing/veterinaryABSTRACT
Relata-se a quantificação de PCV-2, por meio de PCR em tempo real, no trato gastrintestinal, linfonodo mesentérico, tonsilas e fezes de nove suínos refugo da fase de crescimento, provenientes de rebanhos com histórico de diarreia não responsiva ao tratamento com antibioticoterapia. Com base nos resultados histopatológicos e imunoistoquímicos, os animais foram classificados como afetados por PCV-2 (n=5) e não afetados (n=4). Foi observada diarreia em todos os animais do grupo afetado por PCV-2. Em todas as amostras testadas foi detectado PCV-2, no entanto, a carga viral observada nos tecidos, bem como a excreção nas fezes foi significantemente maior (P<0.01) nos animais com diarreia. A maior concentração de PCV-2 foi observada nos linfonodos mesentéricos. A carga viral observada em tecido fresco e nas mesmas amostras emblocadas em parafina foi semelhante, sugerindo que o PCR em tempo real pode ser uma ferramenta útil em estudos retrospectivos da infecção por PCV-2.
